目的構(gòu)建Mindin低表達(dá)的Huh7細(xì)胞并對其進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究,以探索Mindin的生物學(xué)作用。方法設(shè)計并合成Mindin干擾序列,通過慢病毒載體GV248將其導(dǎo)入Huh7細(xì)胞,實時定量PCR檢測對Mindin轉(zhuǎn)錄水平的抑制效果,獲得Mindin低表達(dá)Huh7細(xì)胞并對該細(xì)胞及其對照細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究,生物信息學(xué)分析表達(dá)異常基因,Pathway分析Mindin可能參與的生物學(xué)功能。計量資料2組間比較采用t檢驗。結(jié)果與對照細(xì)胞相比,含干擾序列的慢病毒感染Huh7細(xì)胞后,其Mindin mRNA的敲減效率為63. 8%(P=0. 003)。Mindin穩(wěn)定低表達(dá)的Huh7細(xì)胞遷移率明顯高于對照細(xì)胞(3. 511±0. 538 vs 1. 701±0. 765,t=-3. 355,P=0. 03)。與對照細(xì)胞相比,Mindin低表達(dá)Huh7細(xì)胞有2888個上調(diào)基因,2516個下調(diào)基因。取滿足∣log2FC∣> 2. 0且P <0. 05的895個差異表達(dá)基因進(jìn)行GO分析和Pathway分析。Pathway分析排名前10位的Mindin參與的生物學(xué)功能依次為:腫瘤信號通路、趨化因子...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 主要材料和試劑
    1.2 實驗方法
        1.2.1 慢病毒感染Huh7細(xì)胞分組
        1.2.2 敲減效率檢測
        1.2.3 Transwell檢測細(xì)胞遷移能力
        1.2.4 基因芯片檢測與生信分析
    1.3 統(tǒng)計學(xué)方法
2 結(jié)果
    2.1 慢病毒感染效率鑒定
    2.2 3條干擾序列敲減效率篩選
    2.3 Mindin低表達(dá)的Huh7細(xì)胞遷移能力
    2.4 基因芯片檢測與分析
3 討論



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