發(fā)布時間：2018-08-15 19:02

【摘要】： 目前,人們非常關(guān)注microRNA(miRNA)的生物學(xué)功能,然而研究miRNA生物學(xué)功能的關(guān)鍵之一在于miRNA靶基因的確定�，F(xiàn)如今,miRNA靶基因的確定主要依賴兩種方法,其中生物學(xué)試驗方法主要是利用免疫共沉淀來尋找與AGO蛋白發(fā)生作用關(guān)系的mRNA,或者研究miRNA調(diào)控的mRNA水平和蛋白質(zhì)水平上的一些變化去發(fā)現(xiàn)miRNA靶基因。而物信息學(xué)方法主要根據(jù)miRNA及其靶基因之間的相互作用關(guān)系、miRNA與靶基因的配對情況、miRNA的保守性、靶基因物種間的保守性及miRNA與靶標(biāo)二聚體能量等特征來設(shè)計并實現(xiàn)軟件。 由于2009年甲型流感病毒的大爆發(fā),使得研究人員發(fā)現(xiàn)流感病毒對人類健康的威脅越來越大。根據(jù)過去的研究,我們知道人體內(nèi)部分miRNA對病毒的基因有調(diào)控作用,可以起到對于病毒的抑制的作用,這正啟發(fā)我們應(yīng)該研究人體內(nèi)可調(diào)控流感病毒的miRNA序列及抑制流感病毒復(fù)制和增值的靶位點,這對于我們預(yù)防和治療流感病毒具有非常重要的意義。 本文通過對于流感病毒及miRNA的學(xué)習(xí),以流感病毒基因序列對近幾年的一些重要的靶基因預(yù)測軟件進行比較分析,通過采用生物信息學(xué)研究中廣泛使用的預(yù)測軟件來評價標(biāo)準(zhǔn),進一步總結(jié)預(yù)測算法之間的優(yōu)缺點,同時也為以后的新算法研究提供可參考的數(shù)據(jù)。
[Abstract]:At present, people pay much attention to the biological function of microRNA (miRNA). However, one of the keys to study the biological function of miRNA lies in the identification of target genes of miRNA. Nowadays, the identification of miRNA target genes mainly depends on two methods. The biological method is mainly to use immunoprecipitation to find the mRNAs that interact with AGO protein, or to find miRNA target gene by studying the changes of mRNA level and protein level regulated by miRNA. However, based on the interaction between miRNA and its target genes, the conserved nature of miRNAs and target genes, the conservatism of target gene species and the energy of miRNA and target dimer, the software is designed and implemented by the method of bioinformatics. Due to the outbreak of influenza A virus in 2009, researchers have found that influenza virus is a growing threat to human health. Based on past studies, we know that part of the miRNA in the human body regulates the genes of the virus, which can inhibit the virus. It is suggested that we should study the miRNA sequence of human influenza virus and the target of inhibiting the replication and increment of influenza virus, which is of great significance for the prevention and treatment of influenza virus. Based on the study of influenza virus and miRNA, this paper compares and analyzes some important target gene prediction software in recent years with influenza virus gene sequence, and evaluates the standard by using the widely used prediction software in bioinformatics research. The advantages and disadvantages of the prediction algorithm are summarized, and the reference data are provided for the future research of the new algorithm.
【學(xué)位授予單位】：吉林大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2010
【分類號】：R341

【參考文獻】

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本文編號：2185118