本文選題：剛地弓形蟲　切入點：棒狀體蛋白　出處：《中國病原生物學雜志》2015年06期

【摘要】：目的通過在線生物程序分析剛地弓形蟲(Toxoplasma gondii)棒狀體蛋白12(ROP12)的生物信息學特性。方法通過在線ProtParam、SOSUI、SOPMA、TMHMM、MotifScan及SYFPEITHI等程序,同時結合DNASTAR、DNAMAN生物信息學軟件,分析TgROP12蛋白的生物學特性,如理化性質(zhì)、二級結構、結構域及抗原表位等。結果TgROP12蛋白含有236個氨基酸,其為分子式C1125H1786N308O360S3,其分子質(zhì)量和理論等電點分別為25.48ku和4.53。TgROP12蛋白具有信號肽序列和跨膜結構區(qū)域,其二級結構中β-轉角和無規(guī)則卷曲分別占7.20%和44.92%;TgROP12蛋白含有8個親水性較高(臨界值為2.0)的區(qū)域,10個表面可及性較高(臨界值為1.9)的區(qū)域;TgROP12蛋白含有保守結構區(qū)域和翻譯后修飾位點各6個,并含有9個B細胞抗原表位和6個T細胞抗原表位。結論生物信息學分析顯示TgROP12蛋白的免疫原性較好,可作為弓形蟲病疫苗候選分子。
[Abstract]:Objective to analyze the bioinformatics characteristics of Toxoplasma gondii (Toxoplasma gondii) rodlike protein 12 (ROP12). Methods the bioinformatics of TgROP12 protein was analyzed by using the online program ProtParamia SOPMAI TMHMMMMA motifScan and SYFPEITHI, combined with the DNASTARDNAMAN bioinformatics software, and analyzed the bioinformatics of Toxoplasma gondii (Toxoplasma gondii). Results the TgROP12 protein contains 236 amino acids, which is the molecular formula C1125H1786N308O360S3. Its molecular weight and theoretical isoelectric point are 25.48ku and 4.53.TgROP12 proteins with signal peptide sequence and transmembrane structure region, respectively. In its secondary structure, 尾 -rotation angle and irregular crimp accounted for 7.20% and 44.92%, respectively. TgROP12 protein contained 8 regions with high hydrophilicity (critical value 2.0), and 10 regions with higher surface accessibility (critical value 1.9) and TgROP12 protein with conserved structure. And 6 posttranslational modification sites, There are 9 B cell antigen epitopes and 6 T cell antigen epitopes. Conclusion Bioinformatics analysis shows that TgROP12 protein has good immunogenicity and can be used as candidate molecule for Toxoplasma gondii vaccine.
【作者單位】： 河北北方學院病原生物與免疫學研究所;
【基金】：河北北方學院校級重大課題(No.ZD201312)
【分類號】：R382.5

【參考文獻】

相關期刊論文 前10條

1 文雪霞;陳化蘭;熊永忠;王秀榮;;抗原表位鑒定方法的研究進展[J];中國畜牧獸醫(yī);2012年07期

2 呂燕波,萬瑛,吳玉章;SARS病毒基因組所編碼的E蛋白的二級結構和B細胞表位預測[J];免疫學雜志;2003年06期

3 梁前進;王鵬程;白燕榮;;蛋白質(zhì)磷酸化修飾研究進展[J];科技導報;2012年31期

4 姜錚;王芳;何湘;劉大偉;陳宣男;趙紅慶;黃留玉;袁靜;;蛋白質(zhì)磷酸化修飾的研究進展[J];生物技術通訊;2009年02期

5 張鳳珍;李景峰;;弓形蟲疫苗研究進展[J];畜牧獸醫(yī)科技信息;2010年07期

6 王海龍;殷麗天;孟曉麗;申金雁;劉紅麗;殷國榮;;剛地弓形蟲棒狀體蛋白17基因的克隆、表達及抗原性分析(英文)[J];中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志;2012年01期

7 萬濤,孫濤,吳加金;蛋白順序性抗原決定簇的多參數(shù)綜合預測[J];中國免疫學雜志;1997年06期

8 張曉磊;張進順;賈曉暉;徐云鵬;張穎;王春苗;王燕;盧致民;趙建玲;賈天軍;;剛地弓形蟲ROP11基因的克隆及生物信息學分析[J];中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志;2013年06期

9 趙煥閣;韋yN;黃用豪;梁麗娟;林映瑩;譚光宏;;弓形蟲ROP18基因原核表達載體的構建及表達[J];中國病原生物學雜志;2013年06期

10 張曉磊;張麗騫;王春苗;姜文靜;賈天軍;郭玲玲;張進順;;弓形蟲ROP11核酸疫苗免疫保護作用的研究[J];中國病原生物學雜志;2014年10期

【共引文獻】

相關期刊論文 前10條

1 和智君,汪旭;阿托品對中國倉鼠V79細胞有絲分裂過程的影響[J];癌變.畸變.突變;1999年03期

2 徐忠東,彭景中;線粒體與細胞凋亡[J];安徽教育學院學報;2001年06期

3 袁鷺;周傳江;蒲德永;;Cu~(2+)脅迫誘導花鰱血細胞凋亡的研究[J];安徽農(nóng)學通報(上半月刊);2009年03期

4 侯麗霞;劉新;張玉喜;楊洪兵;;《細胞生物學》緒論課教學實踐與探討[J];安徽農(nóng)學通報(上半月刊);2011年17期

5 康潔,余曉麗;植物細胞凋亡機理的研究[J];安徽農(nóng)業(yè)科學;2005年08期

6 朱道圩;楊宵;理莎莎;符真珠;毛俊;;流式細胞儀在果樹作物倍性鑒定上的應用[J];安徽農(nóng)業(yè)科學;2006年24期

7 陳合;張強;趙燕;;復合酶降解玉米秸稈工藝條件的研究[J];安徽農(nóng)業(yè)科學;2007年29期

8 梁秀麗;方麗云;呂曉麗;龔國琴;付云飛;魏戰(zhàn)勇;;豬細小病毒Vaccine株VP2基因克隆與抗原性分析[J];安徽農(nóng)業(yè)科學;2008年01期

9 李倩;姚淑霞;;非洲豬瘟病毒VP73蛋白的B細胞表位預測[J];安徽農(nóng)業(yè)科學;2008年18期

10 石岳香;周敏;唐忠海;饒力群;;長春花內(nèi)生真菌的分離及鑒定[J];安徽農(nóng)業(yè)科學;2008年29期

相關會議論文 前10條

1 呂金印;陸璃;高俊鳳;;不同劑量~(60)Co輻照對小麥葉片保護酶活性的影響[A];中國科協(xié)2005年學術年會論文集——核科技、核應用、核經(jīng)濟論壇[C];2005年

2 崔保安;魏戰(zhàn)勇;;豬細小病毒vaccine株VP2基因克隆與抗原性分析[A];河南省畜牧獸醫(yī)學會第七屆理事會第二次會議暨2008年學術研討會論文集[C];2008年

3 楊筱珍;吳旭干;姚桂桂;成永旭;王春琳;;三疣梭子蟹第一次卵巢發(fā)育過程中卵母細胞和卵泡細胞超微結構的觀察[A];2008年上海市動物學會學術會議論文集（一）[C];2008年

4 馬勇杰;李紅;許凱黎;古宏晨;;人肺腺癌細胞SPC-A-1與人正常肺WI-38對納米顆粒吞噬作用的比較研究[A];上海市顆粒學會2005年年會論文集[C];2005年

5 潘景芝;許延鐸;王琦;;玉竹內(nèi)生真菌的分離鑒定及其化學成分的初步研究[A];第八屆海峽兩岸菌物學學術研討會論文集[C];2007年

6 余杰;;中國蕈菌產(chǎn)品研究[A];首屆中國蕈菌與健康高峰論壇論文集[C];2010年

7 張銀花;李秋明;孫英健;;愛普里諾霉素對N2a細胞增殖的影響[A];中國畜牧獸醫(yī)學會食品衛(wèi)生學分會第十一次學術研討會論文集[C];2010年

8 劉超;邱亞峰;馬志永;;α-皰疹病毒與宿主細胞骨架相互作用的研究進展[A];中國畜牧獸醫(yī)學會獸醫(yī)公共衛(wèi)生學分會第二次學術研討會論文集[C];2010年

9 張艷普;桑潤滋;孫樹春;田樹軍;;幼畜與成年畜超排卵發(fā)育潛能差異研究進展[A];中國畜牧獸醫(yī)學會動物繁殖學分會第十五屆學術研討會論文集（下冊）[C];2010年

10 時麗冉;白麗榮;;遺傳學與細胞生物學教學中交叉滲透問題的探討[A];高等院校遺傳學教學改革探索[C];2010年

相關博士學位論文 前10條

1 白方方;哈維氏弧菌VHH溶血素對牙鲆組織細胞的侵染作用及誘導細胞凋亡作用研究[D];中國海洋大學;2010年

2 李惠華;龍眼體胚發(fā)生過程中激素代謝和信號轉導相關基因的克隆與表達[D];福建農(nóng)林大學;2010年

3 趙景霞;納米氧化鋅對海馬神經(jīng)元電生理特性的影響及對PC12細胞生物學效應的機制研究[D];南開大學;2010年

4 山廣志;Hsp90抑制劑—格爾德霉素的結構優(yōu)化及抗病毒構效關系研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學院;2009年

5 晏杰;Aurora B對Bacp/Nlp的磷酸化調(diào)控及其參與胞質(zhì)分裂的機制研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學院;2009年

6 趙進慧;膜計算仿生優(yōu)化算法及應用研究[D];浙江大學;2010年

7 屈嘯聲;姜荊提取物抑菌活性的熱動力學研究[D];浙江大學;2009年

8 馬丹;溫度敏感性PNIPAAm-g-PDMS智能表面的制備、性能研究及在細胞培養(yǎng)中的應用[D];浙江大學;2010年

9 張鶯鶯;中國主要牛種肌肉組織基因表達譜特征比較分析[D];西北農(nóng)林科技大學;2010年

10 王立;肌動蛋白網(wǎng)架體系在粘附培養(yǎng)哺乳動物細胞胞質(zhì)分裂變形中的作用[D];太原理工大學;2010年

相關碩士學位論文 前10條

1 潘媛;不同油菜品種硼吸收利用差異與細胞壁組分關系的研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學;2010年

2 龔文芳;棉花抗細胞凋亡基因GhDAD1的克隆、定位及表達分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學;2010年

3 司武陽;磷脂酶A1產(chǎn)生菌的選育[D];安徽工程大學;2010年

4 廖甜甜;白細胞圖像語義識別分類的研究[D];南昌航空大學;2010年

5 吳]};MGF對骨骼肌衛(wèi)星細胞激活的影響及與其增殖的量效關系[D];上海體育學院;2010年

6 馬月;家蠶凋亡相關基因BmICAD的表達及其功能研究[D];浙江理工大學;2010年

7 江艷;BmCycH基因及其在家蠶中表達特性的研究[D];浙江理工大學;2010年

8 武永德;兩種不同來源樺褐孔菌多糖的抗氧化與免疫活性的研究[D];浙江理工大學;2010年

9 饒杰;二維硅納米模具的制作工藝研究[D];大連理工大學;2010年

10 胡翔;楊樹與玉米細胞周期蛋白基因家族全基因組研究[D];安徽農(nóng)業(yè)大學;2010年

【二級參考文獻】

相關期刊論文 前10條

1 張莉蕓,李小峰,胡學芳,趙春陽,魏華,王彩虹,曹金;間接免疫熒光法和免疫印跡法聯(lián)合檢測抗聚角蛋白微絲蛋白抗體對類風濕關節(jié)炎的診斷價值[J];中華風濕病學雜志;2004年06期

2 李大江;劉焱斌;劉凱;;生物信息學在未來感染病學教學中的地位和作用[J];華西醫(yī)學;2006年03期

3 趙凌志;劉穎;覃征;;Weighted SVM在蛋白質(zhì)磷酸化位點預測中的應用[J];計算機工程與應用;2006年03期

4 張愛宏,劉國慶;放射性同位素標記法檢測脂蛋白脂肪酶活性及其應用[J];中國動脈硬化雜志;2003年06期

5 陳興,王更銀,叢愛麗,張立,許素菊;人DAO氨基酸序列片段B-細胞表位的多參數(shù)預測[J];免疫學雜志;2000年03期

6 呂燕波,萬瑛,吳玉章;SARS病毒基因組所編碼的E蛋白的二級結構和B細胞表位預測[J];免疫學雜志;2003年06期

7 劉婷;王文禮;姜麗麗;;磷酸化蛋白質(zhì)組學研究現(xiàn)狀[J];內(nèi)蒙古醫(yī)學院學報;2007年04期

8 張倩;楊振;安學麗;王愛麗;李巧云;晏月明;;蛋白質(zhì)的磷酸化修飾及其研究方法[J];首都師范大學學報(自然科學版);2006年06期

9 車發(fā)云,夏其昌;磷酸化底物肽的硫代磷酸化及熒光標記[J];生物化學與生物物理學報;2000年01期

10 車發(fā)云,邵曉霞,徐來根,曾嶸,夏其昌;毛細管電泳非放射分析蛋白質(zhì)和多肽磷酸化[J];生物化學與生物物理學報;1997年04期

相關博士學位論文 前2條

1 楊秋林;乳酸孔球菌表達口服弓形蟲基因疫苗的研究[D];蘇州大學;2001年

2 杜承;惡性瘧原蟲Pf332抗原的免疫原性分析[D];吉林大學;2010年

【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 白雪源,陳香美,邱強;人腎高親和力鈉離子依賴性二羧酸轉運蛋白基因的克隆和生物信息學分析[J];中國生物化學與分子生物學報;2002年04期

2 譚從娥;王米渠;馮文哲;徐全壹;;生物信息學分析寒證海量數(shù)據(jù)的探索[J];中華中醫(yī)藥學刊;2008年12期

3 程勇前;成軍;劉妍;王琳;徐東平;鐘彥偉;曲建慧;趙平;;鈣離子調(diào)節(jié)親環(huán)素配體及其不同剪接體的克隆及生物信息學分析[J];醫(yī)學研究生學報;2008年05期

4 楊向東,王仁,劉俊文,唐蔚青,李紅霞,王抒;一個新的人突觸相關蛋白基因的生物信息學分析[J];中國動脈硬化雜志;2004年01期

5 張艷宇,馬平,陸一鳴,呂麗萍,姜升陽,周錫鵬,孫樹漢,許金波;尖吻蝮蛇類凝血酶基因的克隆及生物信息學分析[J];中國實驗血液學雜志;2005年04期

6 張孝勇;崔光彬;杜滂;馬克軍;王亞蓉;韓葦;顏真;張英起;魏經(jīng)國;;兔大電導鈣敏感性鉀離子通道β亞基的克隆及生物信息學分析[J];第四軍醫(yī)大學學報;2007年09期

7 蔡群芳;鄔強;閆玉蘭;呂剛;;歐猥迭宮絳蟲谷胱甘肽轉移酶1基因序列與功能的生物信息學分析[J];海南醫(yī)學院學報;2013年05期

8 魏鎖成;鞏轉娣;韋敏;;雄兔垂體GnRHR的序列測定與生物信息學分析[J];中國實驗動物學報;2011年01期

9 尹積榮;楊凱;白玉興;王邦康;;牙齒發(fā)育相關基因Osr2的生物信息學分析[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學進展;2011年14期

10 周金華;朱濤;李紅雨;徐鋼;王世宣;周劍鋒;盧運萍;馬丁;;基于WEB頁面的生物信息學分析平臺的構建及其應用[J];中國現(xiàn)代醫(yī)學雜志;2006年17期

相關會議論文 前10條

1 焦斐;閻萍;梁春年;郭憲;包鵬甲;裴杰;丁學智;褚敏;吳曉云;劉建;;牛FAS基因的生物信息學分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學會養(yǎng)牛學分會2011年學術研討會論文集[C];2011年

2 唐愛發(fā);余振東;桂耀庭;郭新;李賢新;周錦堂;朱輝;蔡志明;;SPACA4基因在人和小鼠的表達及其生物信息學分析[A];遺傳學進步與人口健康高峰論壇論文集[C];2007年

3 劉惠君;譚宇蓉;劉持;向陽;屈飛;秦曉群;;BRS-3相互作用新基因的生物信息學分析及功能研究[A];湖南省生理科學會2008年度學術年會論文摘要匯編[C];2008年

4 黃浩;陸啟軒;陳臨溪;楊莉;毛小環(huán);李蘭芳;秦旭平;曹建剛;;APJ受體的生物信息學分析[A];全國第十二屆生化與分子藥理學學術會議論文集[C];2011年

5 陳大清;吳功慶;李亞男;;淹水脅迫下薏苡根系adh基因的克隆及其生物信息學分析[A];2005'海峽兩岸植物生理與分子生物學教學研討會論文集[C];2005年

6 田琪琳;施定基;賈曉會;王曉燕;黃希文;何培民;;真核藻PEPC的生物信息學分析[A];中國藻類學會第八次會員代表大會暨第十六次學術討論會論文摘要集[C];2011年

7 陳玲;朱玲玲;史春梅;季晨博;郭錫熔;;miR-146b靶基因預測和生物信息學分析[A];2012年江浙滬兒科學術年會暨浙江省醫(yī)學會兒科學分會學術年會、兒內(nèi)科疾病診治新進展國家級學習班論文匯編[C];2012年

8 苑贊;趙錦;劉孟軍;;棗花粉過敏原Zizj1基因的克隆與生物信息學分析[A];第八屆全國干果生產(chǎn)、科研進展學術研討會論文集[C];2013年

9 王玲;高蓮;李健;賴松家;;牛FoxO3基因的cDNA克隆及生物信息學分析[A];第五屆中國畜牧科技論壇論文集[C];2011年

10 李婷;張英杰;劉月琴;李雪梅;李蘭會;;反芻動物INHA基因編碼區(qū)生物信息學分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學會養(yǎng)羊學分會2014年全國養(yǎng)羊生產(chǎn)與學術研討會議論文集[C];2014年

相關博士學位論文 前4條

1 陳蕾;原始蛋白酶結構功能的生物信息學分析及化學基礎[D];山東師范大學;2009年

2 蘇志熙;幾種哺乳動物表達序列標簽（EST）生物信息學分析[D];浙江大學;2006年

3 趙佳媛;靈長類二氧化碳感知通路相關基因的進化及生物信息學分析[D];復旦大學;2010年

4 馬永平;含質(zhì)粒人兩歧雙歧桿菌的分離、質(zhì)粒測序和生物信息學分析[D];重慶醫(yī)科大學;2005年

相關碩士學位論文 前10條

1 曹峰;小鼠胚胎干細胞核心轉錄因子調(diào)控網(wǎng)絡的生物信息學分析[D];西北農(nóng)林科技大學;2008年

2 王翊;CEM15基因的生物信息學分析[D];電子科技大學;2005年

3 王芳;一個家蠅未知功能基因的克隆及其生物信息學分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學;2011年

4 王林;腸三葉因子受體的分離、鑒定及其生物信息學分析[D];第三軍醫(yī)大學;2009年

5 王斌;C-反應蛋白在脲變性過程中的折疊及其生物信息學分析[D];蘭州大學;2012年

6 呂素芳;交鏈孢菌基因p42A的原核表達、純化及生物信息學分析[D];安徽農(nóng)業(yè)大學;2006年

7 夏飛虹;Reticulon 3與Fibulin 5的生物信息學分析及相互作用[D];中南大學;2013年

8 馬倩;蛋白質(zhì)泛素化的生物信息學分析[D];中國科學技術大學;2011年

9 謝冰心;擬南芥SPO11基因的生物信息學分析[D];鄭州大學;2014年

10 王晨;小麥基因組中鈣依賴型蛋白激酶家族的生物信息學分析[D];華中科技大學;2008年

，

本文編號：1677153