中國(guó)登革Ⅲ型和Ⅳ型病毒分離株及登革Ⅳ型病毒減毒株特性研究
本文關(guān)鍵詞:中國(guó)登革Ⅲ型和Ⅳ型病毒分離株及登革Ⅳ型病毒減毒株特性研究
更多相關(guān)文章: 登革4型病毒 毒力 序列分析 基因型 登革4型病毒 減毒株 毒力 免疫原性 空斑純化 毒力位點(diǎn) 登革3型病毒 二級(jí)結(jié)構(gòu) 亞型 進(jìn)化樹
【摘要】:Ban18株于1981年分離于我國(guó)西雙版納地區(qū),將Ban18株和國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)株H241株分別在Vero細(xì)胞和乳鼠腦內(nèi)傳代,用空斑法在Vero細(xì)胞單層上進(jìn)行病毒滴度測(cè)定,結(jié)果表明兩株病毒均對(duì)Vero細(xì)胞有致細(xì)胞病變作用,可以形成肉眼可見的空斑,病毒滴度分別為2.0×105PFU/mL和5.1×107PFU/mL。根據(jù)GenBank上已經(jīng)提交的其它登革4型病毒全基因組序列,設(shè)計(jì)擴(kuò)增Ban18株和H241株全基因組的引物,測(cè)定兩株病毒的基因組序列,并進(jìn)行比對(duì)。測(cè)序結(jié)果表明,兩株病毒全長(zhǎng)均為10664nt,含一個(gè)開放閱讀框,,編碼3387個(gè)氨基酸,兩株病毒核苷酸同源性和氨基酸同源性分別為99.7%和99.4%,全基因組中共有6個(gè)核苷酸差異位點(diǎn)和3個(gè)氨基酸差異位點(diǎn)。采用E基因區(qū)段序列對(duì)兩株病毒進(jìn)行基因分型,兩株病毒均為基因Ⅰ型。 將登革4型病毒Ban18株及其在原代地鼠腎細(xì)胞上傳代的減毒株(Ban18HK20和Ban18HK30株)在Vero細(xì)胞傳代后進(jìn)行生物學(xué)特征和基因序列特征的研究。結(jié)果表明,三株病毒均能被登革4型特異性腹水有效中和,中和指數(shù)1000,提示三株病毒均為登革4型病毒。Ban18HK20株和Ban18HK30株在Vero細(xì)胞上形成的空斑形態(tài)較其母株大且模糊。二者對(duì)9~11g小鼠的腦內(nèi)lg(PFU/LD50)均4.5,而Ban18株的lg(PFU/LD50)為0.4,且二者對(duì)2~4日齡乳鼠的致病力也明顯低于其母株Ban18株,說明表明Ban18株在傳代過程中毒力逐漸減弱。將三株病毒稀釋到106PFU/mL后免疫小鼠,兩周后用國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)株H241株進(jìn)行腦內(nèi)攻擊,結(jié)果表明Ban18株和Ban18HK20株對(duì)H241腦內(nèi)攻擊的保護(hù)指數(shù)約為100,而Ban18HK30株對(duì)H241的腦內(nèi)攻擊基本沒有保護(hù)作用,說明前二者的免疫原性較好。同時(shí),為了獲得毒力更低的毒株,本實(shí)驗(yàn)將兩株減毒株Ban18HK20株和Ban18HK30株進(jìn)行空斑純化,分別挑選9個(gè)和5個(gè)空斑克隆進(jìn)行空斑形態(tài)和5~6日齡乳鼠腦內(nèi)毒力的比較,結(jié)果表明從Ban18HK20株挑選的9個(gè)克隆株中的3個(gè)毒株對(duì)乳鼠腦內(nèi)毒力低于Ban18HK20原株,Ban18HK30株的5個(gè)克隆株則無明顯差別。 比較Ban18株及其減毒株的全基因組序列,結(jié)果表明Ban18株和Ban18HK20株有8處核苷酸差異,其中3處引起氨基酸變化,即C111位、E155位、E369位和3’UTR219位,這幾位變化可能與病毒毒力密切相關(guān),特別是E155和3’UTR216,E155位會(huì)影響E蛋白的糖基化,3’UTR216位會(huì)改變3’UTR的二級(jí)結(jié)構(gòu)。 桂登-1株(GD-1株)和桂登-11株(GD-11株)分離自1980年廣西合浦縣的登革熱流行中,均為登革3型病毒。本研究將兩株病毒在NIH乳鼠腦內(nèi)傳代兩次后,病毒滴度達(dá)到3×103PFU/mL,同時(shí)將國(guó)際登革3型標(biāo)準(zhǔn)株標(biāo)準(zhǔn)株H87在乳鼠腦內(nèi)傳代一次,病毒滴度為2.6×105PFU/mL。前二者在Vero細(xì)胞單層上形成的空斑形態(tài)與H87株有明顯差異。測(cè)定上述三株病毒的全基因組序列并進(jìn)行分析,兩株病毒全長(zhǎng)均為10707nt,與H87株核苷酸同源性為96.0%,氨基酸同源性為98.8%。GD-1株和GD-11株間僅有4個(gè)氨基酸差異,二者和H87株分別存在39和41個(gè)氨基酸差異。對(duì)3’UTR二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè),二者與H87株存在較大差異。根據(jù)E蛋白基因序列對(duì)兩株病毒進(jìn)行進(jìn)化分析,結(jié)果表明二者均屬于亞型Ⅱ,與分離自泰國(guó)的兩株毒株進(jìn)化關(guān)系最近。
【關(guān)鍵詞】:登革4型病毒 毒力 序列分析 基因型 登革4型病毒 減毒株 毒力 免疫原性 空斑純化 毒力位點(diǎn) 登革3型病毒 二級(jí)結(jié)構(gòu) 亞型 進(jìn)化樹
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)食品藥品檢定研究院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:R373
【目錄】:
- 第一部分 我國(guó)云南分離株(Ban18)與國(guó)際登革 4 型標(biāo)準(zhǔn)株(H241 株)的生物學(xué)特性和全基因組序列比較研究5-33
- 中文摘要5-6
- 英文摘要6-7
- 前言7-9
- 材料和方法9-18
- 1 實(shí)驗(yàn)材料9-11
- 2 實(shí)驗(yàn)方法11-18
- 實(shí)驗(yàn)結(jié)果18-31
- 1 Ban18 株和 H241 株的生物學(xué)特征比較18-19
- 1.1 病毒滴度18
- 1.2 兩株病毒特異性鑒定18-19
- 1.3 兩株病毒腦內(nèi)致病力比較19
- 2 Ban18 株和 H241 株全基因序列分析19-31
- 2.1 PCR 擴(kuò)增結(jié)果19-20
- 2.2 H241 株和 Ban18 株的全序列比較20-27
- 2.3 Ban18 株與國(guó)內(nèi)外其它登革 4 型病毒的序列比較27-28
- 2.4 Ban18 株系統(tǒng)進(jìn)化分析28-31
- 討論31-32
- 參考文獻(xiàn)32-33
- 第二部分 云南登革 4 型版 18 株病毒減毒株的生物學(xué)特性和基因全序列研究33-61
- 中文摘要33-34
- 英文摘要34-35
- 前言35-38
- 材料和方法38-44
- 1 實(shí)驗(yàn)材料38-40
- 2 實(shí)驗(yàn)方法40-44
- 實(shí)驗(yàn)結(jié)果44-55
- 1 生物學(xué)特性44-52
- 1.1 Ban18 減毒株與其母株在 Vero 細(xì)胞上的生長(zhǎng)曲線44-45
- 1.2 Ban18 減毒株與其母株在 Vero 細(xì)胞上空斑形成特征45
- 1.3 登革 4 型特異性血清對(duì)三株病毒的中和抑制作用45-46
- 1.4 三株病毒對(duì)小鼠的腦內(nèi)致病力46-47
- 1.5 三株病毒的免疫原性比較47-48
- 1.6 Ban HK20 株和 Ban18 HK30 株各空斑克隆的生物學(xué)特征48-52
- 2 Ban18 減毒株與其母株的全基因序列比較52-55
- 2.1 兩株病毒 PCR 擴(kuò)增結(jié)果52-53
- 2.2 Ban18 減毒株與其母株的全基因序列比較53-55
- 討論55-59
- 1 生物學(xué)特征研究55-57
- 2 基因序列特征分析57-59
- 參考文獻(xiàn)59-61
- 第三部分 中國(guó)廣西登革 3 型病毒分離株與國(guó)際 DEN-3 標(biāo)準(zhǔn)株的生物學(xué)和基因特征研究61-79
- 中文摘要61-62
- 英文摘要62-63
- 前言63-65
- 材料和方法65-68
- 1 實(shí)驗(yàn)材料65
- 2 實(shí)驗(yàn)方法65-68
- 實(shí)驗(yàn)結(jié)果68-76
- 1 病毒滴度和空斑形態(tài)68
- 2 PCR 擴(kuò)增結(jié)果68-69
- 3 GD-1 株和 GD-11 株序列特征分析69-76
- 3.1 GD-1 株和 GD-11 株基因組結(jié)構(gòu)特征69-70
- 3.2 兩株病毒與國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)株 H87 株同源性分析70-71
- 3.3 兩株病毒與 H87 株的差異位點(diǎn)71-73
- 3.4 兩株病毒系統(tǒng)進(jìn)化分析73-76
- 討論76-77
- 參考文獻(xiàn)77-79
- 登革病毒減毒疫苗研究進(jìn)展79-89
- 1 傳統(tǒng)減毒疫苗79-81
- 2 新型減毒疫苗81-84
- 3 總結(jié)84-85
- 參考文獻(xiàn)85-89
- 致謝89-90
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本文編號(hào):1100720
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