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鳥分枝桿菌的分離鑒定及PhoR基因表達和蛋白功能研究

發(fā)布時間:2017-04-29 07:08

  本文關鍵詞:鳥分枝桿菌的分離鑒定及PhoR基因表達和蛋白功能研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:研究目的: 非結核分枝桿菌(Nontuberculosis mycobacteria,NTM)所感染的疾病在日益流行的AIDS/HIV病患中不斷涌現(xiàn)。因其臨床表現(xiàn)與結核病極其相似,早期診斷易出現(xiàn)誤診、漏診。研究開發(fā)快速準確的分枝桿菌菌種鑒定技術對NTM病早期診斷與及時治療具有重要意義。鳥分枝桿菌復合體(Mycobacterium avium complex,MAC)在AIDS/HIV患者NTM病中所占比例甚大。為更好地了解、研究AIDS/HIV患者中的NTM持留存活機制,本實驗采用16S rRNA測序法對15例來自AIDS/HIV患者痰培養(yǎng)陽性標本進行鑒定得到鳥分枝桿菌,并初步探究鳥分枝桿菌PhoR基因功能。 實驗方法: 1、鳥分枝桿菌的分離鑒定 本實驗采用16S rRNA測序法對15例來自AIDS/HIV患者痰培養(yǎng)陽性標本進行鑒定 2、鳥分枝桿菌PhoR基因的原核表達 檢索NCBI數(shù)據庫獲得鳥分枝桿菌104菌株PhoR基因序列,在其兩側加入BamH I和EcoR I酶切位點,設計并合成引物后進行PCR擴增;將膠回收的PCR產物與pGEX-4T-3表達載體雙酶切處理,T4連接酶連接轉化,構建重組質粒pGEX-4T-3-PhoR,PCR與雙酶切驗證正確后測序。測序結果經拼接比對后進行生物信息學分析,隨后pGEX-4T-3-PhoR重組質粒轉化大腸桿菌BL21(DE3),經IPTG誘導,菌體破碎后進行SDS-PAGE電泳分析。 3、PhoR基因原核表達對重組菌在三種耐受條件下生存影響 大腸桿菌BL21(DE3)和含pGEX-4T-3質粒的大腸桿菌BL21(DE3)分別在SDS、NaNO2及H2O2條件下進行耐受閾值實驗,確定各自最大耐受閾值。將IPTG誘導培養(yǎng)2h的重組菌BL/pGEX-4T-3-PhoR和BL/pGEX-4T-3,用LB培養(yǎng)液調整至OD600為0.8后,分別進行大腸桿菌在0.4%SDS、7mmol/L NaNO2及1mmol/L H2O2耐受條件下的生存影響實驗。 實驗結果: 1、鳥分枝桿菌的分離鑒定 15例分枝桿菌中有9株結核分枝桿菌、4株鳥分枝桿菌、2株膿腫分枝桿菌。測序結果中顯示有四條序列完全一樣,長度為496bp。NCBIBLAST比對發(fā)現(xiàn),其與鳥分枝桿菌104菌株16S rRNA序列基本一樣,只在序列的第81位存在差異,判斷其為鳥分枝桿菌。 2、鳥分枝桿菌PhoR基因的原核表達 采用溫度梯度PCR法擴增PhoR基因,條帶大小約為1500bp,與預計大小基本相符。構建重組表達質粒pGEX-4T-3-PhoR經測序驗證后進行原核表達,SDS-PAGE實驗結果顯示空載對照組,出現(xiàn)清晰的蛋白條帶,與預期GST標簽蛋白條帶(26.8kD)接近。重組質粒實驗組表達的融合蛋白大小約為85kD,,比預期蛋白大小77.6kD略微偏大。 3、PhoR基因原核表達對重組菌在三種耐受條件下生存影響 (1)在0.4%SDS耐受條件下,實驗組BL/pGEX-4T-3-PhoR與空載對照組BL/pGEX-4T-3細菌生長情況一樣,均無法存活。 (2)在7mmol/L NaNO2耐受條件下,實驗組BL/pGEX-4T-3-PhoR能夠繼續(xù)生長繁殖,而空載質粒組基本無法存活。 (3)在1mmol/L H2O2耐受條件下,實驗組BL/pGEX-4T-3-PhoR仍然可以生長繁殖,而空載質粒組基本無法存活。 結論: (1)成功從15例AIDS/HIV患者痰培養(yǎng)陽性的樣本中分離鑒定出一株鳥分枝桿菌104菌株。 (2)成功構建了pGEX-4T-3-PhoR重組表達質粒。 (3)PhoR基因表達對大腸桿菌在SDS最大耐受閾值條件下耐受存活無作用。 (4)PhoR基因表達有助于大腸桿菌在NaNO2和H2O2最大耐受閾值條件下耐受存活。
【關鍵詞】:非結核分枝桿菌 分離鑒定 鳥分枝桿菌 PhoR 肺部表面活性物質 活性氧 活性氮
【學位授予單位】:廣西醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R378.911;Q78
【目錄】:
  • 英文縮略語表5-7
  • 摘要7-10
  • ABSTRACT10-14
  • 前言14-17
  • 第一章 鳥分枝桿菌的分離鑒定17-22
  • 1 材料與試劑17
  • 2 實驗方法17-20
  • 3 實驗結果20-22
  • 第二章 鳥分枝桿菌 PhoR 基因的原核表達22-38
  • 1 材料與試劑22-24
  • 2 實驗方法24-30
  • 3 實驗結果30-38
  • 第三章 PhoR 基因原核表達對宿主菌耐受不良環(huán)境功能研究38-41
  • 1 材料與試劑38
  • 2 實驗方法38-39
  • 3 實驗結果39-41
  • 討論41-45
  • 結論45-46
  • 參考文獻46-50
  • 課題綜述50-61
  • 參考文獻58-61
  • 致謝61-62
  • 攻讀學位期間發(fā)表的學術論文目錄62

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據庫 前5條

1 李俊明;朱道銀;;結核分支桿菌感染與巨噬細胞的凋亡[J];國際檢驗醫(yī)學雜志;2006年01期

2 馬s

本文編號:334388


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