中間神經(jīng)元前體細胞株GE6在不同分化條件下小RNA的表達
本文選題:小RNA 切入點:小RNA芯片 出處:《生物醫(yī)學工程學雜志》2015年06期 論文類型:期刊論文
【摘要】:本研究通過分析小RNA(microRNAs)在大鼠大腦中間神經(jīng)元前體細胞株GE6體外分化中的表達,篩選出在中間神經(jīng)元前體細胞系分化成熟過程中特異性表達的小RNA,并預測分析其可能在此過程中的功能。實驗中,將GE6在三種不同條件下培養(yǎng),即:不加入任何其他生長因子,正常分化培養(yǎng)4天的GE6(Ge6_4d);加入骨形態(tài)發(fā)生蛋白-2(BMP2)后分化培養(yǎng)4天的GE6(Ge6_bmp2);以及加入音猥因子(SHH)后分化培養(yǎng)4天的GE6(Ge6_shh)。設陰性對照組為未分化的GE6(Ge6_u)。四組GE6細胞進行細胞免疫熒光染色、qRT-PCR以及小RNA芯片檢測分析。通過四組細胞的兩兩比較、篩選及分析發(fā)現(xiàn),多種小RNA在GE6細胞的分化過程中含量有明顯變化。miR-710、miR-290-5p和miR-3473等在加入分泌因子BMP2的GE6細胞中含量顯著上調。這些小RNA可能對大鼠中間神經(jīng)元分化起到重要的調控作用。
[Abstract]:The purpose of this study was to investigate the expression of microRNAs in the differentiation of rat brain interneuron precursor cell line GE6 in vitro. Small RNAs specifically expressed during the differentiation and maturation of intermediate neuron precursor cell lines were screened and their functions were predicted and analyzed. In the experiment, GE6 was cultured under three different conditions, namely, no addition of any other growth factors, GE6Ge 6d after normal differentiation culture; GE6Ge 6bmp2T after adding bone morphogenetic protein (BMP2) and GE6Ge 6bmp2C after differentiation culture; GE6Ge 6hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhof differentiation culture 4 days after normal differentiation and culture. The negative control group was divided into undifferentiated GE6Ge 6UU cells. The GE6 cells of the four groups were immunized with cell immunity. The cells of the four groups were immunized with GE6Ge 6U cells. Fluorescence staining qRT-PCR and small RNA microarray analysis were used to compare the four groups of cells. Screening and analysis revealed, There were significant changes in the contents of several small RNA during the differentiation of GE6 cells. MiR-710 miR-290-5p and miR-3473 were significantly up-regulated in GE6 cells added with secretory factor BMP2. These small RNA may play an important role in regulating the differentiation of rat intermediate neurons.
【作者單位】: 四川大學華西第二醫(yī)院發(fā)育與干細胞研究所;中國科學院神經(jīng)科學研究所;
【基金】:國家自然科學基金資助項目(30971633,31171045)
【分類號】:R338;Q78
【相似文獻】
相關期刊論文 前10條
1 張晶 ,王釗;核內RNA的轉化(譯文)[J];生命的化學;2002年04期
2 ;Activity of HDV ribozymes to trans-cleave HCV RNA[J];World Journal of Gastroenterology;2002年04期
3 戚中田;任浩;;病毒研究的嶄新技術——RNA干擾[J];國外醫(yī)學(微生物學分冊);2003年02期
4 戴鋼;可用于研究RNA干擾的試劑盒簡介[J];生物工程學報;2003年04期
5 戴鋼;可用于研究RNA干擾的試劑盒簡介[J];中國生物化學與分子生物學報;2003年04期
6 王若石;生命的起源——“RNA世界論”假說[J];生物學通報;2003年03期
7 楊笑菡,胡勁松,楊章民,王一理,司履生;RNA研究進展[J];中華病理學雜志;2003年03期
8 郭培宣;國際RNA的基礎和應用研究近況[J];自然科學進展;2003年08期
9 陳吉剛,鄭肖娟,龔輝,周繼勇;RNA干擾研究進展[J];中國預防獸醫(yī)學報;2004年02期
10 張世國,胡成進;單層培養(yǎng)細胞總RNA的快速提取方法[J];實用醫(yī)藥雜志;2004年04期
相關會議論文 前10條
1 李艷;嚴明;;RNA干擾[A];第一屆全國化學工程與生物化工年會論文摘要集(下)[C];2004年
2 郭曉紅;周忠孝;吳明煜;;RNA干涉的分子機制及技術研究進展[A];中國生理學會論文匯編2005年第一期[C];2005年
3 李濤;李前忠;;Prediction of RNA binding sites in proteins from sequence[A];第四屆全國生物信息學與系統(tǒng)生物學學術大會論文集[C];2010年
4 Jian-Hua Yang;Liang-Hu Qu;;ChIPBase:decoding transcriptional regulation of long non-coding RNA and microRNA genes from ChIP-Seq data[A];生命的分子機器及其調控網(wǎng)絡——2012年全國生物化學與分子生物學學術大會摘要集[C];2012年
5 戚益軍;;植物小RNA和長非編碼RNA[A];生命的分子機器及其調控網(wǎng)絡——2012年全國生物化學與分子生物學學術大會摘要集[C];2012年
6 周葉欣;謝建平;;小分子調控RNA研究進展[A];重慶微生物學會第九屆會員代表大會暨學術年會論文摘要集[C];2009年
7 高光俠;;Inhibition of Retroviral RNA Production by ZAP, a CCCH-type Zine Finger Protein[A];首屆中國青年學者微生物遺傳學學術研討會論文摘要集[C];2002年
8 陳春龍;屈良鵠;;計算機RNA組學:模式生物基因組中BoxC/D snoRNA基因的系統(tǒng)分析[A];第四屆全國RNA進展研討會論文集[C];2005年
9 張文炳;金準智;鄒憲武;;RNA發(fā)夾結構折疊的動力學[A];第十次中國生物物理學術大會論文摘要集[C];2006年
10 Weihua Wang;Wei Wang;Zhen Yan;Jinghua Yang;;The mechanisms of Alu RNA transcription induced by oxidative stress[A];生命的分子機器及其調控網(wǎng)絡——2012年全國生物化學與分子生物學學術大會摘要集[C];2012年
相關重要報紙文章 前10條
1 瀘州醫(yī)學院副教授、科普作家 周志遠;“大頭兒子”與環(huán)狀RNA[N];第一財經(jīng)日報;2014年
2 董映璧;美發(fā)現(xiàn)基因調控可回應“RNA世界”[N];科技日報;2006年
3 張忠霞;特制RNA輕推一下,就能“喚醒”基因[N];新華每日電訊;2007年
4 聶翠蓉;RNA:縱是配角也精彩[N];科技日報;2009年
5 馮衛(wèi)東 王小龍;英在地球早期環(huán)境模擬條件下合成類RNA[N];科技日報;2009年
6 記者 常麗君;新技術讓研究進入單細胞內RNA的世界[N];科技日報;2011年
7 周玉 樊麗 高惠君;“華工—華大”創(chuàng)新班學子繪制首張切葉蟻RNA編輯圖譜[N];科技日報;2014年
8 本報記者 房琳琳;小分子RNA:生命活動“調控劑”[N];科技日報;2007年
9 記者 李含;諾獎得主引領學子探尋RNA微觀世界[N];新清華;2007年
10 記者 聶翠蓉;細胞“垃圾”也能變廢為寶[N];科技日報;2008年
相關博士學位論文 前10條
1 鄔開朗;RNA干擾在抑制病毒基因表達與復制中的作用研究[D];武漢大學;2005年
2 王立坤;RNA-seq數(shù)據(jù)的處理與應用[D];吉林大學;2012年
3 高愛保;重金屬誘導長江華溪蟹RNA差異顯示及定量分析[D];山西大學;2011年
4 沈梅;RNA沉默抑制子的生化和結構研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學院;2009年
5 劉振棟;包含假結的RNA結構預測算法研究[D];山東大學;2014年
6 李振亞;人肝臟特異性表達的小RNA-miR-122表達調控機制與功能的研究[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學;2010年
7 趙陽洋;對具有復雜結構的偽扭結RNA的組合分析[D];南開大學;2012年
8 田男;Gabra-3基因A至ⅠRNA編輯位點的鑒定及其分子機制的研究[D];浙江大學;2010年
9 何國平;RNA干擾技術用于哺乳動物細胞中報告基因、端粒酶相關基因的表達抑制研究[D];四川大學;2005年
10 李朝陽;RNA干擾下調cyclin T1蛋白的表達及其對靶細胞和HIV-1的影響[D];武漢大學;2005年
相關碩士學位論文 前10條
1 孫曉娜;針對HIV-1 vpr基因的RNA干擾作用研究[D];北京工業(yè)大學;2010年
2 樊梅娜;幾種RNA沉默抑制蛋白的表達純化及沉默抑制特性分析[D];山東農業(yè)大學;2012年
3 侯繼業(yè);RNA干擾技術用于流感病毒防治的探索研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2010年
4 周芳;家蠶細胞中RISC復合物結合小RNA的分離、鑒定與分析[D];浙江理工大學;2013年
5 陳志強;二甲亞砜通過作用于靶標RNA聚合酶提高轉錄活性[D];武漢大學;2005年
6 蘇楊;LMW RNA分離方法改進及與人類胚胎發(fā)育相關miRNA的克隆表達[D];暨南大學;2007年
7 丁月芹;五種鼠基因組中4.5S RNA基因拷貝數(shù)的鑒定與分析[D];曲阜師范大學;2011年
8 狄文娜;細胞體內分離鑒定RNA結合蛋白結合的靶mRNA技術的建立和驗證[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學;2006年
9 巢時斌;小片段發(fā)夾RNA的制備及其對Hela細胞端粒酶基因沉寂作用研究[D];中南大學;2003年
10 謝艷;酵母端粒酶功能區(qū)RNA的制備及其理化性質研究[D];西北農林科技大學;2013年
,本文編號:1614851
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/shiyanyixue/1614851.html