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基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)構(gòu)建腦膠質(zhì)瘤Cox比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型

發(fā)布時(shí)間:2021-03-15 00:52
  目的基于腫瘤基因組圖譜(TCGA)計(jì)劃數(shù)據(jù)庫構(gòu)建腦膠質(zhì)瘤Cox比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型,并在中國腦膠質(zhì)瘤基因組圖譜計(jì)劃(CGGA)數(shù)據(jù)庫中驗(yàn)證,探討該模型對(duì)預(yù)后的評(píng)估價(jià)值。方法回顧性分析TCGA數(shù)據(jù)庫中668例腦膠質(zhì)瘤患者(試驗(yàn)組)、CGGA數(shù)據(jù)庫中619例腦膠質(zhì)瘤患者(驗(yàn)證組)的臨床資料及其膠質(zhì)瘤組織RNA測(cè)序數(shù)據(jù),同時(shí)選取5例來源于TCGA數(shù)據(jù)庫的正常腦組織樣本的RNA測(cè)序數(shù)據(jù)作為對(duì)照。篩選TCGA數(shù)據(jù)庫中腦膠質(zhì)瘤與正常組織間的差異基因。在試驗(yàn)組中應(yīng)用Cox回歸方法建立風(fēng)險(xiǎn)模型。分別在試驗(yàn)組和驗(yàn)證組中,采用Kaplan-Meier法繪制生存曲線、Log-rank法檢驗(yàn)高、低風(fēng)險(xiǎn)患者的生存差異,采用單因素、多因素Cox回歸分析法分析影響腦膠質(zhì)瘤患者預(yù)后的因素;將獨(dú)立預(yù)后因素納入分析,繪制列線圖。高風(fēng)險(xiǎn)組中高表達(dá)的基因用于基因本體(GO)功能富集分析。結(jié)果試驗(yàn)組與驗(yàn)證組的年齡(<40歲或≥40歲)、性別、生存期差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05),但世界衛(wèi)生組織(WHO)腫瘤分級(jí)、病理類型分布、異檸檬酸脫氫酶1/2(IDH1/2)突變率等差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05)。... 

【文章來源】:中華神經(jīng)外科雜志. 2020,36(05)北大核心

【文章頁數(shù)】:7 頁

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]WHOⅡ級(jí)腦膠質(zhì)瘤患者無進(jìn)展生存期的影響因素分析[J]. 張東旭,曲彥明,張明山,任銘,谷春雨,王浩然,寧威海,郭玉鐸,齊雪嶺,張宏偉.  中華神經(jīng)外科雜志. 2019 (05)
[2]膠質(zhì)瘤基因分型和主要標(biāo)志基因的研究進(jìn)展[J]. 申大川,冷基勇,王若雨.  中華神經(jīng)外科雜志. 2018 (10)



本文編號(hào):3083266

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