福氏4c志賀菌的脈沖場凝膠電泳和多位點序列分型分析
本文關(guān)鍵詞:福氏4c志賀菌的脈沖場凝膠電泳和多位點序列分型分析 出處:《中國疾病預(yù)防控制中心》2008年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
更多相關(guān)文章: 福氏4c志賀菌 PFGE MLST
【摘要】: 我國福氏4c志賀菌的分離率近年來有升高的趨勢。我們使用脈沖場凝膠電泳分型方法對2005—2006年在河南省、安徽省、山西省和甘肅省細(xì)菌性痢疾監(jiān)測點分離到的322株福氏4c志賀菌進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)有81種帶型,以CNJZXN11.0002、CNJZXN11.0003帶型為優(yōu)勢帶型。其中,河南省、安徽省、山西省均以CNJZXN11.0003為主要帶型,甘肅省的優(yōu)勢帶型是CNJZXN11.0002。PFGE型別的分布有地區(qū)性差異。我們還使用多位點序列分型技術(shù),對24株河南分離的福氏4c志賀菌、9株河南分離的其他血清型的福氏志賀菌和1株宋內(nèi)志賀菌進(jìn)行了分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),24株福氏4c志賀菌菌株屬于一個序列型,命名為ST91。ST91還包括其他血清型志賀菌,譬如福氏1a志賀菌、福氏2a志賀菌和福氏X變種志賀菌。通過與已經(jīng)完成基因組分析的6株志賀菌和EcMLST數(shù)據(jù)庫中19株志賀菌序列資料所作的種系發(fā)生樹顯示,ST91志賀菌和24577福氏2a志賀菌的親緣關(guān)系較近。ST91志賀菌是我們首先命名的,可能已經(jīng)在我國流行多年。
[Abstract]:Our separation of Shigella flexneri 4c rate has increased in recent years. We use the typing method from 2005 to 2006 in Henan Province, Anhui Province, pulsed field gel electrophoresis, Shanxi province and Gansu Province, bacterial dysentery monitoring points of 322 isolated strains of Shigella flexneri 4c was analyzed, hair the existing 81 kinds of band type, with CNJZXN11.0002, CNJZXN11.0003 type was the predominant type. Among them, Henan Province, Anhui Province, Shanxi Province, with CNJZXN11.0003 as the main belt, Gansu province is the predominant type of CNJZXN11.0002.PFGE type distribution has regional differences. We also use multilocus sequence typing, flexneri 4c of 24 strains of Shigella isolated in Henan, 9 strains of Shigella flexneri isolates in Henan and 1 strains of other serotypes of Shigella sonnei were analyzed. The results showed that 24 strains of Shigella flexneri 4c strain belongs to a type named ST91.ST91 sequence, including its serotype of him For example, Shigella, S.flexneri 1a, Shigella flexneri 2a and Shigella flexneri X variants. The tree has been completed and a genome analysis of 6 strains of Shigella and EcMLST database sequence data of 19 strains of Shigella by kin ST91 Shiga and 24577 strains of Shigella flexneri 2a is nearly.ST91 of Shigella is our first name, may have been popular for many years in our country.
【學(xué)位授予單位】:中國疾病預(yù)防控制中心
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2008
【分類號】:R378;R516
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