金黃色葡萄球菌表面蛋白質SdrE的結構和功能研究
發(fā)布時間:2017-05-11 02:12
本文關鍵詞:金黃色葡萄球菌表面蛋白質SdrE的結構和功能研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的金黃色葡萄球菌表面蛋白質與宿主感染密切相關,其中SdrE蛋白質為金黃色葡萄球菌表面蛋白質主要成員之一,在骨骼等感染中起重要作用,且在人等宿主中無同源蛋白質。因此,希望通過對金黃色葡萄球菌表面蛋白質SdrE進行克隆表達純化及晶體培養(yǎng),以期解析其三維結構;并通過基因敲除和定點突變,以及相應的功能實驗,深入分析金黃色葡萄球菌感染的分子機制,,為研發(fā)新型特異性抗金黃色葡萄球菌藥物提供理論基礎。 方法利用PCR技術擴增SdrE基因,構建重組質粒pW28-SdrE,并在大腸桿菌(Escherichia coli, E.coli)B834中表達SdrE母體蛋白質和硒代蛋白質,通過Ni2+-NTA親和層析柱和DEAE陰離子交換層析柱純化目的蛋白質,再用Hiload Superdex200凝膠層析柱分析其在溶液中的聚集狀態(tài),用Hampton試劑盒初篩晶體及棋盤法優(yōu)化晶體。運用X-ray衍射儀收集衍射數(shù)據(jù),解析其三維結構。運用重疊延伸PCR和等位替換原理進行基因敲除和定點突變,在此基礎上通過藥敏試驗了解SdrE與金黃色葡萄球菌耐藥性的關系;Pull-down、SPR、ITC等生化實驗驗證SdrE與蛋白質相互作用位點;粘附和侵襲等細胞實驗分析SdrE與金黃色葡萄球菌感染的關系;小鼠等實驗動物研究進一步分析SdrE與金黃色葡萄球菌毒力的關系。 結果構建了融合質粒pW28-SdrE,并在E.coli B834中可溶性表達。獲得了純度較高(95%)的SdrE母體蛋白質,該蛋白在溶液中以單體形式存在;同時表達純化出純度約為85%的SdrE硒代蛋白質。獲得了SdrE母體蛋白質單晶和硒代蛋白質單晶,并在上海光源實驗室收集到兩套高分辨率的衍射數(shù)據(jù)。SdrE蛋白質晶體屬于P222空間群,晶胞參數(shù)為a=45.19,b=66.35,c=146.22,其中,每一個晶體學不對稱單位包含1個蛋白質分子,相應的結構解析工作正在進行。成功的構建了金黃色葡萄球菌SdrE基因缺失菌株,并通過細胞實驗表明SdrE與金黃色葡萄球菌的侵襲能力密切相關。 結論利用經(jīng)典的蛋白質純化技術和晶體培養(yǎng)技術,獲得衍射能力較強的蛋白質單晶,其三維結構的解析正在進行,通過基因敲除和細胞實驗驗證了SdrE與金黃色葡萄球菌感染相關,為基于結構的新型特異性抗菌藥物的研發(fā)提供了重要的理論基礎。
【關鍵詞】:金黃色葡萄球菌 表面蛋白質SdrE 蛋白質晶體 基因敲除 抗菌藥物
【學位授予單位】:重慶醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R378
【目錄】:
- 英漢縮略語名詞對照5-6
- 中文摘要6-8
- ABSTRACT8-11
- 前言11-15
- 參考文獻13-15
- 第一章 金黃色葡萄球菌表面蛋白質SdrE的結構研究15-42
- 第一節(jié) 金黃色葡萄球菌表面蛋白質SdrE的克隆、表達及純化16-35
- 1 材料與方法16-28
- 2 結果28-34
- 3 討論34-35
- 第二節(jié) 金黃色葡萄球菌表面蛋白質SdrE的三維結構分析35-40
- 1 材料與方法35-37
- 2 結果37-40
- 3 討論40
- 參考文獻40-42
- 第二章 金黃色葡萄球菌表面蛋白質SdrE的功能研究42-63
- 第一節(jié) 金黃色葡萄球菌表面蛋白質SdrE的基因敲除43-57
- 1 材料和方法43-51
- 2 結果51-56
- 3 討論56-57
- 第二節(jié) 金黃色葡萄球菌表面蛋白質 SdrE 的毒力分析57-61
- 1 材料和方法57-59
- 2 結果59-60
- 3 討論60-61
- 參考文獻61-63
- 全文總結63-64
- 文獻綜述64-72
- 參考文獻68-72
- 致謝72-73
- 發(fā)表的論文、參加的學術會議及參與的科研項目73-75
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 林亞靜;劉志杰;龔為民;;蛋白質結構研究[J];生命科學;2007年03期
中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 牛司強;一種肺炎鏈球菌溶菌酶樣假想蛋白質SP0987的結構和功能研究[D];重慶醫(yī)科大學;2011年
本文關鍵詞:金黃色葡萄球菌表面蛋白質SdrE的結構和功能研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:356030
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