與人遺傳病相關(guān)的DNA重復(fù)序列PCR條件優(yōu)化及遺傳不穩(wěn)定性的研究
本文關(guān)鍵詞:與人遺傳病相關(guān)的DNA重復(fù)序列PCR條件優(yōu)化及遺傳不穩(wěn)定性的研究 出處:《內(nèi)蒙古科技大學(xué)包頭醫(yī)學(xué)院》2010年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
更多相關(guān)文章: 重復(fù)序列 遺傳病 不穩(wěn)定性 PCR優(yōu)化 絲裂霉素C 甲基磺酸乙酯
【摘要】:近年來(lái),人們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)40余種人類神經(jīng)系統(tǒng)疾病與DNA重復(fù)序列擴(kuò)增或刪除有關(guān),這些疾病所涉及的重復(fù)序列的一個(gè)共同特點(diǎn)是以非孟德?tīng)栠z傳方式在世代間發(fā)生動(dòng)態(tài)突變,且往往伴隨著遺傳早現(xiàn)現(xiàn)象。 進(jìn)行與人類遺傳病相關(guān)的重復(fù)序列的遺傳不穩(wěn)定性的研究時(shí),應(yīng)用PCR檢測(cè)重組質(zhì)粒內(nèi)含有的重復(fù)序列長(zhǎng)度是一個(gè)基本的實(shí)驗(yàn)方法。我們采用L9(34)正交實(shí)驗(yàn)法,對(duì)與人神經(jīng)系統(tǒng)疾病相關(guān)的DNA重復(fù)序列PCR擴(kuò)增體系中的模板DNA濃度、Taq酶濃度、引物濃度、dNTP濃度等4種影響因素進(jìn)行了優(yōu)化篩選,發(fā)現(xiàn)引物濃度對(duì)擴(kuò)增結(jié)果影響的顯著性最大。在此基礎(chǔ)上進(jìn)行了引物濃度單因素實(shí)驗(yàn),得到最優(yōu)DNA重復(fù)序列PCR擴(kuò)增體系在25μL反應(yīng)體系中各組分的最適濃度分別為:模板3 ng/μL、Taq酶0.75 U、dNTP0.25 mmol/L、引物0.3μmol/L。通過(guò)優(yōu)化前后反應(yīng)體系的對(duì)比,擴(kuò)增目的產(chǎn)物的量有較大程度的提高。該優(yōu)化體系的建立為進(jìn)一步研究和人遺傳病相關(guān)的DNA重復(fù)序列的遺傳不穩(wěn)定性奠定了基礎(chǔ)。 在研究人類神經(jīng)系統(tǒng)疾病的遺傳不穩(wěn)定性及藥物作用的影響時(shí),需要制備成百上千的PCR樣品進(jìn)行定性檢測(cè)重復(fù)序列的長(zhǎng)度變化情況。為了探索含重復(fù)序列質(zhì)粒PCR模板的快速簡(jiǎn)易制備方法,本文分別利用高速離心法、TE煮沸法和TE/SDS煮沸法處理過(guò)夜培養(yǎng)的含重組質(zhì)粒大腸桿菌菌體,制備模板后進(jìn)行PCR擴(kuò)增發(fā)現(xiàn),均能得到比較清晰的目的條帶,可以用于含重復(fù)序列質(zhì)粒的初步鑒定。相比較而言,高速離心5min、TE煮沸3min、TE/SDS煮沸2.5min制備的樣品PCR擴(kuò)增后效果較好。這三種方法快速、簡(jiǎn)便、費(fèi)用低、無(wú)污染,簡(jiǎn)化了PCR模板制備的過(guò)程,為藥物處理后重復(fù)序列長(zhǎng)度大量鑒定的研究奠定了基礎(chǔ)。 多核苷酸的重復(fù)只有超過(guò)一定的閾值時(shí)才可能導(dǎo)致遺傳病的發(fā)生,如果能夠控制重復(fù)次數(shù)從而抑制其擴(kuò)增或運(yùn)用一種方法使擴(kuò)增的重復(fù)序列刪除縮短,對(duì)于由DNA重復(fù)序列引起的神經(jīng)系統(tǒng)遺傳病的治療及預(yù)防具有非常重要的意義。我們利用絲裂霉素C和甲基磺酸乙酯兩種化學(xué)藥物,在10%的菌體存活率下,連續(xù)多次處理含重復(fù)序列(GAA)42、(ATTCT)43的重組質(zhì)粒的大腸桿菌后,經(jīng)檢測(cè)其長(zhǎng)度變化發(fā)現(xiàn),兩種化學(xué)藥物在不同程度上都可以促使重復(fù)序列發(fā)生刪除。絲裂霉素C處理9次、甲基磺酸乙酯處理13次后(GAA)42的刪除率分別達(dá)到86.7%、43.3%,且刪除后長(zhǎng)度多數(shù)處于體內(nèi)的正常范圍。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,化學(xué)藥物可能促進(jìn)與人遺傳病相關(guān)的DNA重復(fù)序列的長(zhǎng)片段發(fā)生刪除,為研究該類疾病的致病機(jī)理及治療方案奠定了一定的基礎(chǔ)。
[Abstract]:In recent years, it has been found that more than 40 kinds of human nervous system disease and DNA repeat amplification or deletion, a common feature of repetitive sequences of these diseases involved is in non Mendel genetic mode among generations dynamic mutation, and is often accompanied by the phenomenon of genetic anticipation.
【學(xué)位授予單位】:內(nèi)蒙古科技大學(xué)包頭醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2010
【分類號(hào)】:R394
【參考文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1347280
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