本文由兩大部分組成。首先，我們發(fā)現(xiàn)了一些在原核生物及真核生物中存在的DNA對(duì)稱(chēng)性現(xiàn)象，并探討其中的原因；其后，以此為基礎(chǔ)建立調(diào)控元件模塊搜索系統(tǒng)（Cis-Regulatory Module Searching System，CRMSS），部分HLA調(diào)控區(qū)的搜索結(jié)果初步驗(yàn)證了CRMSS系統(tǒng)的正確性和數(shù)據(jù)管理的可靠性。為清楚起見(jiàn)，背景方法等內(nèi)容分而表之，而結(jié)論部分則概而述之。 DNA序列的對(duì)稱(chēng)性 背景 在DNA序列中，對(duì)稱(chēng)性似乎是它的一個(gè)內(nèi)在屬性。從雙鏈的角度看，A=T，G=C；從單鏈角度看，也存在A≈T，G≈C的現(xiàn)象。近來(lái)的研究表明，不多于9個(gè)堿基的寡核苷酸與其互補(bǔ)的寡核苷酸在DNA雙鏈上也存在著對(duì)稱(chēng)關(guān)系。 為解釋單鏈上的這種現(xiàn)象，Seuoka提出：如果DNA的兩條鏈上在選擇壓力和自然突變上不存在差異，經(jīng)過(guò)一定的時(shí)間后，單核苷酸鏈上，最終將出現(xiàn)A≈T，G≈C的現(xiàn)象。但從分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)角度看，在選擇壓力和自然突變等因素影響下，DNA雙鏈上的基因在復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、修復(fù)的過(guò)程中存在著各種差異。 目的 1．比較DNA雙鏈編碼區(qū)及密碼子位置上堿基的分布頻率，比較氨基... 

【文章來(lái)源】：南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁(yè)數(shù)】：113 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
主要縮寫(xiě)詞中英文對(duì)照表
中文摘要
Abstract
前言
第一部分 細(xì)菌（原核生物）基因組的對(duì)稱(chēng)性
    一、 數(shù)據(jù)和方法
    二、 結(jié)果
    三、 討論
第二部分 酵母（真核生物）基因組的對(duì)稱(chēng)性
    一、 數(shù)據(jù)和方法
    二、 結(jié)果
    三、 討論
第三部分 CRMSS系統(tǒng)的建立
    一、 生物學(xué)基礎(chǔ)
    二、 數(shù)學(xué)模型及算法
    三、 CRMSS系統(tǒng)的設(shè)計(jì)
第四部分 CRMSS系統(tǒng)的初步應(yīng)用
    一、 數(shù)據(jù)和方法
    二、 結(jié)果
    三、 討論
回顧與展望
綜述 調(diào)控元件模塊預(yù)測(cè)方法研究概述
博士期間的工作
致謝



本文編號(hào)：3160376