金黃色葡萄球菌表面蛋白質(zhì)SdrE的結(jié)構(gòu)和功能研究
發(fā)布時間:2017-05-11 02:12
本文關(guān)鍵詞:金黃色葡萄球菌表面蛋白質(zhì)SdrE的結(jié)構(gòu)和功能研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的金黃色葡萄球菌表面蛋白質(zhì)與宿主感染密切相關(guān),其中SdrE蛋白質(zhì)為金黃色葡萄球菌表面蛋白質(zhì)主要成員之一,在骨骼等感染中起重要作用,且在人等宿主中無同源蛋白質(zhì)。因此,希望通過對金黃色葡萄球菌表面蛋白質(zhì)SdrE進(jìn)行克隆表達(dá)純化及晶體培養(yǎng),以期解析其三維結(jié)構(gòu);并通過基因敲除和定點突變,以及相應(yīng)的功能實驗,深入分析金黃色葡萄球菌感染的分子機(jī)制,,為研發(fā)新型特異性抗金黃色葡萄球菌藥物提供理論基礎(chǔ)。 方法利用PCR技術(shù)擴(kuò)增SdrE基因,構(gòu)建重組質(zhì)粒pW28-SdrE,并在大腸桿菌(Escherichia coli, E.coli)B834中表達(dá)SdrE母體蛋白質(zhì)和硒代蛋白質(zhì),通過Ni2+-NTA親和層析柱和DEAE陰離子交換層析柱純化目的蛋白質(zhì),再用Hiload Superdex200凝膠層析柱分析其在溶液中的聚集狀態(tài),用Hampton試劑盒初篩晶體及棋盤法優(yōu)化晶體。運(yùn)用X-ray衍射儀收集衍射數(shù)據(jù),解析其三維結(jié)構(gòu)。運(yùn)用重疊延伸PCR和等位替換原理進(jìn)行基因敲除和定點突變,在此基礎(chǔ)上通過藥敏試驗了解SdrE與金黃色葡萄球菌耐藥性的關(guān)系;Pull-down、SPR、ITC等生化實驗驗證SdrE與蛋白質(zhì)相互作用位點;粘附和侵襲等細(xì)胞實驗分析SdrE與金黃色葡萄球菌感染的關(guān)系;小鼠等實驗動物研究進(jìn)一步分析SdrE與金黃色葡萄球菌毒力的關(guān)系。 結(jié)果構(gòu)建了融合質(zhì)粒pW28-SdrE,并在E.coli B834中可溶性表達(dá)。獲得了純度較高(95%)的SdrE母體蛋白質(zhì),該蛋白在溶液中以單體形式存在;同時表達(dá)純化出純度約為85%的SdrE硒代蛋白質(zhì)。獲得了SdrE母體蛋白質(zhì)單晶和硒代蛋白質(zhì)單晶,并在上海光源實驗室收集到兩套高分辨率的衍射數(shù)據(jù)。SdrE蛋白質(zhì)晶體屬于P222空間群,晶胞參數(shù)為a=45.19,b=66.35,c=146.22,其中,每一個晶體學(xué)不對稱單位包含1個蛋白質(zhì)分子,相應(yīng)的結(jié)構(gòu)解析工作正在進(jìn)行。成功的構(gòu)建了金黃色葡萄球菌SdrE基因缺失菌株,并通過細(xì)胞實驗表明SdrE與金黃色葡萄球菌的侵襲能力密切相關(guān)。 結(jié)論利用經(jīng)典的蛋白質(zhì)純化技術(shù)和晶體培養(yǎng)技術(shù),獲得衍射能力較強(qiáng)的蛋白質(zhì)單晶,其三維結(jié)構(gòu)的解析正在進(jìn)行,通過基因敲除和細(xì)胞實驗驗證了SdrE與金黃色葡萄球菌感染相關(guān),為基于結(jié)構(gòu)的新型特異性抗菌藥物的研發(fā)提供了重要的理論基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】:金黃色葡萄球菌 表面蛋白質(zhì)SdrE 蛋白質(zhì)晶體 基因敲除 抗菌藥物
【學(xué)位授予單位】:重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號】:R378
【目錄】:
- 英漢縮略語名詞對照5-6
- 中文摘要6-8
- ABSTRACT8-11
- 前言11-15
- 參考文獻(xiàn)13-15
- 第一章 金黃色葡萄球菌表面蛋白質(zhì)SdrE的結(jié)構(gòu)研究15-42
- 第一節(jié) 金黃色葡萄球菌表面蛋白質(zhì)SdrE的克隆、表達(dá)及純化16-35
- 1 材料與方法16-28
- 2 結(jié)果28-34
- 3 討論34-35
- 第二節(jié) 金黃色葡萄球菌表面蛋白質(zhì)SdrE的三維結(jié)構(gòu)分析35-40
- 1 材料與方法35-37
- 2 結(jié)果37-40
- 3 討論40
- 參考文獻(xiàn)40-42
- 第二章 金黃色葡萄球菌表面蛋白質(zhì)SdrE的功能研究42-63
- 第一節(jié) 金黃色葡萄球菌表面蛋白質(zhì)SdrE的基因敲除43-57
- 1 材料和方法43-51
- 2 結(jié)果51-56
- 3 討論56-57
- 第二節(jié) 金黃色葡萄球菌表面蛋白質(zhì) SdrE 的毒力分析57-61
- 1 材料和方法57-59
- 2 結(jié)果59-60
- 3 討論60-61
- 參考文獻(xiàn)61-63
- 全文總結(jié)63-64
- 文獻(xiàn)綜述64-72
- 參考文獻(xiàn)68-72
- 致謝72-73
- 發(fā)表的論文、參加的學(xué)術(shù)會議及參與的科研項目73-75
【參考文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 林亞靜;劉志杰;龔為民;;蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究[J];生命科學(xué);2007年03期
中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 牛司強(qiáng);一種肺炎鏈球菌溶菌酶樣假想蛋白質(zhì)SP0987的結(jié)構(gòu)和功能研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2011年
本文關(guān)鍵詞:金黃色葡萄球菌表面蛋白質(zhì)SdrE的結(jié)構(gòu)和功能研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:356030
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/shiyanyixue/356030.html
最近更新
教材專著