結(jié)核分枝桿菌DXS和DXR抑制劑高通量篩選模型的建立與應(yīng)用
本文關(guān)鍵詞:結(jié)核分枝桿菌DXS和DXR抑制劑高通量篩選模型的建立與應(yīng)用,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:近年來結(jié)核病卷土重來,耐藥、多藥耐藥以及廣泛耐藥結(jié)核病的出現(xiàn)和傳播,使得尋找新的靶點(diǎn)及研發(fā)全新作用機(jī)制的高效低毒的抗結(jié)核藥物迫在眉睫。結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis, MTB)具有獨(dú)特而復(fù)雜的細(xì)胞壁結(jié)構(gòu),其涉及代謝途徑是公認(rèn)的抗結(jié)核藥物優(yōu)質(zhì)靶標(biāo)富集區(qū)。 類異戊二烯是MTB合成細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)單元阿拉伯半乳聚糖和肽聚糖的骨架分子,也是參與能量代謝等多種生物過程的十分重要的生理活性物質(zhì)。2-C-甲基-D-赤蘚糖醇-4-磷酸鹽(MEP)途徑是MTB合成類異戊二烯必需前體異戊烯焦磷酸(IPP)和二甲烯丙基焦磷酸(DMAPP)的唯一途徑,該途徑為MTB生存所必需。MEP途徑與MTB的生長代謝密切相關(guān),而且該途徑不存在于哺乳動(dòng)物細(xì)胞中,,使得催化該途徑的關(guān)鍵酶成為潛在的、具有較好選擇毒性的抗結(jié)核藥物的分子靶點(diǎn)。 本研究以MTB MEP途徑中關(guān)鍵酶DXS及DXR為研究對(duì)象,通過分子生物學(xué)方法,構(gòu)建了MTB DXS (MtDXS)和MTB DXR (MtDXR)蛋白的表達(dá)載體;優(yōu)化表達(dá)條件,獲得了可溶性表達(dá)的MtDXS和MtDXR蛋白;應(yīng)用Ni2+金屬螯合親和層析的方法對(duì)表達(dá)產(chǎn)物MtDXS和MtDXR進(jìn)行了純化,獲得了兩個(gè)具有天然酶活性可溶性蛋白;建立了MtDXS和MtDXR的酶活測(cè)定體系,基于酶活測(cè)定體系構(gòu)建了靶向MtDXS和MtDXR的MtDXS-MtDXR偶聯(lián)抑制劑篩選模型及靶向MtDXR的MtDXR抑制劑篩選模型,通過研究底物濃度、反應(yīng)酶量、反應(yīng)溫度、DMSO等對(duì)反應(yīng)體系的影響,對(duì)篩選模型進(jìn)行了優(yōu)化,并評(píng)價(jià)了優(yōu)化后模型的可行性;利用MtDXS-MtDXR禺聯(lián)模型對(duì)化合物庫中66400個(gè)化合物進(jìn)行了篩選,得到了6個(gè)MtDXS抑制劑,經(jīng)抗結(jié)核活性評(píng)價(jià)獲得1個(gè)具有良好抗結(jié)核活性的化合物,命名為IMB-DXS-B1;通過MtDXS-MtDXR偶聯(lián)模型及MtDXR模型篩選得到了3個(gè)MtDXR抑制劑,經(jīng)抗結(jié)核活性評(píng)價(jià)獲得1個(gè)具有抗結(jié)核活性的化合物,命名為IMB-DXR-B1。 化合物IMB-DXS-B1和IMB-DXR-Bl在骨架結(jié)構(gòu)上完全不同于傳統(tǒng)的抗結(jié)核藥物,二者對(duì)MTB H37Rv的MIC分別為2~4μg/mL和32μg/mL,且對(duì)臨床分離的敏感及耐藥結(jié)核分枝桿菌均具有一定的活性;抗菌譜測(cè)定結(jié)果表明二者僅對(duì)MTB有較好的抑制活性,而對(duì)其他的病原微生物活性甚微。這些結(jié)果表明兩個(gè)化合物有可能發(fā)展成為全新作用機(jī)制的窄譜的抗耐藥MTB藥物。
【關(guān)鍵詞】:結(jié)核分枝桿菌 DXS DXR 高通量篩選模型 抑制劑 抗結(jié)核藥物
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R378.911
【目錄】:
- 縮略語表6-8
- 中文摘要8-9
- 英文摘要9-10
- 前言10-14
- 實(shí)驗(yàn)材料與儀器14-20
- 1 菌株及細(xì)胞14
- 2 質(zhì)粒14
- 3 培養(yǎng)基14-15
- 4 主要試劑15-16
- 5 溶液16-18
- 6 試劑盒18
- 7 工具酶18
- 8 主要儀器18-20
- 實(shí)驗(yàn)方法20-44
- 1 重組MtDXS及MtDXR的生化特性預(yù)測(cè)20
- 2 重組MtDXS及MtDXR的表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建及測(cè)序分析20-29
- 3 重組MtDXS及MtDXR的表達(dá)菌株構(gòu)建29
- 4 MtDXS和MtDXR蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)29-30
- 5 MtDXS和MtDXR蛋白樣品的預(yù)處理30-31
- 6 MtDXS和MtDXR蛋白純化及蛋白質(zhì)含量測(cè)定31-33
- 7 純化蛋白的SDS-PAGE電泳檢測(cè)33-34
- 8 MtDXS及MtDXR活性測(cè)定原理及方法34-35
- 9 MtDXS和MtDXR酶穩(wěn)定性研究35-36
- 10 MtDXS和MtDXR酶活測(cè)定條件優(yōu)化36-38
- 11 MtDXS和MtDXR抑制劑高通量篩選模型的確立及應(yīng)用38-41
- 12 陽性化合物半數(shù)抑制濃度(IC_(50))測(cè)定41
- 13 陽性化合物最低抑菌濃度(MIC)的測(cè)定41-42
- 14 陽性化合物IMB-DXS-B1對(duì)MtDXS的酶動(dòng)力學(xué)研究42
- 15 陽性化合物IMB-DXR-B1對(duì)MtDXR的酶動(dòng)力學(xué)研究42
- 16 抗結(jié)核活性化合物對(duì)巨噬細(xì)胞毒性的初步評(píng)價(jià)42-44
- 實(shí)驗(yàn)結(jié)果44-70
- 1 重組蛋白的生化特性44-45
- 2 重組表達(dá)質(zhì)粒pET28a-dxs及pET28a-dxr的構(gòu)建與驗(yàn)證45-52
- 3 MtDXS和MtDXR蛋白的制備52-54
- 4 蛋白定量54-55
- 5 酶活測(cè)定結(jié)果55-56
- 6 重組蛋白穩(wěn)定性56-57
- 7 酶活測(cè)定條件的優(yōu)化57-64
- 8 MtDXS和MtDXR抑制劑高通量篩選模型的評(píng)價(jià)64
- 9 抑制劑篩選結(jié)果64-65
- 10 陽性化合物最低抑菌濃度(MIC)65-67
- 11 陽性化合物IMB-DXS-B1對(duì)MtDXS的動(dòng)力學(xué)研究67-68
- 12 陽性化合物IMB-DXR-B1對(duì)MtDXR的動(dòng)力學(xué)研究68
- 13 抗結(jié)核活性化合物對(duì)巨噬細(xì)胞毒性的初步評(píng)價(jià)68-70
- 討論70-73
- 結(jié)論73-74
- 參考文獻(xiàn)74-76
- 文獻(xiàn)綜述76-89
- 參考文獻(xiàn)85-89
- 附錄89-99
- 致謝99
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本文編號(hào):359403
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