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TERT基因甲基化、突變及表達(dá)在腦膠質(zhì)瘤患者中的研究

發(fā)布時(shí)間:2017-05-08 19:18

  本文關(guān)鍵詞:TERT基因甲基化、突變及表達(dá)在腦膠質(zhì)瘤患者中的研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶基因(Telomerase reverse transcriptase, TERT)編碼的端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶是組成端粒酶的關(guān)鍵部分,并在維持端粒穩(wěn)定與控制細(xì)胞無(wú)限增殖中起著重要的作用。在多種人類(lèi)腫瘤中TERT基因的激活受到嚴(yán)格控制。然而,在腦膠質(zhì)瘤中TERT基因的活化調(diào)控機(jī)制仍不完全清楚。有研究表明TERT基因啟動(dòng)子區(qū)C228T、C250T兩個(gè)位點(diǎn)突變和啟動(dòng)子區(qū)的甲基化都會(huì)影響腦膠質(zhì)瘤患者中TERT基因的表達(dá)。本研究共收集77例腦膠質(zhì)瘤樣本,通過(guò)Sanger直接測(cè)序確定樣本TERT基因C228T、C250T突變情況;通過(guò)焦磷酸測(cè)序確定TERT基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化程度與腦膠質(zhì)瘤中重要分子標(biāo)志物IDH1基因突變情況;通過(guò)實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)TERT基因mRNA的表達(dá)水平。通過(guò)數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)TERT基因mRNA的表達(dá)水平在存在TERT基因啟動(dòng)子突變的患者中顯著升高(P=0.005)。TERT基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化程度在不同級(jí)別腦膠質(zhì)瘤患者中存在顯著差異,高級(jí)別樣本中甲基化程度更高。雖然大部分TERT基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化程度高的樣本有較高的mRNA表達(dá)水平,但兩者之間的相關(guān)關(guān)系不顯著。然而,存在IDHl基因突變的患者中TERT基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化程度與mRNA的表達(dá)水平呈負(fù)相關(guān)。并且TERT基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化程度在IDH1基因突變的患者中顯著升高(P=0.023); TERT基因突變也被發(fā)現(xiàn)在惡性程度最高的Ⅳ級(jí)膠質(zhì)瘤最為常見(jiàn)(9/21,42.9%)。本研究表明在中國(guó)成人腦膠質(zhì)瘤患者中,TERT基因啟動(dòng)子區(qū)突變及甲基化與IDHl基因突變共同調(diào)節(jié)TERT基因mRNA的表達(dá)水平。并且TERT可做為腦膠質(zhì)瘤潛在的分子標(biāo)志物。
【關(guān)鍵詞】:腦膠質(zhì)瘤 TERT基因 突變 甲基化 mRNA表達(dá)
【學(xué)位授予單位】:西北大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類(lèi)號(hào)】:R739.41
【目錄】:
  • 摘要3-4
  • ABSTRACT4-8
  • 前言8-10
  • 第一章 緒論10-19
  • 1.1 腦膠質(zhì)瘤的簡(jiǎn)介10
  • 1.2 腦膠質(zhì)瘤重要分子標(biāo)志物10-11
  • 1.2.1 IDH1基因突變10-11
  • 1.2.2 MGMT啟動(dòng)子甲基化11
  • 1.2.3 染色體lp/19q缺失11
  • 1.3 端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶基因簡(jiǎn)介11-12
  • 1.4 腫瘤中TERT基因的突變12-15
  • 1.4.1 TERT基因突變12-14
  • 1.4.2 TERT基因突的臨床意義14-15
  • 1.5 腫瘤中TERT基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化15-17
  • 1.5.1 DNA甲基化修飾及其研究意義15-16
  • 1.5.2 TERT基因的甲基化16-17
  • 1.6 論文研究?jī)?nèi)容與意義17-19
  • 第二章 腦膠質(zhì)瘤樣本處理19-23
  • 2.1 腦膠質(zhì)瘤樣本收集19
  • 2.2 腫瘤樣本基因組DNA提取19-20
  • 2.2.1 實(shí)驗(yàn)材料、試劑與儀器19
  • 2.2.2 實(shí)驗(yàn)步驟19-20
  • 2.3 腫瘤樣本總RNA提取20-21
  • 2.3.1 實(shí)驗(yàn)材料、試劑與儀器20-21
  • 2.3.2 實(shí)驗(yàn)步驟21
  • 2.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果21-22
  • 2.5 本章小結(jié)22-23
  • 第三章 腦膠質(zhì)瘤樣本TERT基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化程度檢測(cè)23-33
  • 3.1 焦磷酸測(cè)序技術(shù)定量檢測(cè)TERT基因甲基化的實(shí)驗(yàn)原理23-24
  • 3.1.1 常用的甲基化檢測(cè)方法23-24
  • 3.1.2 焦磷酸測(cè)序?qū)嶒?yàn)原理24
  • 3.2 焦磷酸測(cè)序技術(shù)定量檢測(cè)TERT基因啟動(dòng)子區(qū)域甲基化的實(shí)驗(yàn)流程24-28
  • 3.2.1 實(shí)驗(yàn)材料、試劑與儀器24-25
  • 3.2.2 實(shí)驗(yàn)步驟25-28
  • 3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與數(shù)據(jù)分析28-32
  • 3.3.1 焦磷酸測(cè)序結(jié)果28-31
  • 3.3.2 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析31-32
  • 3.4 本章小結(jié)32-33
  • 第四章 腦膠質(zhì)瘤樣本TERT基因mRNA表達(dá)水平檢測(cè)33-42
  • 4.1 qRT-PCR的原理33-34
  • 4.2 qRT-PCR技術(shù)檢測(cè)腦膠質(zhì)瘤樣本TERT基因mRNA表達(dá)34-37
  • 4.2.1 實(shí)驗(yàn)材料、試劑與儀器34
  • 4.2.2 實(shí)驗(yàn)步驟34-37
  • 4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果和分析37-40
  • 4.3.1 腦膠質(zhì)瘤樣本mRNA表達(dá)水平檢測(cè)結(jié)果37-38
  • 4.3.2 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析38-40
  • 4.4 本章小結(jié)40-42
  • 第五章 腦膠質(zhì)瘤樣本TERT基因與IDH1基因突變檢測(cè)42-50
  • 5.1 Sanger法檢測(cè)TERT基因C228T,C250T突變42-44
  • 5.1.1 實(shí)驗(yàn)材料、試劑和儀器42
  • 5.1.2 實(shí)驗(yàn)步驟42-43
  • 5.1.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果及數(shù)據(jù)分析43-44
  • 5.2 焦磷酸測(cè)序檢測(cè)腦膠質(zhì)瘤樣本IDH1基因R132H突變44-46
  • 5.2.1 實(shí)驗(yàn)材料、試劑和儀器44-45
  • 5.2.2 實(shí)驗(yàn)步驟45
  • 5.2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與數(shù)據(jù)分析45-46
  • 5.3 TERT基因甲基化、mRNA表達(dá)與突變的關(guān)系46-48
  • 5.3.1 IDH1基因突變與TERT基因甲基化程度、mRNA表達(dá)水平關(guān)系46-48
  • 5.3.2 TERT基因突變與其UTSS區(qū)甲基化程度、mRNA表達(dá)水平關(guān)系48
  • 5.4 本章小結(jié)48-50
  • 全文小結(jié)50-52
  • 參考文獻(xiàn)52-60
  • 攻讀碩士學(xué)位期間參加的主要科研項(xiàng)目60-61
  • 致謝61

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

1 陳旭;齊鳳坤;康立功;李景富;;實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)研究進(jìn)展及其應(yīng)用[J];東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2010年08期

2 屈振亮;端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶基因的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控[J];國(guó)外醫(yī)學(xué)(分子生物學(xué)分冊(cè));2002年05期

3 張海燕;趙洪斌;田亞平;馬慶偉;;DNA甲基化檢測(cè)技術(shù)與應(yīng)用前景[J];標(biāo)記免疫分析與臨床;2013年05期


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本文編號(hào):351737

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