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果糖誘導(dǎo)斑馬魚肝臟脂肪變性的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析

發(fā)布時間:2022-02-22 01:03
  目的非酒精性脂肪肝(NAFLD)的發(fā)病呈低齡化趨勢,本研究旨在建立一種模擬低齡人群的高糖誘導(dǎo)的NAFLD模型,揭示其基因表達(dá)譜特征,為疾病的機(jī)制研究和藥物篩選提供基礎(chǔ)。方法采用高果糖飲食誘導(dǎo)斑馬魚產(chǎn)生肝臟脂肪變性,油紅O染色分析肝臟脂肪變性率,組織病理學(xué)方法觀察肝臟脂質(zhì)堆積,并分析肝臟生化指標(biāo)變化。利用轉(zhuǎn)錄組測序觀察基因表達(dá)譜變化,通過基因與基因組百科全書(KEGG)和基因本體(GO)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行差異基因功能富集,分析其可能影響的信號通路與生物過程。結(jié)果斑馬魚幼魚高果糖喂養(yǎng)10 d后發(fā)生肝臟脂肪變性,肝臟切片HE染色和油紅O染色結(jié)果發(fā)現(xiàn),果糖喂飼的幼魚肝臟出現(xiàn)微小脂質(zhì)空泡,呈大面積紅色著色。肝臟甘油三酯、葡萄糖含量顯著高于正常對照組。經(jīng)轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)果糖喂飼的幼魚肝臟表達(dá)譜發(fā)生明顯改變,共發(fā)現(xiàn)485個差異表達(dá)基因(變化倍數(shù)> 3,P <0.05)。差異基因KEGG分析表明,PPAR信號通路為顯著富集通路,real-time PCR結(jié)果確認(rèn)PPAR通路中fads2、fabp7b、plin2、adipoqa基因水平顯著上調(diào)。下調(diào)基因的GO分析結(jié)果顯示,病毒防御為顯著富集的生物學(xué)過... 

【文章來源】:中國醫(yī)藥生物技術(shù). 2019,14(04)

【文章頁數(shù)】:8 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 斑馬魚飼養(yǎng)
        1.2.2 斑馬魚整體油紅O染色
        1.2.3 組織學(xué)分析
        1.2.4 生化分析
        1.2.5 實時熒光定量PCR
        1.2.6 RNA測序與分析
    1.3 統(tǒng)計學(xué)處理
2 結(jié)果
    2.1 果糖誘導(dǎo)斑馬魚幼魚肝臟脂肪變性
    2.2 測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計
    2.3 差異基因表達(dá)分析
    2.4 差異基因KEGG和GO歸類分析
    2.5 Real-time PCR分析PPAR通路差異基因
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本文編號:3638373

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