應(yīng)用Label-free技術(shù)研究人牙囊細胞和牙周膜成纖維細胞的差異蛋白質(zhì)
本文選題:牙囊細胞(h + DFCs) ; 參考:《牙體牙髓牙周病學雜志》2015年05期
【摘要】:目的:應(yīng)用Label-free蛋白定量技術(shù)研究牙囊細胞(h DFCs)和牙周膜成纖維細胞(h PDLFs)差異表達蛋白質(zhì),為發(fā)現(xiàn)h DFCs向h PDLFs轉(zhuǎn)化過程中的重要蛋白質(zhì)提供參考。方法:應(yīng)用Label-free蛋白定量技術(shù),結(jié)合ultramate 3000 nano-UPLC軟件,對h DFCs和h PDLFs總蛋白提取液進行蛋白定性定量檢測。然后分別對蛋白質(zhì)的鑒定結(jié)果行重復性、關(guān)聯(lián)性、蛋白相對含量和差異表達蛋白等進行分析;對總體蛋白質(zhì)和差異表達蛋白質(zhì)行生物信息學GO或KEGG分析。結(jié)果:h DFCs和h PDLFs蛋白相對含量及總體蛋白GO分析結(jié)果相似。定量分析顯示,當h DFCs分化形成h PDLFs后,有22個差異表達蛋白質(zhì),其中下調(diào)蛋白15個(P0.05,FC2),上調(diào)蛋白7個(P0.05,FC2)。結(jié)論:h DFCs和h PDLFs蛋白質(zhì)表達譜相似;22個差異表達蛋白質(zhì)為研究h DFCs向h PDLFs的轉(zhuǎn)化機制提供了方向。
[Abstract]:Objective: to study the differential expression of Label-free protein between human dental follicle cells and periodontal ligament fibroblasts by using Label-free protein quantitative technique, and to provide a reference for the discovery of important proteins in the transformation of h DFCs to h PDLFs.Methods: using Label-free protein quantitative technique and ultramate 3000 nano-UPLC software, the protein of h DFCs and h PDLFs total protein extract were detected qualitatively and quantitatively.Then the reproducibility, correlation, relative protein content and differentially expressed protein were analyzed, and the total protein and differential expressed protein were analyzed by bioinformatics go or KEGG.Results the relative contents of DFCs and h PDLFs protein were similar to those of total protein by go analysis.Quantitative analysis showed that there were 22 differentially expressed proteins when h DFCs differentiated into h PDLFs, including 15 down-regulated proteins (P0.05FC2) and 7 up-regulated proteins (P0.05FC2P).Conclusion the protein expression profiles of h DFCs and h PDLFs are similar, and 22 differentially expressed proteins provide a direction for studying the transformation mechanism of h DFCs to h PDLFs.
【作者單位】: 軍事口腔醫(yī)學國家重點實驗室 陜西省口腔醫(yī)學重點實驗室 第四軍醫(yī)大學口腔醫(yī)院正畸科;解放軍第
【基金】:國家自然科學基金面上項目(81271176)
【分類號】:R329.2
【共引文獻】
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,本文編號:1740856
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