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細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)果糖二磷酸醛縮酶的生物信息學(xué)分析及其表達(dá)、純化和酶活性的檢測(cè)

發(fā)布時(shí)間:2017-10-19 09:09

  本文關(guān)鍵詞:細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)果糖二磷酸醛縮酶的生物信息學(xué)分析及其表達(dá)、純化和酶活性的檢測(cè)


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【摘要】:目的:利用生物信息學(xué)方法分析細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)果糖二磷酸醛縮酶(FBPA)的結(jié)構(gòu)和功能特征,并利用基因工程技術(shù)進(jìn)行克隆、表達(dá)、純化,獲得活性蛋白。 方法:利用多種生物信息學(xué)軟件分析細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)的FBPA的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)、生物學(xué)以及免疫功能特征等。限制性內(nèi)切酶EcoR Ⅰ和HindⅢ對(duì)重組質(zhì)粒FBPA/P-blue酶切FBPA目的片段,亞克隆入表達(dá)載體pET30a,篩選重組克隆并測(cè)序,將正確的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化入BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)菌,異丙基-β-硫代半乳糖苷(IPTG)誘導(dǎo)表達(dá)重組蛋白。Ni-NTA柱純化重組蛋白,并建立酶反應(yīng)體系,通過(guò)NADH(煙酰胺腺嘌呤二核苷酸)的變化來(lái)測(cè)定重組蛋白EgFBPA的酶催化活性。 結(jié)果:EgFBPA是一個(gè)全長(zhǎng)的1092bp的基因,編碼363個(gè)氨基酸,軟件分析表明其等電點(diǎn)(PI)為8.34,分子量為39803.5Da。亞細(xì)胞定位分析顯示該蛋白是無(wú)信號(hào)肽的細(xì)胞質(zhì)蛋白,屬于穩(wěn)定蛋白。結(jié)構(gòu)域和保守功能域的預(yù)測(cè)結(jié)果發(fā)現(xiàn)FBPAI的激活位點(diǎn)VYLEGTLLKPN (222aa-232aa)和TIMβ/α筒狀結(jié)構(gòu)(6aa-346aa)。二級(jí)結(jié)構(gòu)以α-螺旋和環(huán)狀結(jié)構(gòu)居多,無(wú)跨膜區(qū),有10種類型的活性位點(diǎn)。以1ADO A為模板,構(gòu)建出了FBPA的三級(jí)結(jié)構(gòu)。經(jīng)PCR (聚合酶鏈反應(yīng))、雙酶切和測(cè)序證實(shí)pET30a (+)-EgFBPA成功構(gòu)建。SDS-PAGE (十二烷基磺酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電)證實(shí)成功表達(dá)重組蛋白,且該蛋白是具有高效表達(dá)的可溶性蛋白。Ni-NTA柱子純化后得到純度較高的FBPA, Bradford法測(cè)定蛋白濃度為0.50±0.02mg/ml。 結(jié)論:經(jīng)生物信息學(xué)預(yù)測(cè)細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)FBPA與人的FBPA的同源性是69%。EgFBPA可能是潛在的藥物靶點(diǎn)。重組質(zhì)粒Pet30a (+)-FBPA在大腸桿菌BL21中成功表達(dá),親和層析純化后獲得較高純度的有活性的蛋白,為進(jìn)一步研究其生物學(xué)功能及其抗體、藥物靶點(diǎn)的研制奠定了基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】:細(xì)粒棘球絳蟲(chóng) 果糖二磷酸醛縮酶(FBPA) 分子克隆 蛋白純化 生物信息學(xué)預(yù)測(cè)
【學(xué)位授予單位】:蘭州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:R383.33;Q78
【目錄】:
  • 中文摘要3-5
  • Abstract5-7
  • 目錄7-9
  • 前言9-12
  • 第一章 利用EST序列進(jìn)行生物信息學(xué)預(yù)測(cè)12-27
  • 1.1 材料12
  • 1.2 方法12-13
  • 1.3 結(jié)果13-25
  • 1.4 討論25-26
  • 1.5 小結(jié)26-27
  • 第二章 細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)成蟲(chóng)EgFBPA重組蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)、純化27-41
  • 2.1 材料27-28
  • 2.2 方法28-35
  • 2.3 結(jié)果35-39
  • 2.4 討論39-40
  • 2.5 小結(jié)40-41
  • 第三章 細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)成蟲(chóng)EgFBPA重組蛋白的酶活性的檢測(cè)41-46
  • 3.1 材料41
  • 3.2 方法41-43
  • 3.3 結(jié)果43-44
  • 3.4 討論44-45
  • 3.5 小結(jié)45-46
  • 第四章 結(jié)論46-47
  • 4.1 主要結(jié)論46
  • 4.2 研究的局限性及展望46-47
  • 參考文獻(xiàn)47-52
  • 綜述52-55
  • 參考文獻(xiàn)54-55
  • 在讀期間研究成果55-56
  • 致謝56-57
  • 英文縮略語(yǔ)表57

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 吳獻(xiàn)洪,何多龍;青海省共和縣包蟲(chóng)病流行病學(xué)調(diào)查[J];地方病通報(bào);2001年01期

2 陳根,史大中;包蟲(chóng)病治療的現(xiàn)狀概況[J];地方病通報(bào);2001年04期

3 姚明琴,師茂林;1213例包蟲(chóng)病住院病例的回顧性調(diào)查分析[J];地方病通報(bào);2004年04期

4 汪明;;人畜共患寄生蟲(chóng)病危害與公共衛(wèi)生意義(上)[J];動(dòng)物保健;2006年08期

5 齊普生;王進(jìn)成;張壯志;石保新;古努爾;吐?tīng)柡?陳紹榮;黃燕;哈斯也提;;棘球蚴病在我國(guó)流行及防治[J];中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);1998年S2期

6 清壽,赤誠(chéng),鄭云太,楊建;四川省色達(dá)縣人群包蟲(chóng)病調(diào)查[J];寄生蟲(chóng)病與感染性疾病;2004年04期

7 余傳信;趙飛;殷旭仁;肖迪;張建中;華萬(wàn)全;錢春艷;宋麗君;王s,

本文編號(hào):1060230


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