沙門氏菌焦磷酸測序與分子分型溯源研究
發(fā)布時間:2017-05-06 16:16
本文關(guān)鍵詞:沙門氏菌焦磷酸測序與分子分型溯源研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:本研究根據(jù)腸道沙門氏菌、腸炎沙門氏菌和鼠傷寒沙門氏菌的特異序列,分別設(shè)計擴(kuò)增引物和測序引物,建立焦磷酸測序檢測方法。采用特異性引物對目標(biāo)片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增。然后制備單鏈模板并利用測序引物進(jìn)行焦磷酸測序。結(jié)果表明,24株不同血清型的腸道沙門氏菌、16株腸炎沙門氏菌和6株鼠傷寒沙門氏菌分別擴(kuò)增出81bp、176bp和131bp的片段,而陰性對照菌株均未擴(kuò)增。焦磷酸測序結(jié)果進(jìn)行BLAST比對表明,可以將如下100%匹配的堿基序列作為腸道沙門氏菌、腸炎沙門氏菌、鼠傷寒沙門氏菌的判定標(biāo)準(zhǔn):GCCTGTGGGT ACTTCTCCTG CCAGTATAAT, CCTGTTGTCT GCTCACCATT CGCCAGCCAC, TACAACCGGA GTGCACATTA ATCCCGCAGC。焦磷酸測序法是一種快速、準(zhǔn)確的檢測方法,可應(yīng)用于食品中腸道沙門氏菌、腸炎沙門氏菌和鼠傷寒沙門氏菌的快速檢測。
【關(guān)鍵詞】:腸道沙門氏菌 腸炎沙門氏菌 鼠傷寒沙門氏菌 焦磷酸測序
【學(xué)位授予單位】:大連工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號】:R378
【目錄】:
- 摘要4-5
- Abstract5-8
- 第一章 沙門氏菌概述8-20
- 1.1 沙門氏菌的分類與命名8-12
- 1.1.1 沙門氏菌分類命名的發(fā)展史8-11
- 1.1.2 現(xiàn)行的沙門氏菌屬分類及命名原則11-12
- 1.2 沙門氏菌屬特征12-16
- 1.2.1 形態(tài)學(xué)特征12
- 1.2.2 培養(yǎng)特征12-13
- 1.2.3 生理生化特征13
- 1.2.4 抗原特征13-15
- 1.2.5 噬菌體特征15-16
- 1.3 沙門氏菌病及發(fā)病機(jī)理16-20
- 1.3.1 流行病學(xué)16-17
- 1.3.2 發(fā)病機(jī)制17-18
- 1.3.3 感染癥狀18-20
- 第二章 焦磷酸測序檢測技術(shù)與DiversiLab系統(tǒng)分子分型技術(shù)20-32
- 2.1 焦磷酸測序檢測技術(shù)原理20-25
- 2.1.1 簡介20
- 2.1.2 測序原理20-22
- 2.1.3 工作流程22-25
- 2.2 DiversiLab系統(tǒng)分子分型技術(shù)25-32
- 2.2.1 簡介26
- 2.2.2 系統(tǒng)原理26-27
- 2.2.3 操作流程27
- 2.2.4 實驗材料27-28
- 2.2.5 系統(tǒng)硬件28-29
- 2.2.6 系統(tǒng)軟件29-31
- 2.2.7 技術(shù)特點31-32
- 第三章 焦磷酸測序檢測腸道沙門氏菌、腸炎沙門氏菌和鼠傷寒沙門氏菌32-42
- 3.1 材料和方法32-36
- 3.2 結(jié)果36-42
- 第四章 DiversiLab系統(tǒng)沙門氏菌分子分型溯源方法的建立42-48
- 4.1 材料和方法42-44
- 4.2 結(jié)果與分析44-46
- 4.3 討論46-48
- 第五章 結(jié)論48-49
- 參考文獻(xiàn)49-51
- 致謝51
【參考文獻(xiàn)】
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本文關(guān)鍵詞:沙門氏菌焦磷酸測序與分子分型溯源研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:348747
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