本文選題：剛地弓形蟲　切入點：棒狀體蛋白　出處：《中國病原生物學(xué)雜志》2015年06期

【摘要】：目的通過在線生物程序分析剛地弓形蟲(Toxoplasma gondii)棒狀體蛋白12(ROP12)的生物信息學(xué)特性。方法通過在線ProtParam、SOSUI、SOPMA、TMHMM、MotifScan及SYFPEITHI等程序,同時結(jié)合DNASTAR、DNAMAN生物信息學(xué)軟件,分析TgROP12蛋白的生物學(xué)特性,如理化性質(zhì)、二級結(jié)構(gòu)、結(jié)構(gòu)域及抗原表位等。結(jié)果TgROP12蛋白含有236個氨基酸,其為分子式C1125H1786N308O360S3,其分子質(zhì)量和理論等電點分別為25.48ku和4.53。TgROP12蛋白具有信號肽序列和跨膜結(jié)構(gòu)區(qū)域,其二級結(jié)構(gòu)中β-轉(zhuǎn)角和無規(guī)則卷曲分別占7.20%和44.92%;TgROP12蛋白含有8個親水性較高(臨界值為2.0)的區(qū)域,10個表面可及性較高(臨界值為1.9)的區(qū)域;TgROP12蛋白含有保守結(jié)構(gòu)區(qū)域和翻譯后修飾位點各6個,并含有9個B細胞抗原表位和6個T細胞抗原表位。結(jié)論生物信息學(xué)分析顯示TgROP12蛋白的免疫原性較好,可作為弓形蟲病疫苗候選分子。
[Abstract]:Objective to analyze the bioinformatics characteristics of Toxoplasma gondii (Toxoplasma gondii) rodlike protein 12 (ROP12). Methods the bioinformatics of TgROP12 protein was analyzed by using the online program ProtParamia SOPMAI TMHMMMMA motifScan and SYFPEITHI, combined with the DNASTARDNAMAN bioinformatics software, and analyzed the bioinformatics of Toxoplasma gondii (Toxoplasma gondii). Results the TgROP12 protein contains 236 amino acids, which is the molecular formula C1125H1786N308O360S3. Its molecular weight and theoretical isoelectric point are 25.48ku and 4.53.TgROP12 proteins with signal peptide sequence and transmembrane structure region, respectively. In its secondary structure, 尾 -rotation angle and irregular crimp accounted for 7.20% and 44.92%, respectively. TgROP12 protein contained 8 regions with high hydrophilicity (critical value 2.0), and 10 regions with higher surface accessibility (critical value 1.9) and TgROP12 protein with conserved structure. And 6 posttranslational modification sites, There are 9 B cell antigen epitopes and 6 T cell antigen epitopes. Conclusion Bioinformatics analysis shows that TgROP12 protein has good immunogenicity and can be used as candidate molecule for Toxoplasma gondii vaccine.
【作者單位】： 河北北方學(xué)院病原生物與免疫學(xué)研究所;
【基金】：河北北方學(xué)院校級重大課題(No.ZD201312)
【分類號】：R382.5

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本文編號：1677153