細粒棘球蚴線粒體CO1基因的克隆與序列分析
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【摘要】:目的研究細粒棘球蚴(Echinococcus granulasus)種間遺傳標記特點,為該蟲種的分子分類學(xué)研究提供基礎(chǔ)。方法在內(nèi)蒙古地區(qū)從羊肝臟采集細粒棘球蚴,肝包蟲病患者手術(shù)剝離囊包后,簽署知情同意書,采集細粒棘球蚴。提取蟲體DNA,擴增線粒體細胞色素氧化酶1(CO1)基因,將其克隆到PGM-T載體后,用PCR技術(shù)鑒定陽性菌落,并進行測序,運用DNAstar5.0軟件計算序列間的相似性,計算遺傳距離,同時,應(yīng)用MEGA4.0軟件的最大似然法(ML-Maximum Likelihood)和鄰接法(NJ-Neighbor Joining)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,進行聚類分析。結(jié)果細粒棘球蚴DNA擴增出的羊株、人株CO1基因序列片段長度為936bp。同其他親緣關(guān)系較近的屬CO1基因序列比對:羊株、人株細粒棘球蚴CO1序列與黃花棘球絳蟲的同源性最高,分別為91.9%、91.2%;羊株、人株細粒棘球蚴CO1序列與黃花棘球絳蟲位于同一分支,自展值(Boostrap)最高,均為100%。羊株、人株細粒棘球蚴CO1序列所屬分支與原頭目的 Proteocephalus macrocephalus所屬分支相隔較遠。結(jié)論CO1基因序列穩(wěn)定保守,無宿主特異性,可作為細粒棘球蚴理想的種間遺傳標記。
【作者單位】: 農(nóng)業(yè)部動物疾病臨床診療技術(shù)重點實驗室/內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院;內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院;內(nèi)蒙古農(nóng)牧業(yè)科學(xué)院獸醫(yī)研究所;
【基金】:國家公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))專項資助(No.201103008,No.201303037)~~
【分類號】:R383.3
【正文快照】: (1.Key Laboratory of Clinical Diagnosis and Treatment Technology in Animal Disease,Ministry of Agriculture;College of Veterinary Medicine,Inner Mongolia Agricultural University,Hohhot 010018,China;2.Inner Mongolia Academy of AgriculturalAnimal Husbandry
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