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耐多藥結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因的分子流行病學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2017-04-07 18:16

  本文關(guān)鍵詞:耐多藥結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因的分子流行病學(xué)研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:耐多藥(Multi-drug Resistant,MDR)結(jié)核菌是指結(jié)核菌至少同時(shí)對(duì)利福平(Rifampicin, RIF)和異煙肼(Isoniazid,INH)兩種一線抗結(jié)核藥物發(fā)生耐藥。我國(guó)耐多藥結(jié)核病患者比例很高,約為9.3%,是世界平均水平的2倍左右。耐多藥結(jié)核病相比較于普通結(jié)核病防控難度高、治療難度大、治愈率低且藥物副作用大。 耐多藥結(jié)核病的防治最關(guān)鍵的是如何在早期快速、準(zhǔn)確的診斷出結(jié)核菌的耐藥性;诠腆w培養(yǎng)基培養(yǎng)的傳統(tǒng)藥敏實(shí)驗(yàn)方法雖具有較高的準(zhǔn)確性,但需較長(zhǎng)時(shí)間,一般1-2月,患者可能因此耽誤最佳的治療時(shí)機(jī);近年來(lái)新發(fā)展的基于液體培養(yǎng)基培養(yǎng)的藥敏實(shí)驗(yàn)方法雖需時(shí)間較短,但由于其依賴于昂貴的儀器,因此使適用地區(qū)受到限制;分子生物學(xué)技術(shù)的迅猛發(fā)展,市場(chǎng)上出現(xiàn)了一批結(jié)核菌耐藥性的快速診斷工具,這些工具的應(yīng)用使得簡(jiǎn)便且快速檢測(cè)出結(jié)核菌的耐藥性成為可能。由于不同地區(qū)流行菌株的主要突變類型和突變頻率不同,這些產(chǎn)品在不同的地區(qū)使用時(shí)的靈敏度不同,因此在某些地區(qū)會(huì)出現(xiàn)靈敏度較低的缺陷。 本研究的目的是,研究中國(guó)不同地區(qū)結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因的優(yōu)勢(shì)突變位點(diǎn)和突變頻率,有利于適用于不同地區(qū)的分子生物學(xué)診斷產(chǎn)品的開(kāi)發(fā),能夠快速、準(zhǔn)確的預(yù)測(cè)結(jié)核菌的耐藥性。 本研究分為兩部分,第一部分為從北京、上海和廣西三個(gè)地區(qū)共收集約380株耐多藥結(jié)核分枝桿菌,藥敏實(shí)驗(yàn)獲得各菌株對(duì)四種一線藥物的耐藥結(jié)果,并且提取基因組DNA,對(duì)三地區(qū)MDR菌株基因組DNA樣本進(jìn)行乙胺丁醇耐藥相關(guān)基因embB擴(kuò)增并測(cè)序以及北京型/非北京型(RD105,DTM-PCR)基因分型;第二部分為對(duì)上海地區(qū)MDR菌株基因組DNA樣本進(jìn)行異煙肼耐藥相關(guān)基因katG基因編碼區(qū)全長(zhǎng)擴(kuò)增并測(cè)序,獲得katG基因的突變特征。 本研究發(fā)現(xiàn),第一部分中:(1)北京型菌株是耐多藥結(jié)核分枝桿菌的主要流行株;北京型和非北京型菌株的比例存在地域分布上的差異;(2)不同地區(qū)MDR菌株的embB基因突變特征存在一定程度的差異,即不同突變位點(diǎn)比例在不同地區(qū)不同。(3)僅僅依靠embB306來(lái)預(yù)測(cè)乙胺丁醇的耐藥性是不夠的,尤其在本研究中的廣西地區(qū)預(yù)測(cè)靈敏度極低,僅能預(yù)測(cè)36.8%;因此提示在不同地區(qū)采用不同的多位點(diǎn)組合來(lái)預(yù)測(cè)MDR菌株乙胺丁醇耐藥性,可以提高靈敏度。 第二部分中:(1)除katG315之外的katG基因編碼區(qū)其他突變位點(diǎn)可能在異煙肼耐藥分子機(jī)制中存在作用,但仍需在更大樣本的菌株群體中和通過(guò)體外遺傳操作來(lái)驗(yàn)證。 (2)對(duì)于MDR菌株異煙肼耐藥性的預(yù)測(cè),通過(guò)檢測(cè)katG基因編碼區(qū)全長(zhǎng)的突變可以獲得與檢測(cè)多個(gè)基因突變相似的高靈敏度。
【關(guān)鍵詞】:結(jié)核菌 耐多藥 耐藥相關(guān)基因突變 基因分型
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:R3416
【目錄】:
  • 中文摘要4-6
  • Abstract6-8
  • 引言8-14
  • 實(shí)驗(yàn)材料與方法14-23
  • 一、實(shí)驗(yàn)材料14-15
  • 1. 實(shí)驗(yàn)儀器14
  • 2. 實(shí)驗(yàn)材料14
  • 3. 溶液配制14-15
  • 4. 培養(yǎng)基配制15
  • 二、實(shí)驗(yàn)方法15-23
  • 實(shí)驗(yàn)結(jié)果23-52
  • 第一部分 耐多藥結(jié)核分枝桿菌乙胺丁醇耐藥基因embB突變研究23-49
  • 1. 耐多藥菌株和藥物敏感菌株(對(duì)照)樣本的組成23
  • 2. 耐多藥菌株的藥敏實(shí)驗(yàn)結(jié)果23-37
  • 3. 耐多藥菌株的北京型/非北京型(RD105)基因分型結(jié)果37-38
  • 4. 耐多藥菌株中北京型/非北京型與乙胺丁醇耐藥性關(guān)系38-39
  • 5. 耐多藥菌株的乙胺丁醇耐藥相關(guān)基因embB基因的突變結(jié)果39-49
  • 第二部分 耐多藥結(jié)核分枝桿菌異煙肼耐藥基因katG突變研究49-52
  • 1. 耐多藥菌株和藥物敏感菌株(對(duì)照)樣本的組成49
  • 2. 異煙肼耐藥菌株和敏感菌株katG基因突變概況49-51
  • 3. 異煙肼耐藥菌株katG基因突變類型和頻率51-52
  • 討論52-59
  • 全文總結(jié)59-60
  • 參考文獻(xiàn)60-65
  • 發(fā)表文章65-66
  • 致謝66-67

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條

1 張雅虹;崔曉芳;王碩;宋從鳳;;tal4基因在水稻白葉枯病菌PXO99~A對(duì)噻枯唑抗性中的作用[J];南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2014年03期

2 李潔;鐘杰;黃軍;趙曉;朱宏建;;植物病原細(xì)菌鏈霉素抗性研究進(jìn)展[J];生物技術(shù)通報(bào);2013年09期

3 盛喜玲;趙玉玲;;結(jié)核分枝桿菌臨床分離株鏈霉素耐藥相關(guān)基因rpsL和rrs突變的研究[J];中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志;2013年11期

4 李強(qiáng);盧洪洲;;耐多藥結(jié)核及泛耐藥結(jié)核診治的新認(rèn)識(shí)[J];診斷學(xué)理論與實(shí)踐;2015年01期

5 崔明全;吳辰斌;汪洋;沈建忠;吳聰明;;耐氟喹諾酮類藥物空腸彎曲菌HRM快速檢測(cè)方法的建立[J];中國(guó)獸醫(yī)科學(xué);2015年05期

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

1 李桂蓮;天津市耐藥結(jié)核病危險(xiǎn)因素及結(jié)核分枝桿菌耐藥分子機(jī)制研究[D];天津醫(yī)科大學(xué);2010年

2 米賢文;新型噬菌體壓電傳感器快速檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌的機(jī)理及其藥敏應(yīng)用效果的研究[D];湖南大學(xué);2013年

3 沈鑫;結(jié)核病復(fù)發(fā)及結(jié)核分枝桿菌二線藥物耐藥性的研究[D];復(fù)旦大學(xué);2012年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 李恒德;脊柱結(jié)核分枝桿菌鏈霉素耐藥株篩選及其耐藥機(jī)制初步探討[D];南華大學(xué);2013年


  本文關(guān)鍵詞:耐多藥結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因的分子流行病學(xué)研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號(hào):291045

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