鼠疫耶爾森菌YopJ蛋白的基因密碼子優(yōu)化及異源表達純化
發(fā)布時間:2020-12-15 08:07
目的優(yōu)化鼠疫耶爾森菌YopJ蛋白基因密碼子并在大腸埃希菌中進行異源表達純化。方法依據(jù)大腸埃希菌密碼子偏好性對鼠疫耶爾森菌YopJ基因進行全基因序列優(yōu)化,并設(shè)計引物。分別以密碼子優(yōu)化前后的鼠疫耶爾森菌YopJ蛋白的基因為模板,將包含YopJ(22aa-288aa)和YopJ(22aa-250aa)的基因片段連接到載體pGI01中。重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到大腸埃希菌BL21菌株中,擴大培養(yǎng)后,IPTG誘導(dǎo)目的蛋白表達。提取大腸埃希菌表達蛋白并使用鎳離子柱進行純化。結(jié)果鼠疫耶爾森菌YopJ密碼子優(yōu)化前YopJ(22aa-288aa)及YopJ(22aa-250aa)在大腸埃希菌內(nèi)表達水平較低,密碼子優(yōu)化后YopJ(22aa-288aa)及YopJ(22aa-250aa)在大腸埃希菌內(nèi)大量表達可溶性YopJ蛋白。結(jié)論對鼠疫耶爾森菌YopJ蛋白進行基因密碼子優(yōu)化能夠提高其在大腸埃希菌內(nèi)的表達量。獲得的鼠疫耶爾森菌YopJ蛋白具有可溶性,為進一步研究其結(jié)構(gòu)和功能奠定了基礎(chǔ)。
【文章來源】:中國病原生物學(xué)雜志. 2019年09期 北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
圖1密碼子優(yōu)化前鼠疫耶爾森菌YopJDNA序列Fig.1TheDNAsequenceofYersiniaYopJbeforecodonoptimization
f、w、e進行SDS-PAGE電泳檢測。結(jié)果1密碼子優(yōu)化前后鼠疫耶爾森菌YopJ基因序列比較密碼子優(yōu)化前后鼠疫耶爾森菌YopJ基因序列見圖1和圖2。根據(jù)大腸桿菌的密碼子偏好性,對YopJ的DNA序列進行優(yōu)化,保持氨基酸的序列不變,替換了174個堿基。圖1密碼子優(yōu)化前鼠疫耶爾森菌YopJDNA序列Fig.1TheDNAsequenceofYersiniaYopJbeforecodonoptimization圖2密碼子優(yōu)化后鼠疫耶爾森菌YopJDNA序列Fig.2TheDNAsequenceofYersiniaYopJaftercodonoptimization2目的基因的鑒定用密碼子優(yōu)化前后各兩組引物分別將鼠疫耶爾森菌YopJ22aa-288aa基因及YopJ22aa-250aa基因進行擴增,將PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,大小分別801bp和687bp(圖3)。3重組蛋白的鑒定將含有重組質(zhì)粒的表達菌分別接種到LB培養(yǎng)基中進行擴大培養(yǎng),當A600值為0.6~0.8時,16℃降溫1h,加入IPTG低溫誘導(dǎo)過夜,離心收集菌,破碎,離心得到可溶蛋白,經(jīng)鎳離子親和層析柱純化后進行SDS-PAGE,YopJ蛋白相對分子質(zhì)量約為32×103。其中密碼子優(yōu)化前YopJ22aa-288aa基因無可溶性YopJ蛋白表達,YopJ22aa-250aa基因表達可溶性YopJ蛋白的量較少(圖4)。密碼子優(yōu)化后兩組基因可溶性
YopJ蛋白表達,YopJ22aa-250aa基因表達可溶性YopJ蛋白的量較少(圖4)。密碼子優(yōu)化后兩組基因可溶性YopJ蛋白表達水平較密碼子優(yōu)化前有顯著提升(圖5)。MDNA標志物(DL200)1優(yōu)化前YopJ22aa-288aa基因PCR產(chǎn)物2優(yōu)化前YopJ22aa-250aa基因PCR產(chǎn)物3優(yōu)化后YopJ22aa-288aa基因PCR產(chǎn)物4優(yōu)化后YopJ22aa-250aa基因PCR產(chǎn)物圖3PCR擴增目的基因片段MDNAmarker1YopJ22aa-288aagenebeforeoptimization2YopJ22aa-250aagenebeforeoptimization3YopJ22aa-288aageneafteroptimization4YopJ22aa-250aageneafteroptimizationFig.3IdentificationofPCRproducts·6010·中國病原生物學(xué)雜志JournalofPathogenBiology2019年9月第14卷第9期Sep.2019,Vol.14,No.9
本文編號:2917954
【文章來源】:中國病原生物學(xué)雜志. 2019年09期 北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
圖1密碼子優(yōu)化前鼠疫耶爾森菌YopJDNA序列Fig.1TheDNAsequenceofYersiniaYopJbeforecodonoptimization
f、w、e進行SDS-PAGE電泳檢測。結(jié)果1密碼子優(yōu)化前后鼠疫耶爾森菌YopJ基因序列比較密碼子優(yōu)化前后鼠疫耶爾森菌YopJ基因序列見圖1和圖2。根據(jù)大腸桿菌的密碼子偏好性,對YopJ的DNA序列進行優(yōu)化,保持氨基酸的序列不變,替換了174個堿基。圖1密碼子優(yōu)化前鼠疫耶爾森菌YopJDNA序列Fig.1TheDNAsequenceofYersiniaYopJbeforecodonoptimization圖2密碼子優(yōu)化后鼠疫耶爾森菌YopJDNA序列Fig.2TheDNAsequenceofYersiniaYopJaftercodonoptimization2目的基因的鑒定用密碼子優(yōu)化前后各兩組引物分別將鼠疫耶爾森菌YopJ22aa-288aa基因及YopJ22aa-250aa基因進行擴增,將PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,大小分別801bp和687bp(圖3)。3重組蛋白的鑒定將含有重組質(zhì)粒的表達菌分別接種到LB培養(yǎng)基中進行擴大培養(yǎng),當A600值為0.6~0.8時,16℃降溫1h,加入IPTG低溫誘導(dǎo)過夜,離心收集菌,破碎,離心得到可溶蛋白,經(jīng)鎳離子親和層析柱純化后進行SDS-PAGE,YopJ蛋白相對分子質(zhì)量約為32×103。其中密碼子優(yōu)化前YopJ22aa-288aa基因無可溶性YopJ蛋白表達,YopJ22aa-250aa基因表達可溶性YopJ蛋白的量較少(圖4)。密碼子優(yōu)化后兩組基因可溶性
YopJ蛋白表達,YopJ22aa-250aa基因表達可溶性YopJ蛋白的量較少(圖4)。密碼子優(yōu)化后兩組基因可溶性YopJ蛋白表達水平較密碼子優(yōu)化前有顯著提升(圖5)。MDNA標志物(DL200)1優(yōu)化前YopJ22aa-288aa基因PCR產(chǎn)物2優(yōu)化前YopJ22aa-250aa基因PCR產(chǎn)物3優(yōu)化后YopJ22aa-288aa基因PCR產(chǎn)物4優(yōu)化后YopJ22aa-250aa基因PCR產(chǎn)物圖3PCR擴增目的基因片段MDNAmarker1YopJ22aa-288aagenebeforeoptimization2YopJ22aa-250aagenebeforeoptimization3YopJ22aa-288aageneafteroptimization4YopJ22aa-250aageneafteroptimizationFig.3IdentificationofPCRproducts·6010·中國病原生物學(xué)雜志JournalofPathogenBiology2019年9月第14卷第9期Sep.2019,Vol.14,No.9
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