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沙門氏菌焦磷酸測(cè)序與分子分型溯源研究

發(fā)布時(shí)間:2017-05-06 16:16

  本文關(guān)鍵詞:沙門氏菌焦磷酸測(cè)序與分子分型溯源研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:本研究根據(jù)腸道沙門氏菌、腸炎沙門氏菌和鼠傷寒沙門氏菌的特異序列,分別設(shè)計(jì)擴(kuò)增引物和測(cè)序引物,建立焦磷酸測(cè)序檢測(cè)方法。采用特異性引物對(duì)目標(biāo)片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增。然后制備單鏈模板并利用測(cè)序引物進(jìn)行焦磷酸測(cè)序。結(jié)果表明,24株不同血清型的腸道沙門氏菌、16株腸炎沙門氏菌和6株鼠傷寒沙門氏菌分別擴(kuò)增出81bp、176bp和131bp的片段,而陰性對(duì)照菌株均未擴(kuò)增。焦磷酸測(cè)序結(jié)果進(jìn)行BLAST比對(duì)表明,可以將如下100%匹配的堿基序列作為腸道沙門氏菌、腸炎沙門氏菌、鼠傷寒沙門氏菌的判定標(biāo)準(zhǔn):GCCTGTGGGT ACTTCTCCTG CCAGTATAAT, CCTGTTGTCT GCTCACCATT CGCCAGCCAC, TACAACCGGA GTGCACATTA ATCCCGCAGC。焦磷酸測(cè)序法是一種快速、準(zhǔn)確的檢測(cè)方法,可應(yīng)用于食品中腸道沙門氏菌、腸炎沙門氏菌和鼠傷寒沙門氏菌的快速檢測(cè)。
【關(guān)鍵詞】:腸道沙門氏菌 腸炎沙門氏菌 鼠傷寒沙門氏菌 焦磷酸測(cè)序
【學(xué)位授予單位】:大連工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R378
【目錄】:
  • 摘要4-5
  • Abstract5-8
  • 第一章 沙門氏菌概述8-20
  • 1.1 沙門氏菌的分類與命名8-12
  • 1.1.1 沙門氏菌分類命名的發(fā)展史8-11
  • 1.1.2 現(xiàn)行的沙門氏菌屬分類及命名原則11-12
  • 1.2 沙門氏菌屬特征12-16
  • 1.2.1 形態(tài)學(xué)特征12
  • 1.2.2 培養(yǎng)特征12-13
  • 1.2.3 生理生化特征13
  • 1.2.4 抗原特征13-15
  • 1.2.5 噬菌體特征15-16
  • 1.3 沙門氏菌病及發(fā)病機(jī)理16-20
  • 1.3.1 流行病學(xué)16-17
  • 1.3.2 發(fā)病機(jī)制17-18
  • 1.3.3 感染癥狀18-20
  • 第二章 焦磷酸測(cè)序檢測(cè)技術(shù)與DiversiLab系統(tǒng)分子分型技術(shù)20-32
  • 2.1 焦磷酸測(cè)序檢測(cè)技術(shù)原理20-25
  • 2.1.1 簡(jiǎn)介20
  • 2.1.2 測(cè)序原理20-22
  • 2.1.3 工作流程22-25
  • 2.2 DiversiLab系統(tǒng)分子分型技術(shù)25-32
  • 2.2.1 簡(jiǎn)介26
  • 2.2.2 系統(tǒng)原理26-27
  • 2.2.3 操作流程27
  • 2.2.4 實(shí)驗(yàn)材料27-28
  • 2.2.5 系統(tǒng)硬件28-29
  • 2.2.6 系統(tǒng)軟件29-31
  • 2.2.7 技術(shù)特點(diǎn)31-32
  • 第三章 焦磷酸測(cè)序檢測(cè)腸道沙門氏菌、腸炎沙門氏菌和鼠傷寒沙門氏菌32-42
  • 3.1 材料和方法32-36
  • 3.2 結(jié)果36-42
  • 第四章 DiversiLab系統(tǒng)沙門氏菌分子分型溯源方法的建立42-48
  • 4.1 材料和方法42-44
  • 4.2 結(jié)果與分析44-46
  • 4.3 討論46-48
  • 第五章 結(jié)論48-49
  • 參考文獻(xiàn)49-51
  • 致謝51

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

1 李秀娟;白萍;高偉利;李麗婕;徐保紅;田會(huì)芳;;短片段基因序列測(cè)定檢測(cè)沙門菌[J];現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué);2010年20期

2 張曉丹;武海萍;陳之遙;周國(guó)華;;堿基序列標(biāo)記法結(jié)合焦磷酸測(cè)序測(cè)定不同來源基因表達(dá)量[J];分析化學(xué);2009年08期

3 汪維鵬;武海萍;周國(guó)華;;焦測(cè)序法檢測(cè)禽流感病毒[J];分析化學(xué);2008年06期

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 楊芳;沙門菌條碼基因研究及焦磷酸測(cè)序快速鑒定[D];河北師范大學(xué);2011年


  本文關(guān)鍵詞:沙門氏菌焦磷酸測(cè)序與分子分型溯源研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號(hào):348747

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