拷貝數(shù)變異（copy number variations，CNVs）是指人類基因組中存在的長度為1kb-100kb的DNA片段插入、缺失或擴(kuò)增，及其互相組合形成的復(fù)雜結(jié)構(gòu)變異的現(xiàn)象。CNVs廣泛存在于基因組DNA，其變化和復(fù)雜疾病及疾病的易感性相關(guān)。CNVs可通過改變基因結(jié)構(gòu)和影響基因的表達(dá)或者遠(yuǎn)距離調(diào)控其它基因的表達(dá)來影響疾病的發(fā)生。從人基因組CNVs的角度來研究人腦膠質(zhì)瘤的發(fā)病機(jī)理是很好的切入點(diǎn)。采用美國Illumina公司CNV檢測用Illumina370SNP芯片，對采集到的18位中國漢族人腦膠質(zhì)瘤及患者的外周血標(biāo)本進(jìn)行了全基因組CNV分析。結(jié)果表明：1、腦膠質(zhì)瘤患者的膠質(zhì)瘤和外周血基因組中有一致性的CNV遺傳改變；2、高分化人腦膠質(zhì)瘤基因組中有非遺傳性CNV的一致性變化；3、腦膠質(zhì)瘤細(xì)胞的分化級別與發(fā)生了CNV的基因的種類和數(shù)量相關(guān)；4、CNV也可發(fā)生在腦膠質(zhì)瘤細(xì)胞基因組的非編碼區(qū)；5、腦膠質(zhì)瘤發(fā)生CNV的基因所涉及的細(xì)胞信號傳導(dǎo)通路及這些基因所涉及的重要細(xì)胞生命過程與其分化級別相關(guān)。該工作提示：1、人腦膠質(zhì)瘤基因組遺傳性的UGT2B17基因純合性缺失可能與腦膠質(zhì)瘤易感性有關(guān)... 

【文章來源】：吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：123 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
提要
中文摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 發(fā)病率
    1.2 生存率
    1.3 危險因素
        1.3.1 物理因素
        1.3.2 化學(xué)因素
        1.3.3 生物學(xué)因素
        1.3.4 其他因素
    1.4 臨床表現(xiàn)
    1.5 診斷
    1.6 治療和預(yù)后
    1.7 腦膠質(zhì)瘤的遺傳因素
        1.7.1 研究腦膠質(zhì)瘤遺傳變異采用的方法
        1.7.2 腦膠質(zhì)瘤基因組中的遺傳變異現(xiàn)象
        1.7.3 研究拷貝數(shù)變異的方法
        1.7.4 檢測 CNVs 的數(shù)據(jù)處理
第二章 材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1 腦膠質(zhì)瘤患者的 CNVs 檢測樣本收集
        2.1.2 腦膠質(zhì)瘤患者的診斷及病理分級
        2.1.3 腦膠質(zhì)瘤患者的臨床生化檢查
    2.2 實(shí)驗(yàn)儀器
    2.3 試劑及耗材
        2.3.1 全基因組 SNP 芯片及配套試劑
        2.3.2 DNA 實(shí)驗(yàn)試劑和耗材
        2.3.3 實(shí)驗(yàn)所用特殊試劑
        2.3.4 實(shí)驗(yàn)中所用分析軟件
    2.4 實(shí)驗(yàn)方法
        2.4.1 外周血基因組 DNA 提取
        2.4.2 膠質(zhì)瘤組織基因組 DNA 提取
        2.4.3 腦膠質(zhì)瘤細(xì)胞及外周血基因組的 DNA 定量及 DNA 濃度的調(diào)整
        2.4.4 美國 Illumina 公司 370 SNP 芯片標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)流程(Fig.5)
        2.4.5 實(shí)驗(yàn)質(zhì)量控制
        2.4.6 數(shù)據(jù)處理
第三章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    3.1 腦膠質(zhì)瘤患者病例、腦膠質(zhì)瘤組織樣本和自體外周血樣本的采集
    3.2 腦膠質(zhì)瘤患者的膠質(zhì)瘤細(xì)胞及外周血的基因組 DNA 提取和定量結(jié)果
    3.3 全基因組 SNP 芯片技術(shù)對腦膠質(zhì)瘤和外周血的基因組 CNV 檢測結(jié)果的質(zhì)量控制
    3.4 全基因組 SNP 芯片實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析結(jié)果
        3.4.1 腦膠質(zhì)瘤基因組和自體外周血 PBMC 基因組 CNV 的比較：
        3.4.2 高、低分化腦膠質(zhì)瘤基因組非遺傳 CNV 的比較
        3.4.3 腦膠質(zhì)瘤基因組發(fā)生 CNV 的基因及其所涉及的細(xì)胞信號傳導(dǎo)通路
        3.4.4 腦膠質(zhì)瘤發(fā)生 CNV 的基因所涉及的細(xì)胞生命過程
第四章 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及取得的科研成果
個人簡歷
致謝



本文編號：3341268