結(jié)核分枝桿菌Rv3134c蛋白抗原表位的預(yù)測
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【摘要】:目的預(yù)測結(jié)核分枝桿菌Rv3134c的抗原表位,了解其免疫學(xué)特性。方法利用DNAStar軟件包中Protean軟件對Rv3134c氨基酸序列進(jìn)行分析,采用包括二級結(jié)構(gòu)、親水性、抗原性、表面可能性、柔韌性等多參數(shù)預(yù)測其二級結(jié)構(gòu)及T細(xì)胞和B細(xì)胞抗原表位,最后BLAST分析其與人類抗原表位的同源性。結(jié)果 Rv3134c蛋白具有豐富的二級結(jié)構(gòu)和多處抗原指數(shù)較高的區(qū)段,含有較多潛在的B細(xì)胞抗原表位,可能位于1-7、30-37、65-81、89-100、111-120、138-148、184-195、209-216、233-238位氨基酸殘基或其附近,這些區(qū)域基本上含有β轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu),親水性、表面可能性和柔韌性指數(shù)都較高。該蛋白潛在的T細(xì)胞抗原表位較少,可能位于62-76、89-97、185-195、203-213、219-231、248-255位氨基酸殘基或其附近。BLAST分析結(jié)果顯示,其與人類抗原表位的同源性很低。結(jié)論結(jié)核分枝桿菌Rv3134c是一個即含有較多B細(xì)胞抗原表位又含有較多T細(xì)胞抗原表位的蛋白抗原,實(shí)驗結(jié)果為該蛋白抗原表位的進(jìn)一步研究與合成肽疫苗奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】: 解放軍第309醫(yī)院全軍結(jié)核病研究所;全軍結(jié)核病防治重點(diǎn)實(shí)驗室 結(jié)核病診療新技術(shù)北京市重點(diǎn)實(shí)驗室;解放軍第309醫(yī)院呼吸科;
【關(guān)鍵詞】: 結(jié)核分枝桿菌 Rvc蛋白 抗原表位 二級結(jié)構(gòu) 預(yù)測
【基金】:國家重大傳染病防治科技重大專項基金資助項目(No.2012ZX10003008002) 軍隊醫(yī)學(xué)科技“十二五”重點(diǎn)項目(No.BWS11J050) 北京市科技創(chuàng)新基地培育與發(fā)展工程專項項目(No.Z141107004414021)~~
【分類號】:R378.911
【正文快照】: (1.Army Tuberculosis Control and Prevention Key Laboratory/Beijing Key Laboratory of Tuberculosis New Diagnosisand Treatment Technology/Institute of Tuberculosis Research,Beijing100091,China;2.Department of Respiratory Medicine,the 309th Hospital of Chin
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,本文編號:415714
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