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基于高通量測(cè)序分析早產(chǎn)認(rèn)知障礙大鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)特征

發(fā)布時(shí)間:2020-11-19 01:16
   目的分析早產(chǎn)認(rèn)知障礙大鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)特征,探討腸道菌群改變與早產(chǎn)認(rèn)知障礙的關(guān)系。方法給孕16~17 d Sprague-Dawley大鼠連續(xù)2 d腹腔注射脂多糖(LPS)建立認(rèn)知障礙模型,以腹腔注射PBS為對(duì)照。孕21 d行剖宮術(shù),將早產(chǎn)大鼠隨機(jī)分配給代母鼠喂養(yǎng)。于生后30 d利用Morris水迷宮中的定位航行實(shí)驗(yàn)對(duì)早產(chǎn)大鼠進(jìn)行認(rèn)知評(píng)估,并分為早產(chǎn)認(rèn)知障礙組(n=21)與正常對(duì)照組(n=10)。采用蘇木精-伊紅染色觀察兩組大鼠海馬病理改變,提取各組大鼠糞便進(jìn)行16S rRNA測(cè)序并分析。同時(shí)對(duì)兩組大鼠腸道菌群進(jìn)行主成分分析(PCA)。結(jié)果與對(duì)照組相比,早產(chǎn)認(rèn)知障礙大鼠海馬可見(jiàn)大量神經(jīng)元變性壞死;腸道菌群豐富度及多樣性降低(P0.05);門(mén)水平上變形菌門(mén)豐度增加(P0.05);目、科、屬水平上,普氏菌屬、乳桿菌屬等豐度顯著降低,葡萄球菌科、寡養(yǎng)桿菌屬等豐度顯著增加(P0.05)。PCA顯示兩組大鼠在腸道菌群構(gòu)成上差異明顯。結(jié)論早產(chǎn)認(rèn)知障礙大鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)發(fā)生明顯變化,可為早產(chǎn)認(rèn)知障礙導(dǎo)致的微生態(tài)變化的治療及干預(yù)提供依據(jù)。[中國(guó)當(dāng)代兒科雜志,2019,21(7):701-707]
【部分圖文】:

病理變化,認(rèn)知障礙,平均體重,大鼠


笛?在定位航行實(shí)驗(yàn)前,早產(chǎn)認(rèn)知障礙組大鼠平均體重為109±8g,正常對(duì)照組大鼠平均體重為106±7g,兩組大鼠平均體重比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=1.08,P>0.05)。在定位航行實(shí)驗(yàn)第5天,早產(chǎn)認(rèn)知障礙大鼠找到平臺(tái)的平均時(shí)間為40±5s,明顯長(zhǎng)于正常對(duì)照組(18±4s),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=13.29,P<0.05)。2.2兩組大鼠海馬神經(jīng)元病理變化正常對(duì)照組大鼠海馬神經(jīng)元結(jié)構(gòu)清晰,大小正常,細(xì)胞核呈淡藍(lán)染色,呈圓形、橢圓形排列。早產(chǎn)認(rèn)知障礙組大鼠海馬神經(jīng)元數(shù)目明顯減少,細(xì)胞排列不整齊,可見(jiàn)大量神經(jīng)元變性壞死。見(jiàn)圖1。圖1兩組大鼠海馬神經(jīng)元病理變化(蘇木精-伊紅染色)正常對(duì)照組大鼠海馬神經(jīng)元結(jié)構(gòu)清晰,大小正常,細(xì)胞核呈淡藍(lán)染色;早產(chǎn)認(rèn)知障礙組大鼠海馬神經(jīng)元數(shù)目明顯減少,細(xì)胞排列不整齊,可見(jiàn)大量神經(jīng)元變性壞死。正常對(duì)照組早產(chǎn)認(rèn)知障礙組×100×400

菌群,水平分布,認(rèn)知障礙,擬桿菌


多樣性結(jié)果分析與正常對(duì)照組相比,菌群豐富度指標(biāo)Chao1指數(shù)及Ace指數(shù)在早產(chǎn)認(rèn)知障礙組顯著降低(P<0.05);而代表菌群多樣性的Shannon指數(shù)在早產(chǎn)認(rèn)知障礙組也顯著低于正常對(duì)照組(P<0.05),Simpson指數(shù)在兩組間比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見(jiàn)表1。表2兩組大鼠腸道菌群門(mén)水平優(yōu)勢(shì)菌群比較(x±s,%)組別n擬桿菌門(mén)厚壁菌門(mén)變形菌門(mén)螺旋菌門(mén)正常對(duì)照組1060±1630±125.2±2.43.0±2.0早產(chǎn)認(rèn)知障礙組2151±2029±1214.0±11.73.2±2.3t值1.220.172.330.30P值0.2340.8670.0270.768圖2兩組大鼠腸道菌群門(mén)水平分布橫坐標(biāo)表示所有樣本,縱坐標(biāo)表示每個(gè)菌門(mén)的相對(duì)豐度。早產(chǎn)認(rèn)知障礙組:LS1~LS21;正常對(duì)照組:LT01~LT10。表1兩組大鼠腸道菌群豐富度及多樣性指標(biāo)比較(x±s)組別nChao1AceShannonSimpson正常對(duì)照組10359±21352±153.8±0.50.08±0.05早產(chǎn)認(rèn)知障礙組21335±25332±203.2±0.50.06±0.03t值2.612.843.361.25P值0.0140.0080.0020.2212.4兩組大鼠腸道菌群門(mén)水平差異性分析所有樣本菌群主要由擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes)、厚壁菌門(mén)(Firmicutes)、變形菌門(mén)(Proteobacteria)、螺旋菌門(mén)(Spirochaetae)構(gòu)成,這4個(gè)菌門(mén)包含了所有樣本豐度98.4%的腸道細(xì)菌。其中,擬桿菌門(mén)和厚壁菌門(mén)為大鼠腸道菌群的優(yōu)勢(shì)菌群。早產(chǎn)認(rèn)知障礙組擬桿菌門(mén)、厚壁菌門(mén)及螺旋菌門(mén)豐度與正常對(duì)照組比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),變形菌門(mén)豐度較正常對(duì)照組顯著增加(P<0.05)。見(jiàn)圖2,表2。2.5兩組大鼠腸道菌群目、科、屬水平差異性分析目、科、屬水平上能檢測(cè)到的菌種有97種,取含量前30種進(jìn)行繪圖比較。與正常對(duì)照組比較,早產(chǎn)認(rèn)知障礙組大鼠腸道中條件致病菌寡養(yǎng)桿菌?

菌群,水平分布,認(rèn)知障礙,菌屬


?稈〕鋈現(xiàn)?習(xí)??鼠。本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),與正常對(duì)照組大鼠相比,在定位航行實(shí)驗(yàn)中,早產(chǎn)認(rèn)知障礙大鼠找到平臺(tái)的平均時(shí)間明顯延長(zhǎng),提示存在認(rèn)知障礙。海馬是腦邊緣系統(tǒng)的重要組成部分,是負(fù)責(zé)情感和認(rèn)知功能的關(guān)鍵腦區(qū)[13]。海馬神經(jīng)損傷會(huì)顯著影響大鼠學(xué)習(xí)記憶能力及認(rèn)知功能。本研究中大鼠海馬組織HE染色結(jié)果發(fā)現(xiàn),早產(chǎn)認(rèn)知障礙大鼠海馬組織神經(jīng)元數(shù)目明顯減少,細(xì)胞排列不整齊,可圖4主成分分析第一主成分(PC1)=28.87%表示PC1對(duì)樣品差異的貢獻(xiàn)值;第二主成分(PC2)=19.17%表示PC2對(duì)樣品差異的貢獻(xiàn)值。圖3兩組大鼠腸道菌群目、科、屬水平分布橫坐標(biāo)表示所有樣本,縱坐標(biāo)表示每個(gè)菌群的相對(duì)豐度。早產(chǎn)認(rèn)知障礙組:LS1~LS21;正常對(duì)照組:LT01~LT10。表3兩組大鼠腸道菌群目、科、屬水平優(yōu)勢(shì)菌群比較[M(P25,P75),%]組別n普氏菌屬乳桿菌屬擬桿菌目寡養(yǎng)桿菌屬普雷沃氏菌屬正常對(duì)照組1018.9(17.6,28.6)3.1(1.9,4.3)4.8(3.6,5.9)0.01(0,0.03)2.2(1.1,3.0)早產(chǎn)認(rèn)知障礙組216.2(3.8,10.4)1.0(0.4,3.2)2.0(0.7,4.2)2.14(0.12,4.92)0.2(0.1,1.6)U值28.0051.0051.0013.0046.00P值0.0010.0230.022<0.0010.012嗜冷桿菌屬副桿菌屬葡萄球菌科腸球菌屬梭菌目另枝菌屬0(0,0)0.9(0.7,1.0)0(0,0.01)0.01(0.01,0.02)0.62(0.54,0.81)0.66(0.40,0.77)0.42(0.03,2.89)0.6(0.4,0.8)0.50(0.03,1.28)0.28(0.07,1.39)0.21(0.15,0.45)0.36(0.22,0.60)13.5055.007.0024.0039.0056.00<0.0010.035<0.001<0.0010.0040.039相對(duì)豐度(%)1009080706050403020100其他狹義梭菌屬顫桿菌科另枝菌屬梭菌目未分類(lèi)菌屬腸球菌屬腸單胞菌屬未分類(lèi)葡萄球菌科副桿菌屬未分類(lèi)巴斯德氏菌科支原體科
【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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