現在人類已經鑒定了超過5000種類型的病毒。某些病毒可直接引起人類疾病，如流感、水痘，以及天花、艾滋病、SARS和禽流感等嚴重疾病，另外還有一些病毒可作為某些疾病的誘發(fā)因子，如皰疹病毒6型可引起一些神經性疾病，某些病毒可能引起人的慢性疲勞綜合征。近年來隨著新一代測序技術的發(fā)展，越來越多的病毒基因組被測序，截止2013年3月，NCBI上已發(fā)表的病毒基因組已有3251種。如何利用先進的生物信息學技術分析這些已經發(fā)表的海量病毒基因組資源，從而更科學地研究病毒的進化及鑒定分型是我們迫切需要解決的問題。本研究應用最新的貝葉斯-馬科夫鏈的分子進化方法對測序麻疹病毒N基因進行分子進化分析，同時應用基于基因組信息挖掘的基因組條形碼技術對腸道病毒進行鑒定與分類，從而將生物信息學技術與病毒學進行交叉融合，為傳統微生物學研究技術難以解決的病毒進化及鑒定分型提供嶄新的研究視角，并為更好地理解病毒性疾病的發(fā)生與發(fā)展做出貢獻。 第一部分基于貝葉斯-馬科夫鏈的麻疹病毒分子進化研究 麻疹病毒（measles virus，MV）屬于副粘病毒科麻疹病毒屬，具有高度的傳染性，感染人體后可引起麻疹及嚴重的并發(fā)癥，包括巨細胞肺...

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【學位級別】：博士

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中文摘要
Abstract
第一章 引言
    1.1 生物信息學
        1.1.1 生物信息學概述
        1.1.2 生物信息學研究的主要內容
    1.2 生物信息學在病毒領域的應用
        1.2.1 后基因組病毒學
        1.2.2 病毒抗原表位預測
        1.2.3 病毒宏基因組學研究
    1.3 本研究的目的
第二章 基于貝葉斯推測方法的麻疹病毒的進化研究
    2.1 引言
        2.1.1 麻疹病毒概述及基因組特征
        2.1.2 麻疹病毒株的基因型
        2.1.3 系統發(fā)育及重建方法
        2.1.4 貝葉斯推斷方法的特點及優(yōu)勢
    2.2 吉林省 16 株代表性麻疹病毒及所有學術發(fā)表 N 基因的系統進化分析
        2.2.1 材料
        2.2.2 實驗方法
        2.2.3 結果
        2.2.4 討論
第三章 基于基因組條形碼技術的腸道病毒的分類與分型
    3.1 引言
        3.1.1 腸道病毒基因組的特征與分類
        3.1.2 基因樹沖突與系統發(fā)育基因組學研究
        3.1.3 系統發(fā)育基因組學
        3.1.4 基因組條形碼技術
    3.2 基于基因組條形碼技術的腸道病毒的分類與分型
        3.2.1 數據及方法
        3.2.2 結果
        3.2.3 討論
第四章 結論
參考文獻
附錄
作者簡介及在學期間所取得的科研成果
致謝



本文編號：3772421