本文關(guān)鍵詞：基于特征序列和CGR方法對(duì)Rh血型基因特征的研究　出處：《江南大學(xué)》2009年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

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【摘要】： Rh血型系統(tǒng)作為人類最復(fù)雜的血型系統(tǒng)之一,其臨床意義僅次于ABO血型系統(tǒng)。在臨床輸血實(shí)踐中因ABO、Rh血型不合的妊娠或輸血可發(fā)生輸血反應(yīng)和新生兒溶血病。本文的主要工作包括以下幾個(gè)方面: 1、根據(jù)a, t, c, g的化學(xué)結(jié)構(gòu)分類,給出了DNA序列的特征序列概念(σ-,τ-和στ-)并推廣到蛋白質(zhì)序列中,從而給出一種數(shù)值刻劃,將蛋白質(zhì)序列簡(jiǎn)化成一個(gè)(0,1)序列,并且應(yīng)用到18條三種結(jié)構(gòu)(α螺旋類,β折疊類,αβ類)的蛋白質(zhì)序列中,得到了不同結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)序列的一些二級(jí)結(jié)構(gòu)的信息。從另一種角度出發(fā),根據(jù)氨基酸分子量與簡(jiǎn)并度的相關(guān)性,給出了DNA序列的特征序列概念(ω-)并推廣到蛋白質(zhì)序列中,通過數(shù)值刻劃,將蛋白質(zhì)序列簡(jiǎn)化成一個(gè)(0,1,2)序列,通過比較特征序列的數(shù)值刻劃圖,得出RHD基因和RHCE基因均偏愛使用低分子量且高簡(jiǎn)并度的氨基酸。 2、利用基于經(jīng)典HP模型的蛋白質(zhì)序列的混沌游走(Chaos game representation,簡(jiǎn)稱CGR)的方法,給出了RHD基因的蛋白質(zhì)序列的CGR圖,可作為蛋白質(zhì)序列的二級(jí)結(jié)構(gòu)的一個(gè)特征圖譜描述,同時(shí)給出了RHD基因的DNA序列的CGR圖,并且計(jì)算出了RHD基因的相應(yīng)的馬爾可夫兩步轉(zhuǎn)移概率矩陣,從而得到RHD基因?qū)幋a氨基酸的三聯(lián)子的第三個(gè)堿基的使用偏好性。 3、提出了一種新的氨基酸編碼方法:擬氨基酸編碼方法,并且計(jì)算了基于擬氨基酸編碼方法下的78個(gè)人類基因的同義密碼子的相對(duì)使用度,結(jié)果表明這些特征不但與石秀凡等人的研究結(jié)果一致,而且更為明顯。說明了擬氨基酸編碼方法更具合理性和科學(xué)性。進(jìn)而計(jì)算了人類Rh血型系統(tǒng)中RHD基因基于擬氨基酸編碼方法下的同義密碼子相對(duì)使用度(QRSCU),以及QRFN3’,得出了RHD基因?qū)γ艽a子的偏好使用性以及后面所接堿基的偏好性。 本論文的創(chuàng)新點(diǎn)為: 1、提出了一種新的特征序列(ω-特征序列)。 2、利用提出的一種新的氨基酸編碼方法:擬氨基酸編碼方法,建立了QRSCU,并應(yīng)用于Rh血型系統(tǒng)研究。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：江南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2009
【分類號(hào)】：R394

【參考文獻(xiàn)】

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