幽門螺桿菌23srRNA基因突變與克拉霉素耐藥性關(guān)系的研究
本文關(guān)鍵詞:幽門螺桿菌23srRNA基因突變與克拉霉素耐藥性關(guān)系的研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的通過(guò)對(duì)幽門螺桿菌(Helicobacter pylori, HP)23s rRNA基因突變位點(diǎn)分析,觀察23s rRNA各突變點(diǎn)與克拉霉素耐藥的關(guān)系。 方法分離培養(yǎng)HP、提取DNA、擴(kuò)增其23s rRNA基因片段及測(cè)序;運(yùn)用Clustal W軟件進(jìn)行序列比對(duì)找出突變點(diǎn)。選用GenBank中已全基因組測(cè)序的35株HP,根據(jù)其mutY、ppa、efp和urel4個(gè)管家基因建立Neighbour-joining樹,根據(jù)進(jìn)化樹結(jié)果將35株HP分為歐非和東亞菌群;觀察各突變點(diǎn)與菌群分布的關(guān)系。 結(jié)果與耐藥有關(guān)的A2143G突變率為32.8%,T2182C突變率為90.6%但與耐藥無(wú)關(guān),其堿基分布具有菌群差異:東亞菌群以C堿基為主,歐非菌群以T為主(P0.05),其他可能與耐藥有關(guān)的各位點(diǎn)分別為A2223G(6.25%)、T2190C(1.6%)、C2195T(1.6%)。 結(jié)論青島地區(qū)HP克拉霉素耐藥率為32.8%并表現(xiàn)為23s rRNA基因A2143G突變,而2182位點(diǎn)突變是由于菌群分布差異導(dǎo)致的與克拉霉素耐藥無(wú)關(guān)。
【關(guān)鍵詞】:幽門螺桿菌 克拉霉素 耐藥 23s rRNA
【學(xué)位授予單位】:青島大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:R378.2;Q75
【目錄】:
- 中文摘要2-3
- Abstract3-5
- 引言5-6
- 第一章 材料和方法6-10
- 1.1 材料6
- 1.1.1 主要試劑6
- 1.1.2 主要儀器6
- 1.2 實(shí)驗(yàn)方法6-10
- 1.2.1 標(biāo)本收集6
- 1.2.2 HP培養(yǎng)及鑒定6-7
- 1.2.3 HP基因組DNA的提取7-8
- 1.2.4 23s rRNA基因擴(kuò)增及測(cè)序8
- 1.2.4.1 擴(kuò)增目的片段8
- 1.2.4.2 凝膠電泳檢測(cè)目的條帶8
- 1.2.4.3 基因測(cè)序8
- 1.2.5 建立進(jìn)化樹8-9
- 1.2.6 序列分析9
- 1.2.7 統(tǒng)計(jì)分析9-10
- 第二章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果10-16
- 2.1 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物及測(cè)序結(jié)果10-11
- 2.2 23s rRNA基因各突變位點(diǎn)及分布11-13
- 2.3 35株HP建立進(jìn)化樹及菌群分布13-14
- 2.4 突變位點(diǎn)與菌群分布的關(guān)系14-16
- 第三章 討論16-18
- 第四章 結(jié)論18-19
- 參考文獻(xiàn)19-22
- 綜述22-35
- 參考文獻(xiàn)30-35
- 攻讀學(xué)位期間的研究成果35-36
- 致謝36-37
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