蛋白質(zhì)相互作用結(jié)構(gòu)域PDZ結(jié)合特性的研究方法
發(fā)布時間:2020-05-28 11:33
【摘要】:本部分介紹了一種新的隨機(jī)多肽文庫的構(gòu)建方法,,即用基因組DNA為原料來構(gòu)建隨機(jī)多肽文庫。 一般認(rèn)為,基因組DNA是不能夠直接用來表達(dá)出有生物學(xué)意義的蛋白質(zhì)或多肽。但是,如果我們需要的是隨機(jī)多肽,基因組DNA就可以被認(rèn)為是非常有用的資源。當(dāng)大的基因組DNA被僅識別4個核苷酸的限制性內(nèi)切酶酶切后,產(chǎn)生的短片段DNA可以近似的認(rèn)為是隨機(jī)序列的片段,這樣的短的隨機(jī)片段在本實驗中被用來直接表達(dá)隨機(jī)多肽,成為隨機(jī)多肽文庫。例如人的基因組DNA為2.91×10~9bp,這樣大的基因組DNA經(jīng)識別4個核苷酸的限制性內(nèi)切酶(DpnⅡ或Tsp509I)酶切后,因為這種酶在基因組上平均每隔256bp即有一個酶切位點,因此可以產(chǎn)生約10~7(2.91×10~9/256)個片段。由于每個片段的平均長度為256bp,所以這樣的片段可以編碼85個氨基酸(256/3),又由于每64個密碼子當(dāng)中有3個終止密碼子,所以最后這樣的片段表達(dá)出的多肽的平均長度為21個氨基酸(64/3)。這些片段可以克隆到任何表達(dá)載體中。在這里我們將這些片段連接到用DpnⅡ(Tsp509I)的同尾酶BamHI(EcoRI)預(yù)先酶切的酵母雙雜交載體pGADT7上后,電擊轉(zhuǎn)化大腸桿菌形成隨機(jī)多肽文庫。 在論文中,我們構(gòu)建了兩個這樣的隨機(jī)多肽文庫。一個是用DpnⅡ酶切人基因組DNA,所構(gòu)建的文庫的容量為1.1×10~6cfu。另一個是用Tsp509I酶切人基因組DNA,所構(gòu)建的文庫的容量為1.4×10~7cfu。
【學(xué)位授予單位】:中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2004
【分類號】:R341
【學(xué)位授予單位】:中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué)
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本文編號:2685180
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