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鼠視網(wǎng)膜VEGF家族靶點(diǎn)基因相關(guān)性分析

發(fā)布時間:2021-04-15 14:33
  目的比較鼠視網(wǎng)膜Vegf家族幾個主要目標(biāo)基因之間功能和作用途徑的異同。方法利用Genenetwork數(shù)據(jù)庫中BXD鼠基因數(shù)據(jù)對兩類抗VEGF藥物作用的小鼠Vegf家族靶點(diǎn)基因進(jìn)行分析比較。采用基因表達(dá)水平、目標(biāo)基因間比較、與目標(biāo)基因相關(guān)的基因間比較、表達(dá)量性狀位點(diǎn)(e QTL)等多種方法和統(tǒng)計策略,對C57BL/6J XDBA/2J(BXD)重組小鼠近交系(RI)群體的視網(wǎng)膜全基因組表達(dá)譜數(shù)據(jù)中Vegf家族不同靶基因(VegfA、VegfB、VegfC和Pgf)的分子通路或潛在功能的異同進(jìn)行了比較和研究。結(jié)果 Vegf A2在所有VegfA三個基因探針中的表達(dá)水平最高。在總體比較中,Vegf A1和Vegf A2的表達(dá)水平呈正相關(guān)(r=0.541),VegfB與VegfC之間的相關(guān)性較弱(r=0.360),Vegf C與Pgf的表達(dá)水平也呈弱相關(guān)性(r=0.324)。在進(jìn)一步對目標(biāo)基因高度相關(guān)基因間的比較中,各基因最為相關(guān)的50個基因與其他基因之間相互關(guān)系均較弱。r值之間的比較中,Vegf B與Vegf A2之間呈現(xiàn)負(fù)相關(guān)性(R50ab=0.3129,R50ba=-0. 42758),... 

【文章來源】:齊齊哈爾醫(yī)學(xué)院學(xué)報. 2019,40(17)

【文章頁數(shù)】:5 頁

【文章目錄】:
一、材料和方法
    1. 材料:
    2. 方法:
    3. 評價指標(biāo):
    4. 統(tǒng)計學(xué)方法:
二、結(jié)果
    1. VEGFA、VEGFB、VEGFC和Pgf在小鼠視網(wǎng)膜中的表達(dá)水平:
    2. 各基因間相關(guān)性的總體比較:
    3. 調(diào)節(jié)小鼠視網(wǎng)膜VegfA、Vegfb、VegfC和Pgf表達(dá)水平的eQTLs分析:



本文編號:3139520

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