基于轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)構(gòu)建腦膠質(zhì)瘤Cox比例風險回歸模型
發(fā)布時間:2021-03-15 00:52
目的基于腫瘤基因組圖譜(TCGA)計劃數(shù)據(jù)庫構(gòu)建腦膠質(zhì)瘤Cox比例風險回歸模型,并在中國腦膠質(zhì)瘤基因組圖譜計劃(CGGA)數(shù)據(jù)庫中驗證,探討該模型對預后的評估價值。方法回顧性分析TCGA數(shù)據(jù)庫中668例腦膠質(zhì)瘤患者(試驗組)、CGGA數(shù)據(jù)庫中619例腦膠質(zhì)瘤患者(驗證組)的臨床資料及其膠質(zhì)瘤組織RNA測序數(shù)據(jù),同時選取5例來源于TCGA數(shù)據(jù)庫的正常腦組織樣本的RNA測序數(shù)據(jù)作為對照。篩選TCGA數(shù)據(jù)庫中腦膠質(zhì)瘤與正常組織間的差異基因。在試驗組中應用Cox回歸方法建立風險模型。分別在試驗組和驗證組中,采用Kaplan-Meier法繪制生存曲線、Log-rank法檢驗高、低風險患者的生存差異,采用單因素、多因素Cox回歸分析法分析影響腦膠質(zhì)瘤患者預后的因素;將獨立預后因素納入分析,繪制列線圖。高風險組中高表達的基因用于基因本體(GO)功能富集分析。結(jié)果試驗組與驗證組的年齡(<40歲或≥40歲)、性別、生存期差異均無統(tǒng)計學意義(均P>0.05),但世界衛(wèi)生組織(WHO)腫瘤分級、病理類型分布、異檸檬酸脫氫酶1/2(IDH1/2)突變率等差異均有統(tǒng)計學意義(均P<0.05)。...
【文章來源】:中華神經(jīng)外科雜志. 2020,36(05)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【參考文獻】:
期刊論文
[1]WHOⅡ級腦膠質(zhì)瘤患者無進展生存期的影響因素分析[J]. 張東旭,曲彥明,張明山,任銘,谷春雨,王浩然,寧威海,郭玉鐸,齊雪嶺,張宏偉. 中華神經(jīng)外科雜志. 2019 (05)
[2]膠質(zhì)瘤基因分型和主要標志基因的研究進展[J]. 申大川,冷基勇,王若雨. 中華神經(jīng)外科雜志. 2018 (10)
本文編號:3083266
【文章來源】:中華神經(jīng)外科雜志. 2020,36(05)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【參考文獻】:
期刊論文
[1]WHOⅡ級腦膠質(zhì)瘤患者無進展生存期的影響因素分析[J]. 張東旭,曲彥明,張明山,任銘,谷春雨,王浩然,寧威海,郭玉鐸,齊雪嶺,張宏偉. 中華神經(jīng)外科雜志. 2019 (05)
[2]膠質(zhì)瘤基因分型和主要標志基因的研究進展[J]. 申大川,冷基勇,王若雨. 中華神經(jīng)外科雜志. 2018 (10)
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