本文關(guān)鍵詞：廣東人群SLC25A13基因高頻突變的熔解曲線分析法篩查，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：背景和目的Citrin缺陷病(Citrin deficiency, CD)是SLC25A13基因突變導(dǎo)致的常染色體隱性遺傳病，而Citrin缺陷導(dǎo)致的新生兒肝內(nèi)膽汁淤積癥(NeonatalIntrahepatic Cholestasis caused by Citrin Deficiency, NICCD,#605814)是當(dāng)前CD主要的兒科臨床表型。本課題組先前的研究發(fā)現(xiàn)，我國(guó)NICCD患者SLC25A13基因高頻突變?yōu)?51_854del, IVS6+5GA,1638_1660dup, IVS16ins3kb,和g.1399CT，但廣東人群中這些突變類型的攜帶率有待深入研究。熔解曲線分析是近幾年發(fā)展起來(lái)的一種方便、準(zhǔn)確、快速的SLC25A13基因突變篩查方法。本研究旨在應(yīng)用熔解曲線分析法對(duì)廣東人群SLC25A13基因高頻突變進(jìn)行篩查，為計(jì)算該人群的高頻突變攜帶率及CD患病率提供分子流行病學(xué)數(shù)據(jù)。 對(duì)象和方法收集2011年4月至2013年3月期間廣東省不同城市常住健康體檢者血樣2428份，其中珠三角地區(qū)廣州599份，深圳306份，中山240份，惠州190份，佛山223份；珠三角外周地區(qū)梅州213份，河源197份，湛江260份，清遠(yuǎn)200份。應(yīng)用全血DNA試劑盒提取血樣DNA，然后應(yīng)用熔解曲線分析方法對(duì)SLC25A13基因高頻突變進(jìn)行篩查。根據(jù)攜帶者數(shù)量和篩查標(biāo)本數(shù)量計(jì)算高頻突變的攜帶率，再根據(jù)Hardy－Weinberg定律計(jì)算廣東人群的CD理論患病率。按照標(biāo)本來(lái)源地分組，以P0.05為顯著性標(biāo)準(zhǔn)，應(yīng)用卡方檢驗(yàn)比較不同城市人群高頻突變攜帶率的差異。 結(jié)果1.本研究共篩查到52個(gè)SLC25A13基因突變攜帶者，其中851_854del攜帶者41人, IVS6+5GA攜帶者5人,1638_1660dup攜帶者2人, IVS16ins3kb攜帶者2人,另外發(fā)現(xiàn)新突變g.1420GA (V474M)攜帶者2人,但未發(fā)現(xiàn)g.1399CT突變攜帶者。2.廣東人群SLC25A13高頻基因突變攜帶率為1/47(52/2428)，理論患病率為1/8800。其中珠三角地區(qū)人群高頻突變攜帶率為1/60(26/1558)，理論患病率為1/14400，而珠三角外周人群高頻突變攜帶率為1/33(26/870)，理論患病率為1/4400。3.按照篩查標(biāo)本來(lái)源城市統(tǒng)計(jì)，廣州、深圳、佛山、惠州、中山、梅州、河源、湛江和清遠(yuǎn)人群的SLC25A13高頻突變攜帶率分別為1/54，1/61，1/56，1/95，1/60，1/107，1/20、1/33和1/33，而根據(jù)Hardy－Weinberg定律推算，以上各城市人群CD理論患病率分別為1/11700，1/14800，1/12500，1/36100，1/14400，，1/45800，1/1600、1/4400和1/4400。 4.珠三角地區(qū)與珠三角外圍地區(qū)人群SLC25A13基因高頻突變攜帶率的差異具有顯著性意義，珠三角外圍地區(qū)高于珠三角地區(qū)（2=4.639，P0.05）。珠三角外圍城市河源的人群SLC25A13基因高頻突變攜帶率高于珠三角大部分城市(其中廣州與河源：2=6.058，P0.05，深圳與河源：2=4.908，P0.05，惠州與河源：2=5.211，P0.05，中山與河源：2=4.056，P0.05)。河源與同樣為珠三角外周城市的梅州比較，其SLC25A13基因高頻突變攜帶率的差異具有顯著性意義(2=6.166，P0.05)，但與湛江、清遠(yuǎn)比較，SLC25A13基因高頻突變攜帶率的差異無(wú)顯著性意義(其中河源與湛江：2=1.184，P0.05，河源與清遠(yuǎn)：2=1.106，P0.05)。珠三角各城市之間人群的SLC25A13基因高頻突變攜帶率均不存在顯著性差異。 結(jié)論1.熔解曲線分析方法是一種方便、準(zhǔn)確、快速的SLC25A13基因突變篩查方法，而且有助于發(fā)現(xiàn)新的基因突變類型。而突變g.1420GA(p.V474M)的發(fā)現(xiàn)進(jìn)一步擴(kuò)展了SLC25A13基因的突變譜。2.廣東省珠三角外周地區(qū)人群的SLC25A13基因高頻突變攜帶率高于珠三角地區(qū)。3.按照本文篩查結(jié)果和最新人口統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)推算，廣東省現(xiàn)有CD患者至少為11800人，其診斷治療值得重視。4.本研究通過(guò)較大樣本量的SLC25A13基因高頻突變調(diào)查，為廣東人群CD危害評(píng)估提供了初步的分子流行病學(xué)數(shù)據(jù)。
【關(guān)鍵詞】：Citrin缺陷病 SLC25A13基因 高頻突變 熔解曲線分析
【學(xué)位授予單位】：暨南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2013
【分類號(hào)】：R394
【目錄】：

• 中文摘要3-5
• Abstract5-7
• 目錄7-8
• 1 前言8-12
• 2 研究對(duì)象與材料12-14
• 2.1 研究對(duì)象12
• 2.2 主要試劑12-13
• 2.3 主要實(shí)驗(yàn)儀器13-14
• 3 研究方法14-20
• 3.1 基因組 DNA 提取14-15
• 3.2 應(yīng)用熔解曲線分析方法進(jìn)行 SLC25A13 基因高頻突變篩查15-18
• 3.3 廣東不同地區(qū) SLC25A13 基因高頻突變攜帶率和理論患病率18-20
• 4 結(jié)果20-28
• 4.1 對(duì)熔解曲線分析方法診斷 Citrin 缺陷病的評(píng)價(jià)20-21
• 4.2 廣東地區(qū) SLC25A13 基因高頻突變篩查結(jié)果21-25
• 4.3 廣東地區(qū) SLC25A13 基因高頻突變攜帶率及理論患病率25-26
• 4.4 SLC25A13 基因高頻突變攜帶率地區(qū)分布比較26-28
• 5 討論28-32
• 5.1 熔解曲線分析是一種高效的 SLC25A13 基因突變篩查工具28-29
• 5.2 SLC25A13 基因高頻突變篩查結(jié)果29-30
• 5.3 SLC25A13 基因高頻突變攜帶率及其地理分布特征30-31
• 5.4 應(yīng)用熔解曲線分析進(jìn)行 SLC25A3 基因高頻突變篩查意義31-32
• 6 結(jié)論32-33
• 7 參考文獻(xiàn)33-40
• 主要縮略詞中英對(duì)照表40-41
• 在校期間發(fā)表文章及摘要情況41-42
• 致謝42

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前6條

1 宋元宗;郭麗;楊艷玲;韓連書(shū);小林圭子;佐伯武賴;;Citrin缺陷導(dǎo)致的生長(zhǎng)發(fā)育落后和血脂異常:一種新的臨床表現(xiàn)型[J];中國(guó)當(dāng)代兒科雜志;2009年05期

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  本文關(guān)鍵詞：廣東人群SLC25A13基因高頻突變的熔解曲線分析法篩查，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號(hào)：377315