耐多藥結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因的分子流行病學研究
本文關(guān)鍵詞:耐多藥結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因的分子流行病學研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:耐多藥(Multi-drug Resistant,MDR)結(jié)核菌是指結(jié)核菌至少同時對利福平(Rifampicin, RIF)和異煙肼(Isoniazid,INH)兩種一線抗結(jié)核藥物發(fā)生耐藥。我國耐多藥結(jié)核病患者比例很高,約為9.3%,是世界平均水平的2倍左右。耐多藥結(jié)核病相比較于普通結(jié)核病防控難度高、治療難度大、治愈率低且藥物副作用大。 耐多藥結(jié)核病的防治最關(guān)鍵的是如何在早期快速、準確的診斷出結(jié)核菌的耐藥性;诠腆w培養(yǎng)基培養(yǎng)的傳統(tǒng)藥敏實驗方法雖具有較高的準確性,但需較長時間,一般1-2月,患者可能因此耽誤最佳的治療時機;近年來新發(fā)展的基于液體培養(yǎng)基培養(yǎng)的藥敏實驗方法雖需時間較短,但由于其依賴于昂貴的儀器,因此使適用地區(qū)受到限制;分子生物學技術(shù)的迅猛發(fā)展,市場上出現(xiàn)了一批結(jié)核菌耐藥性的快速診斷工具,這些工具的應(yīng)用使得簡便且快速檢測出結(jié)核菌的耐藥性成為可能。由于不同地區(qū)流行菌株的主要突變類型和突變頻率不同,這些產(chǎn)品在不同的地區(qū)使用時的靈敏度不同,因此在某些地區(qū)會出現(xiàn)靈敏度較低的缺陷。 本研究的目的是,研究中國不同地區(qū)結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因的優(yōu)勢突變位點和突變頻率,有利于適用于不同地區(qū)的分子生物學診斷產(chǎn)品的開發(fā),能夠快速、準確的預測結(jié)核菌的耐藥性。 本研究分為兩部分,第一部分為從北京、上海和廣西三個地區(qū)共收集約380株耐多藥結(jié)核分枝桿菌,藥敏實驗獲得各菌株對四種一線藥物的耐藥結(jié)果,并且提取基因組DNA,對三地區(qū)MDR菌株基因組DNA樣本進行乙胺丁醇耐藥相關(guān)基因embB擴增并測序以及北京型/非北京型(RD105,DTM-PCR)基因分型;第二部分為對上海地區(qū)MDR菌株基因組DNA樣本進行異煙肼耐藥相關(guān)基因katG基因編碼區(qū)全長擴增并測序,獲得katG基因的突變特征。 本研究發(fā)現(xiàn),第一部分中:(1)北京型菌株是耐多藥結(jié)核分枝桿菌的主要流行株;北京型和非北京型菌株的比例存在地域分布上的差異;(2)不同地區(qū)MDR菌株的embB基因突變特征存在一定程度的差異,即不同突變位點比例在不同地區(qū)不同。(3)僅僅依靠embB306來預測乙胺丁醇的耐藥性是不夠的,尤其在本研究中的廣西地區(qū)預測靈敏度極低,僅能預測36.8%;因此提示在不同地區(qū)采用不同的多位點組合來預測MDR菌株乙胺丁醇耐藥性,可以提高靈敏度。 第二部分中:(1)除katG315之外的katG基因編碼區(qū)其他突變位點可能在異煙肼耐藥分子機制中存在作用,但仍需在更大樣本的菌株群體中和通過體外遺傳操作來驗證。 (2)對于MDR菌株異煙肼耐藥性的預測,通過檢測katG基因編碼區(qū)全長的突變可以獲得與檢測多個基因突變相似的高靈敏度。
【關(guān)鍵詞】:結(jié)核菌 耐多藥 耐藥相關(guān)基因突變 基因分型
【學位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2013
【分類號】:R3416
【目錄】:
- 中文摘要4-6
- Abstract6-8
- 引言8-14
- 實驗材料與方法14-23
- 一、實驗材料14-15
- 1. 實驗儀器14
- 2. 實驗材料14
- 3. 溶液配制14-15
- 4. 培養(yǎng)基配制15
- 二、實驗方法15-23
- 實驗結(jié)果23-52
- 第一部分 耐多藥結(jié)核分枝桿菌乙胺丁醇耐藥基因embB突變研究23-49
- 1. 耐多藥菌株和藥物敏感菌株(對照)樣本的組成23
- 2. 耐多藥菌株的藥敏實驗結(jié)果23-37
- 3. 耐多藥菌株的北京型/非北京型(RD105)基因分型結(jié)果37-38
- 4. 耐多藥菌株中北京型/非北京型與乙胺丁醇耐藥性關(guān)系38-39
- 5. 耐多藥菌株的乙胺丁醇耐藥相關(guān)基因embB基因的突變結(jié)果39-49
- 第二部分 耐多藥結(jié)核分枝桿菌異煙肼耐藥基因katG突變研究49-52
- 1. 耐多藥菌株和藥物敏感菌株(對照)樣本的組成49
- 2. 異煙肼耐藥菌株和敏感菌株katG基因突變概況49-51
- 3. 異煙肼耐藥菌株katG基因突變類型和頻率51-52
- 討論52-59
- 全文總結(jié)59-60
- 參考文獻60-65
- 發(fā)表文章65-66
- 致謝66-67
【共引文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前5條
1 張雅虹;崔曉芳;王碩;宋從鳳;;tal4基因在水稻白葉枯病菌PXO99~A對噻枯唑抗性中的作用[J];南京農(nóng)業(yè)大學學報;2014年03期
2 李潔;鐘杰;黃軍;趙曉;朱宏建;;植物病原細菌鏈霉素抗性研究進展[J];生物技術(shù)通報;2013年09期
3 盛喜玲;趙玉玲;;結(jié)核分枝桿菌臨床分離株鏈霉素耐藥相關(guān)基因rpsL和rrs突變的研究[J];中國衛(wèi)生檢驗雜志;2013年11期
4 李強;盧洪洲;;耐多藥結(jié)核及泛耐藥結(jié)核診治的新認識[J];診斷學理論與實踐;2015年01期
5 崔明全;吳辰斌;汪洋;沈建忠;吳聰明;;耐氟喹諾酮類藥物空腸彎曲菌HRM快速檢測方法的建立[J];中國獸醫(yī)科學;2015年05期
中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前3條
1 李桂蓮;天津市耐藥結(jié)核病危險因素及結(jié)核分枝桿菌耐藥分子機制研究[D];天津醫(yī)科大學;2010年
2 米賢文;新型噬菌體壓電傳感器快速檢測結(jié)核分枝桿菌的機理及其藥敏應(yīng)用效果的研究[D];湖南大學;2013年
3 沈鑫;結(jié)核病復發(fā)及結(jié)核分枝桿菌二線藥物耐藥性的研究[D];復旦大學;2012年
中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 李恒德;脊柱結(jié)核分枝桿菌鏈霉素耐藥株篩選及其耐藥機制初步探討[D];南華大學;2013年
本文關(guān)鍵詞:耐多藥結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因的分子流行病學研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:291045
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/shiyanyixue/291045.html