發(fā)布時間：2017-03-28 23:08

  本文關(guān)鍵詞：中國8省非結(jié)核分枝桿菌臨床分離株的菌種鑒定，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的：初步了解中國非結(jié)核分枝桿菌（nontuberculosis mycobacterium，NTM）的種類，為非結(jié)核分枝桿菌病的臨床診斷、治療和預防提供重要依據(jù)；評價聚合酶鏈式反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性分析（PCR-RFLP，PRA）和基因測序等方法在NTM鑒定中的作用。 方法： 1.2005年~2012年8年間收集來自中國8�。ò不铡⒏＝�、甘肅、湖南、江西、內(nèi)蒙古、四川和新疆）的省級結(jié)核病防治所/結(jié)核病院使用對硝基苯甲酸（PNB）/噻吩-2-羧酸肼（TCH）鑒別培養(yǎng)基的方法初步鑒定出的610株非結(jié)核分枝桿菌臨床分離株，常規(guī)培養(yǎng)、保存。 2.同時使用PNB/TCH鑒別培養(yǎng)和多位點PCR方法進一步進行分枝桿菌菌種鑒定。 3.采用基于hsp65和rpoB基因的PRA方法將以確定的非結(jié)核分枝桿菌鑒定至種/亞種。對PRA方法不能鑒定出種/亞種者，采用多基因（包括rpoB、hsp65、ITS、gnd、glpK、secA和sodA）測序分析完成鑒定。 結(jié)果： 1.共收集到初步鑒定為NTM的臨床分離菌株610株，，經(jīng)本研究使用PNB/TCH鑒別培養(yǎng)和多位點PCR方法鑒定為53株為結(jié)核分枝桿菌（Mycobacteriumtuberculosis，MTB），其他557株可能為非結(jié)核分枝桿菌。 2.使用PRA和測序方法對這557株進一步鑒定后，發(fā)現(xiàn)了4株為支氣管戈登菌（Gordonia bronchialis），46株鼻疽諾卡菌（Nocardia farcinica）；和507株非結(jié)核分枝桿菌。其中非結(jié)核分枝桿菌共有28種，分別為：66株膿腫分枝桿菌（M. abscessus），106株鳥分枝桿菌（M. avium），17株龜分枝桿菌（M. chelonae），3株哥倫比亞分枝桿菌（M. colombiense），12株偶發(fā)分枝桿菌（M. fortuitum），1株日內(nèi)瓦分枝桿菌（M. genavense），34株戈登分枝桿菌（M. gordonae），1株荷斯坦分枝桿菌（M. holsaticum），209株胞內(nèi)分枝桿菌（M. intracellulare），3株堪薩斯分枝桿菌（M. kansasii），2株熊本分枝桿菌（M. kumamotonense），6株緩黃分枝桿菌（M. lentiflavum），1株馬提尼分枝桿菌（M. mantenii），5株馬賽分枝桿菌（M. marseillense），24株馬西利亞分枝桿菌（M. massiliense），1株摩納哥分枝桿菌（M. monacense），2株新金黃分枝桿菌（M. neoaurum），3株副瘰疬分枝桿菌（M. parascrofulaceum），1株福西亞分枝桿菌（M. phocaicum），2株薩斯喀徹溫分枝桿菌（M. saskatchewanense），1株塞內(nèi)加爾分枝桿菌（M. senegalense），2株首爾分枝桿菌（M. seoulense），2株膿毒分枝桿菌（M. septicum），1株賽特分枝桿菌（M. setense），2株下出分枝桿菌（M. shimoidei），1株M. stomatepiae，3株蘇爾加分枝桿菌（M. szulgai）和2株三重分枝桿菌（M. triplex）。 3.507株非結(jié)核分枝桿菌中，按菌株數(shù)量統(tǒng)計，前9位分別為胞內(nèi)分枝桿菌、鳥分枝桿菌、膿腫分枝桿菌、戈登分枝桿菌、馬西利亞分枝桿菌、龜分枝桿菌、偶發(fā)分枝桿菌、緩黃分枝桿菌和馬賽分枝桿菌。 結(jié)論： 1.共鑒定出28種非結(jié)核分枝桿菌，其中M. marseillense， M.saskatchewanense，M. seoulense，M. kumamotonense，M. stomatepiae，M. mantenii和Gordonia bronchialis6種為國內(nèi)首次發(fā)現(xiàn)。證實在中國具有致病性的非結(jié)核分枝桿菌種類繁多。 2. PRA-rpoB（內(nèi)切酶MspI和HaeIII）和PRA-hsp65（內(nèi)切酶BstPI和HaeIII）方法具有良好的分枝桿菌菌種鑒定效果。 3.聯(lián)合應(yīng)多位點PCR、限制性片段長度多態(tài)性分析（PRA-hsp65和PRA-rpoB）和基因測序技術(shù)可有效的完成分枝桿菌菌種鑒定。
【關(guān)鍵詞】：非結(jié)核分枝桿菌 菌種鑒定 PCR-RFLP 基因測序
【學位授予單位】：南華大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2013
【分類號】：R378.91
【目錄】：

• 中文摘要4-6
• Abstract6-8
• 本研究基金資助項目8-9
• 前言9-11
• 1 材料與方法11-21
• 1.1 材料11-15
• 1.2 方法15-21
• 2 結(jié)果21-31
• 2.1 PNB/TCH 初步鑒定和多位點 PCR 結(jié)果21-22
• 2.2 PRA 結(jié)果22-26
• 2.3 基因測序及聚類分析26-31
• 3 討論31-36
• 參考文獻36-39
• 附錄39-80
• 綜述80-103
• 摘要80
• Abstract80-81
• 1 非結(jié)核分枝桿菌（nontuberculous Mycobacteria，NTM）概述81-82
• 2 熱休克蛋白 65 —聚合酶鏈反應(yīng)—限制性酶切片段長度多態(tài)性82-84
• 3 RNA 聚合酶 β 亞基—聚合酶鏈反應(yīng)—限制性酶切片段長度多態(tài)性84-86
• 4 討論86
• 參考文獻86-92
• 附表92-103
• 成果目錄103-104
• 致謝104

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 劉常宏;沈悅斐;薛雅蓉;彭士明;;大腸桿菌嚴謹型RNA聚合酶的篩選及體內(nèi)轉(zhuǎn)錄活性測定[J];微生物學報;2007年02期

2 黎一葦;于黎;張亞平;;系統(tǒng)發(fā)育研究中“長枝吸引”假象概述[J];遺傳;2007年06期

中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 嚴興;A～2/O固定生物膜法焦化廢水處理系統(tǒng)群落空間演替模式的系統(tǒng)軌跡分析及應(yīng)用[D];上海交通大學;2007年

  本文關(guān)鍵詞：中國8省非結(jié)核分枝桿菌臨床分離株的菌種鑒定，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號：273203