目的構建Mindin低表達的Huh7細胞并對其進行轉錄組學研究,以探索Mindin的生物學作用。方法設計并合成Mindin干擾序列,通過慢病毒載體GV248將其導入Huh7細胞,實時定量PCR檢測對Mindin轉錄水平的抑制效果,獲得Mindin低表達Huh7細胞并對該細胞及其對照細胞進行轉錄組學研究,生物信息學分析表達異�；�,Pathway分析Mindin可能參與的生物學功能。計量資料2組間比較采用t檢驗。結果與對照細胞相比,含干擾序列的慢病毒感染Huh7細胞后,其Mindin mRNA的敲減效率為63. 8%(P=0. 003)。Mindin穩(wěn)定低表達的Huh7細胞遷移率明顯高于對照細胞(3. 511±0. 538 vs 1. 701±0. 765,t=-3. 355,P=0. 03)。與對照細胞相比,Mindin低表達Huh7細胞有2888個上調基因,2516個下調基因。取滿足∣log2FC∣> 2. 0且P <0. 05的895個差異表達基因進行GO分析和Pathway分析。Pathway分析排名前10位的Mindin參與的生物學功能依次為:腫瘤信號通路、趨化因子...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 主要材料和試劑
    1.2 實驗方法
        1.2.1 慢病毒感染Huh7細胞分組
        1.2.2 敲減效率檢測
        1.2.3 Transwell檢測細胞遷移能力
        1.2.4 基因芯片檢測與生信分析
    1.3 統(tǒng)計學方法
2 結果
    2.1 慢病毒感染效率鑒定
    2.2 3條干擾序列敲減效率篩選
    2.3 Mindin低表達的Huh7細胞遷移能力
    2.4 基因芯片檢測與分析
3 討論



本文編號：3948403