針對結(jié)核桿菌泛酸合成酶的虛擬篩選
發(fā)布時間:2017-05-17 03:09
本文關(guān)鍵詞:針對結(jié)核桿菌泛酸合成酶的虛擬篩選,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:結(jié)核病是由結(jié)核桿菌引起的傳染性疾病,結(jié)核桿菌一般在巨噬細胞內(nèi)進入潛伏期而躲避人類免疫系統(tǒng)并影響藥物的療效,F(xiàn)有臨床抗結(jié)核藥物只涵蓋結(jié)核桿菌的部分生存機制,未能滿足患者的治療需求,且由于耐藥菌株的出現(xiàn)及流行,有必要研發(fā)新作用機制的抗結(jié)核藥物,來治療或殺滅敏感型或耐藥性以及處于潛伏期的結(jié)核桿菌。隨著結(jié)核桿菌全基因組測序的完成以及結(jié)構(gòu)生物學(xué)的發(fā)展,為確立新作用靶點并進行抗結(jié)核藥物合理設(shè)計帶來了新的機遇。利用計算機虛擬篩選技術(shù)對新發(fā)現(xiàn)的潛在藥物靶標開展研究,人們已經(jīng)獲得了許多抗結(jié)核活性化合物。其中,以酶為靶點的抗結(jié)核藥物研發(fā)已經(jīng)成為該領(lǐng)域的研究熱點。本研究選擇結(jié)核桿菌泛酸合成酶(pantothenate synthetase, PS)進行基于受體結(jié)構(gòu)的虛擬篩選。泛酸合成酶負責合成的泛酸是輔酶A和;d體蛋白的重要合成前體。由于泛酸合成酶在人體內(nèi)不存在且輔酶A和;d體蛋白是結(jié)核桿菌生長的必需的輔助因子,因此泛酸合成酶是開發(fā)新的抗結(jié)核藥物的潛在理想靶點。本學(xué)位論文利用Glide對接篩選軟件和Specs小分子數(shù)據(jù)庫對結(jié)核桿菌泛酸合成酶進行虛擬篩選,根據(jù)小分子與泛酸合成酶的相互作用特征及ADMET和類藥性質(zhì),挑選出33個具有潛在活性的化合物進行實驗測試。本研究利用虛擬篩選技術(shù)發(fā)現(xiàn)結(jié)核桿菌泛酸合成酶的一些具有新穎結(jié)構(gòu)的潛在活性化合物,,可供后期進行結(jié)構(gòu)優(yōu)化改造,以期發(fā)現(xiàn)新型抗結(jié)核藥物。
【關(guān)鍵詞】:結(jié)核桿菌 泛酸合成酶 藥物設(shè)計 虛擬篩選 抑制劑
【學(xué)位授予單位】:南昌大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號】:R378.911
【目錄】:
- 摘要3-4
- ABSTRACT4-6
- 第1章 引言6-10
- 第2章 虛擬篩選方法及軟件簡介10-18
- 2.1 虛擬篩選方法簡介10-13
- 2.2 對接程序 Glide 簡介13-18
- 第3章 針對結(jié)核桿菌泛酸合成酶的虛擬篩選18-36
- 3.1 結(jié)核桿菌泛酸合成酶及其抑制劑簡介18-24
- 3.1.1 結(jié)核桿菌泛酸合成酶 (MTB-PS)簡介18-20
- 3.1.2 泛酸合成酶 (MTB-PS)晶體結(jié)構(gòu)20-22
- 3.1.3 泛酸合成酶 (MTB-PS)抑制劑報道22-24
- 3.2 Glide 對泛酸合成酶的虛擬篩選24-36
- 3.2.1 晶體結(jié)構(gòu)復(fù)合物 1N2H 的驗證對接24-27
- 3.2.2 Decoys 驗證 1N2H 對接模型27-29
- 3.2.3 Glide 對 1N2H 模型的 Specs 數(shù)據(jù)庫篩選29-36
- 第4章 結(jié)論36-39
- 致謝39-40
- 參考文獻40-47
- 攻讀學(xué)位期間的研究成果47-48
- 綜述48-66
- 參考文獻62-66
本文關(guān)鍵詞:針對結(jié)核桿菌泛酸合成酶的虛擬篩選,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:372425
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