樹鼩BACE1全長(zhǎng)編碼序列的克隆及分子特征分析
發(fā)布時(shí)間:2022-07-03 18:56
目的獲取樹鼩β-淀粉樣前體蛋白切割酶BACE1 (beta-site APP cleaving enzyme-1)的全長(zhǎng)編碼序列并進(jìn)行分子特征分析,為開展AD疾病的機(jī)制研究提供依據(jù)。方法提取樹鼩大腦及其他臟器組織總RNA,通過RACE (rapid-amplification of cDNA ends)實(shí)驗(yàn)得到的序列與中間序列進(jìn)行拼接得到樹鼩BACE1全長(zhǎng)編碼序列,使用DNAMAN、MEGA 10.0.5、PyMOL等生物信息學(xué)軟件,對(duì)其序列和分子特征進(jìn)行分析。結(jié)果樹鼩BACE1除在腦組織表達(dá)外,在外周組織也有表達(dá)。樹鼩BACE1核酸序列和蛋白質(zhì)分子整體結(jié)構(gòu)與人類高度相似,樹鼩與人類的BACE1蛋白在膜內(nèi)結(jié)構(gòu)區(qū)均存在一個(gè)高度保守的DXXLL的ACDL分選內(nèi)吞基序,兩者具有相同的胞外域、跨膜域及胞內(nèi)域,但樹鼩BACE1蛋白質(zhì)相比人少一個(gè)潛在的乙;稽c(diǎn),并且在折疊結(jié)構(gòu)上存在差異。結(jié)論本研究獲得樹鼩BACE1基因完整編碼序列,其蛋白基本結(jié)構(gòu)與人的基本相似,提示樹鼩可能是作為研究AD病理改變或藥物研究潛在的理想模型。
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 樹鼩BACE1的分子克隆
(一) BACE1引物設(shè)計(jì)
(二) RNA與cDNA制備
(三) 普通PCR
(四) 3’RACE巢式PCR
(五) 5’RACE巢式PCR
(六) 測(cè)序
1.2.2 序列分析
1.2.3 BACE1的表達(dá)模式分析
(一) RNA相對(duì)表達(dá)定量
(二) Western blotting
2 結(jié)果
2.1 RACE 結(jié)果與序列分析
2.2 樹鼩BACE1氨基酸序列的分析
2.3 BACE1蛋白三維結(jié)構(gòu)分析
2.4 樹鼩BACE1基因在不同年齡段腦組織的表達(dá)分析
2.5 樹鼩BACE1蛋白的表達(dá)模式分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]老年癡呆癥的早期干預(yù)探討[J]. 曹樹春,呂恒剛. 解放軍預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2019(02)
[2]樹鼩在人類疾病動(dòng)物模型中應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 黃曉燕,徐娟,孫曉梅,代解杰. 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物科學(xué). 2013(02)
[3]顳葉和額葉癲癇認(rèn)知功能特點(diǎn)的研究[J]. 楊二娟,毓青,白學(xué)軍,陳英,楊衛(wèi)東,陳旨娟,郭華愛. 天津醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(01)
[4]大腦枕葉語言功能的研究進(jìn)展[J]. 方環(huán)海,王梅. 中國康復(fù)理論與實(shí)踐. 2008(08)
[5]巨噬細(xì)胞內(nèi)吞脂質(zhì)的分子機(jī)制[J]. 陳琪. 中國動(dòng)脈硬化雜志. 2007(07)
[6]β-分泌酶抑制劑的研究進(jìn)展[J]. 廖國超,聶愛華,肖軍海,鐘武,李松. 中國藥物化學(xué)雜志. 2006(06)
[7]阿爾茨海默病病因?qū)W研究進(jìn)展及治療展望[J]. 陳彪,馬秋蘭. 中華神經(jīng)科雜志. 2003(02)
博士論文
[1]DKK1抑制巨噬細(xì)胞內(nèi)脂質(zhì)沉積及其相關(guān)分子機(jī)制[D]. 張瑜.山東大學(xué) 2015
本文編號(hào):3655466
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 樹鼩BACE1的分子克隆
(一) BACE1引物設(shè)計(jì)
(二) RNA與cDNA制備
(三) 普通PCR
(四) 3’RACE巢式PCR
(五) 5’RACE巢式PCR
(六) 測(cè)序
1.2.2 序列分析
1.2.3 BACE1的表達(dá)模式分析
(一) RNA相對(duì)表達(dá)定量
(二) Western blotting
2 結(jié)果
2.1 RACE 結(jié)果與序列分析
2.2 樹鼩BACE1氨基酸序列的分析
2.3 BACE1蛋白三維結(jié)構(gòu)分析
2.4 樹鼩BACE1基因在不同年齡段腦組織的表達(dá)分析
2.5 樹鼩BACE1蛋白的表達(dá)模式分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]老年癡呆癥的早期干預(yù)探討[J]. 曹樹春,呂恒剛. 解放軍預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2019(02)
[2]樹鼩在人類疾病動(dòng)物模型中應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 黃曉燕,徐娟,孫曉梅,代解杰. 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物科學(xué). 2013(02)
[3]顳葉和額葉癲癇認(rèn)知功能特點(diǎn)的研究[J]. 楊二娟,毓青,白學(xué)軍,陳英,楊衛(wèi)東,陳旨娟,郭華愛. 天津醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(01)
[4]大腦枕葉語言功能的研究進(jìn)展[J]. 方環(huán)海,王梅. 中國康復(fù)理論與實(shí)踐. 2008(08)
[5]巨噬細(xì)胞內(nèi)吞脂質(zhì)的分子機(jī)制[J]. 陳琪. 中國動(dòng)脈硬化雜志. 2007(07)
[6]β-分泌酶抑制劑的研究進(jìn)展[J]. 廖國超,聶愛華,肖軍海,鐘武,李松. 中國藥物化學(xué)雜志. 2006(06)
[7]阿爾茨海默病病因?qū)W研究進(jìn)展及治療展望[J]. 陳彪,馬秋蘭. 中華神經(jīng)科雜志. 2003(02)
博士論文
[1]DKK1抑制巨噬細(xì)胞內(nèi)脂質(zhì)沉積及其相關(guān)分子機(jī)制[D]. 張瑜.山東大學(xué) 2015
本文編號(hào):3655466
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