福建省非典型埃爾托霍亂弧菌的遺傳多樣性研究
發(fā)布時(shí)間:2018-06-24 13:41
本文選題:霍亂弧菌 + 非典型埃爾托型。 參考:《中國預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志》2015年12期
【摘要】:目的探索福建省非典型埃爾托霍亂弧菌(aEVC)的進(jìn)化變遷規(guī)律,了解aEVC的變異株種類、基因特征,并分析不同類別變異株對霍亂流行趨勢的影響。方法運(yùn)用單基因片段分析技術(shù),選擇1962-2005年代表性O(shè)1群埃爾托霍亂菌株49株,對ctxB基因擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行序列測定和比對分析,確定ctxB基因型;同時(shí)對毒力因子tcpA和rstR基因分別進(jìn)行古典型(Cl)和埃爾托型(El)特異的PCR擴(kuò)增,確定其基因型別。結(jié)合ctxB、tcpA、rstR3種基因不同型別的組合形式,確定福建省aEVC菌株的多樣性。結(jié)果1986年前菌株ctxB基因以埃爾托型B3型為主占92.00%(23/25),而1994年后菌株以古典型B1型為主占95.83%(23/24)。根據(jù)ctxB、rstR、tcpA3種基因不同型別的組合形式,1986年前菌株88.00%(22/25)表現(xiàn)為埃爾托型基因特征B3、El、El,1994年后菌株100.00%(24/24)表現(xiàn)為雜合型(Hybrid)變異株基因特征B1、El和(或)Cl、El。結(jié)論福建省霍亂菌株存在aEVC進(jìn)化事件。ctxB、rstR、tcpA基因表現(xiàn)為B1、El和(或)Cl、El的雜合型變異株是福建省aEVC的主要特征型別,此類菌株于1994年后全面取代原來流行的埃爾托霍亂弧菌。不同血清型的aEVC變異株對菌株流行能力的影響不同,稻葉型埃爾托型菌株比雜合型流行時(shí)間要長,而小川型雜合型菌株比埃爾托型流行時(shí)間要持久。
[Abstract]:Objective to explore the evolutionary changes of atypical Vibrio cholerae (AEVC) in Fujian Province, to understand the species and gene characteristics of variant strains of AEVC, and to analyze the influence of different variant strains on the epidemic trend of cholera. Methods A single gene fragment analysis technique was used to determine the ctxB genotype by sequencing and comparing the ctxB gene amplification products from 49 representative O1 strains of Elto cholera from 1962 to 2005. At the same time, the virulence factor tcpA and rstR gene were amplified by paleotypic (Cl) and Elto type (El) specific PCR, respectively, and their genotypes were identified. The diversity of aEVC strains in Fujian Province was determined by combining the combination forms of different gene types of ctxBX tcpA rstR3. Results before 1986, 92.00% (23 / 25) of strain ctxB were Elto B3 type, while 95.83% (23 / 24) of the strains mainly belonged to the ancient B _ 1 type (23 / 24) after 1994. According to the combinations of three different types of genes, 88.00% (22 / 25) of the strains showed Elto type gene feature before 1986, 100.00% (24 / 24) of the strains showed hybrid variant gene characteristics B1El and (or) Cli El. after 1994. Conclusion the heterozygous variant of AEVC evolutional event. CtxBX rstRntcpA gene is the main characteristic type of AEVC in Fujian Province. This strain completely replaced the original prevalent Vibrio cholerae after 1994. Different serotype strains of aEVC had different influence on the epidemic ability of the strain. The rice leaf type of Elto type was longer than the heterozygous strain, while the Ogawa type of heterozygote was longer than the Elto type.
【作者單位】: 福建省疾病預(yù)防控制中心;福建省人獸共患病研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;福建醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院教學(xué)基地;
【基金】:福建省自然科學(xué)基金(2014J01282,2012J01315)
【分類號】:R378.3
【相似文獻(xiàn)】
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7 ;[J];;年期
,本文編號:2061711
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