現(xiàn)在人類已經(jīng)鑒定了超過(guò)5000種類型的病毒。某些病毒可直接引起人類疾病，如流感、水痘，以及天花、艾滋病、SARS和禽流感等嚴(yán)重疾病，另外還有一些病毒可作為某些疾病的誘發(fā)因子，如皰疹病毒6型可引起一些神經(jīng)性疾病，某些病毒可能引起人的慢性疲勞綜合征。近年來(lái)隨著新一代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，越來(lái)越多的病毒基因組被測(cè)序，截止2013年3月，NCBI上已發(fā)表的病毒基因組已有3251種。如何利用先進(jìn)的生物信息學(xué)技術(shù)分析這些已經(jīng)發(fā)表的海量病毒基因組資源，從而更科學(xué)地研究病毒的進(jìn)化及鑒定分型是我們迫切需要解決的問(wèn)題。本研究應(yīng)用最新的貝葉斯-馬科夫鏈的分子進(jìn)化方法對(duì)測(cè)序麻疹病毒N基因進(jìn)行分子進(jìn)化分析，同時(shí)應(yīng)用基于基因組信息挖掘的基因組條形碼技術(shù)對(duì)腸道病毒進(jìn)行鑒定與分類，從而將生物信息學(xué)技術(shù)與病毒學(xué)進(jìn)行交叉融合，為傳統(tǒng)微生物學(xué)研究技術(shù)難以解決的病毒進(jìn)化及鑒定分型提供嶄新的研究視角，并為更好地理解病毒性疾病的發(fā)生與發(fā)展做出貢獻(xiàn)。 第一部分基于貝葉斯-馬科夫鏈的麻疹病毒分子進(jìn)化研究 麻疹病毒（measles virus，MV）屬于副粘病毒科麻疹病毒屬，具有高度的傳染性，感染人體后可引起麻疹及嚴(yán)重的并發(fā)癥，包括巨細(xì)胞肺...

【文章頁(yè)數(shù)】：94 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
中文摘要
Abstract
第一章 引言
    1.1 生物信息學(xué)
        1.1.1 生物信息學(xué)概述
        1.1.2 生物信息學(xué)研究的主要內(nèi)容
    1.2 生物信息學(xué)在病毒領(lǐng)域的應(yīng)用
        1.2.1 后基因組病毒學(xué)
        1.2.2 病毒抗原表位預(yù)測(cè)
        1.2.3 病毒宏基因組學(xué)研究
    1.3 本研究的目的
第二章 基于貝葉斯推測(cè)方法的麻疹病毒的進(jìn)化研究
    2.1 引言
        2.1.1 麻疹病毒概述及基因組特征
        2.1.2 麻疹病毒株的基因型
        2.1.3 系統(tǒng)發(fā)育及重建方法
        2.1.4 貝葉斯推斷方法的特點(diǎn)及優(yōu)勢(shì)
    2.2 吉林省 16 株代表性麻疹病毒及所有學(xué)術(shù)發(fā)表 N 基因的系統(tǒng)進(jìn)化分析
        2.2.1 材料
        2.2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.3 結(jié)果
        2.2.4 討論
第三章 基于基因組條形碼技術(shù)的腸道病毒的分類與分型
    3.1 引言
        3.1.1 腸道病毒基因組的特征與分類
        3.1.2 基因樹(shù)沖突與系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)研究
        3.1.3 系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)
        3.1.4 基因組條形碼技術(shù)
    3.2 基于基因組條形碼技術(shù)的腸道病毒的分類與分型
        3.2.1 數(shù)據(jù)及方法
        3.2.2 結(jié)果
        3.2.3 討論
第四章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
作者簡(jiǎn)介及在學(xué)期間所取得的科研成果
致謝



本文編號(hào)：3772421