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分子伴侶Trigger Factor新功能位點(diǎn)的鑒定

發(fā)布時(shí)間:2017-10-16 07:14

  本文關(guān)鍵詞:分子伴侶Trigger Factor新功能位點(diǎn)的鑒定


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【摘要】:分子伴侶廣泛存在于細(xì)菌、酵母、哺乳動(dòng)物中,在細(xì)胞中組成了龐大健全的網(wǎng)絡(luò),能夠參與到多種細(xì)胞生理過程中,,例如幫助蛋白質(zhì)進(jìn)行折疊;參與蛋白復(fù)合體的組裝;參與蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)、分泌等過程。此外,分子伴侶網(wǎng)絡(luò)在蛋白質(zhì)質(zhì)量控制方面也發(fā)揮著重要的作用,通過對(duì)錯(cuò)誤折疊或者變性蛋白進(jìn)行去折疊和解聚作用,能夠促使其降解。不同分子伴侶之間的相互協(xié)調(diào)共同作用,可以保證細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)處于穩(wěn)定平衡的狀態(tài)。 Trigger Factor (TF)是原核分子伴侶網(wǎng)絡(luò)中的重要成員。TF包含兩部分結(jié)構(gòu):肽脯氨酰順反異構(gòu)酶(PPIase)結(jié)構(gòu)域和一個(gè)由N-末端和C-末端共同構(gòu)成的裂縫(Crevice)結(jié)構(gòu)。這個(gè)裂縫區(qū)域?yàn)閯倓傠x開核糖體出口位點(diǎn)的多肽提供了保護(hù)空間使其可以正確折疊。TF具有分子伴侶活性的同時(shí)又有折疊酶活性,還能夠調(diào)節(jié)蛋白折疊速度,協(xié)助蛋白質(zhì)翻譯之后的組裝。在TF的作用下,絕大部分蛋白質(zhì)能夠快速高效地完成折疊,這使得TF在協(xié)助新生肽鏈折疊方面具有舉足輕重的作用。 通過對(duì)TF結(jié)構(gòu)和序列進(jìn)行分析,我們?cè)赥F的PPIase結(jié)構(gòu)域和C-末端結(jié)構(gòu)域發(fā)現(xiàn)兩個(gè)可能與TF分子伴侶功能相關(guān)的疏水區(qū)域,為了確定這兩個(gè)區(qū)域在TF分子伴侶功能中的作用,我們構(gòu)建了兩個(gè)缺失突變體以及四個(gè)位點(diǎn)突變體,即:缺失PPIase結(jié)構(gòu)域的NC、TF389(1-389aa)、I195G、F233G、F322S、L336S/L337G。在利用親合層析及凝膠層系等方法制備得到目的蛋白后,我們使用圓二色譜儀和熒光光譜儀對(duì)TF野生型和突變體蛋白的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行了表征。然后我們選擇了三種不同分子伴侶活性測(cè)定底物即Lysozyme、BCAII和GAPDH,研究了TF野生型和突變體分子伴侶活性,分析了所選疏水區(qū)域在TF分子伴侶功能中的作用。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,所選疏水區(qū)域是TF重要的分子伴侶功能位點(diǎn),其改變能夠引起TF分子伴侶活性發(fā)生顯著性變化。本研究將有助于加深人們對(duì)分子伴侶TF結(jié)構(gòu)與功能的認(rèn)識(shí)。
【關(guān)鍵詞】:Trigger Factor 分子伴侶 蛋白折疊 蛋白聚集
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R3416
【目錄】:
  • 摘要4-5
  • Abstract5-9
  • 第1章 緒論9-18
  • 1.1 蛋白質(zhì)折疊和聚集9-10
  • 1.2 分子伴侶簡(jiǎn)介10-11
  • 1.3 TF 結(jié)構(gòu)和功能11-13
  • 1.4 TF 與核糖體及其他分子伴侶相互作用13-15
  • 1.5 本文主要研究?jī)?nèi)容及意義15-17
  • 1.6 技術(shù)路線圖17-18
  • 第2章 實(shí)驗(yàn)材料和方法18-26
  • 2.1 實(shí)驗(yàn)材料18-20
  • 2.1.1 菌株和質(zhì)粒18
  • 2.1.2 主要試劑及試劑盒18-19
  • 2.1.3 主要儀器19-20
  • 2.2 實(shí)驗(yàn)方法20-25
  • 2.2.1 TF-pRSET 重組體的構(gòu)建20-21
  • 2.2.2 突變體的制備21-22
  • 2.2.3 TF 表達(dá)條件優(yōu)化及大量制備22
  • 2.2.4 TF 突變體蛋白的純化及濃度測(cè)定22-23
  • 2.2.5 TF 突變體蛋白色氨酸(Trp)熒光光譜和圓二色譜檢測(cè)23
  • 2.2.6 TF 突變體蛋白分子伴侶活性檢測(cè)23-25
  • 2.2.7 透析袋的處理25
  • 2.3 本章小結(jié)25-26
  • 第3章 TF 突變體的設(shè)計(jì)制備與表征26-36
  • 3.1 TF 突變體設(shè)計(jì)26
  • 3.2 TF-pRSET 重組體的構(gòu)建及突變體制備26-29
  • 3.3 TF 突變體蛋白的純化29-31
  • 3.4 TF 突變體蛋白結(jié)構(gòu)檢測(cè)31-35
  • 3.4.1 TF 突變體蛋白 Trp 熒光發(fā)射光譜檢測(cè)32-33
  • 3.4.2 TF 突變體蛋白圓二色譜檢測(cè)33-35
  • 3.6 本章小結(jié)35-36
  • 第4章 TF 突變體蛋白分子伴侶活性研究36-47
  • 4.1 TF 突變體蛋白對(duì)變性 Lysozyme 的復(fù)性作用36-39
  • 4.1.1 TF 突變體蛋白協(xié)助變性 Lysozyme 重新折疊36-37
  • 4.1.2 TF 突變體蛋白對(duì)變性 Lysozyme 聚集的作用37-39
  • 4.2 TF 突變體蛋白對(duì)變性 BCAII 的復(fù)性作用39-42
  • 4.2.1 TF 突變體蛋白協(xié)助變性 BCAII 重新折疊39-41
  • 4.2.2 TF 突變體蛋白對(duì)變性 BCAII 聚集的作用41-42
  • 4.3 TF 突變體蛋白對(duì)變性 GAPDH 的復(fù)性作用42-45
  • 4.3.1 TF 突變體蛋白協(xié)助變性 GAPDH 重新折疊42-44
  • 4.3.2 TF 突變體蛋白對(duì)變性 GAPDH 聚集的作用44-45
  • 4.4 本章小結(jié)45-47
  • 結(jié)論47-48
  • 參考文獻(xiàn)48-54
  • 致謝54

【共引文獻(xiàn)】

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4 郭漫;靜電極化效應(yīng)對(duì)蛋白周圍水分子的影響及三氟乙醇對(duì)蛋白的影響[D];華東師范大學(xué);2013年

5 李雅楠;蘆丁和Anti-XD5分別對(duì)IAPP和β-淀粉樣蛋白影響的研究[D];寧夏大學(xué);2013年

6 李杰;巰基試劑對(duì)淀粉樣纖維化的分子機(jī)制研究[D];陜西師范大學(xué);2013年

7 馮雙;酚類化合物對(duì)蛋白質(zhì)淀粉樣纖維化過程作用的分子機(jī)制研究[D];陜西師范大學(xué);2013年

8 路偉振;Trigger factor表面疏水區(qū)對(duì)其分子伴侶功能的影響[D];哈爾濱工業(yè)大學(xué);2012年

9 胡蓉蓉;足細(xì)胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激對(duì)鈣神經(jīng)蛋白表達(dá)的調(diào)控研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2011年

10 李曉超;淀粉樣蛋白的聚集性及其抑制劑的研究[D];華中科技大學(xué);2012年



本文編號(hào):1041320

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