GeXP多重RT-PCR技術(shù)在病毒性腦炎病原檢測(cè)中的應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-02-21 02:16
目的利用GeXP多重基因表達(dá)遺傳分析系統(tǒng),建立一種能夠同時(shí)檢測(cè)腦炎相關(guān)的8種蟲(chóng)媒病毒的多重逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(mRT-PCR)方法,并對(duì)此方法作出初步評(píng)價(jià)。方法以腦炎相關(guān)的8種蟲(chóng)媒病毒為研究對(duì)象,包括版納病毒(Banna virus,BAV),乙型腦炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV),蜱傳腦炎病毒(Tick-borne encephalitis virus,TBEV), Tahyna病毒(Tahyna virus,TAHV),遼寧病毒(Liaoning virus,LNV),科薩努爾森林病病毒(Kyasanur forest disease virus,KFDV),辛德畢斯病毒(Sindbis virus,SINV)及云南環(huán)狀病毒(Yunnan orbivirus,YUOV)并加入小鼠腦脊髓炎病毒(Theiler’s Mouse Encephalomyelitis virus, TMEV)做為內(nèi)部對(duì)照。利用GeXP系統(tǒng)建立多重RT-PCR檢測(cè)方法,設(shè)計(jì)各病毒特異引物并進(jìn)行篩選,以病毒分離培養(yǎng)物和陽(yáng)性標(biāo)本來(lái)驗(yàn)證引物及多重反應(yīng)體系的特異性,根據(jù)PCR...
【文章來(lái)源】:安徽理工大學(xué)安徽省
【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
插圖或附表清單
注釋說(shuō)明清單
引言
1 研究背景
1.1 GeXP系統(tǒng)的原理及應(yīng)用
1.2 病毒性腦炎研究進(jìn)展
2 病毒性腦炎GeXP多重檢測(cè)體系的建立
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 病毒來(lái)源
2.1.2 主要試劑
2.1.3 主要儀器耗材
2.2 緩沖液及細(xì)菌培養(yǎng)基配置
2.2.1 核酸電泳緩沖液
2.2.2 細(xì)菌培養(yǎng)基(LB培養(yǎng)基)
2.3 試驗(yàn)方法
2.3.1 引物設(shè)計(jì)
2.3.2 病毒樣品處理
2.3.2.1 病毒核酸提取前準(zhǔn)備
2.3.2.2 核酸提取
2.3.3 單引物特異性驗(yàn)證
2.3.4 構(gòu)建單克隆質(zhì)粒
2.3.4.1 PCR產(chǎn)物純化
2.3.4.2 連接
2.3.4.3 轉(zhuǎn)化
2.3.5 質(zhì)粒的提取及線(xiàn)性化
2.3.5.1 質(zhì)粒提取
2.3.5.2 提取質(zhì)粒線(xiàn)性化
2.3.6 參考品的制備
2.3.6.1 體外轉(zhuǎn)錄RNA的制備
2.3.6.2 體外轉(zhuǎn)錄后去DNA模板
2.3.6.3 體外轉(zhuǎn)錄后去鹽類(lèi)及核苷酸
2.3.7 多重檢測(cè)體系的建立
2.3.7.1 多重體系特異性驗(yàn)證
2.3.7.2 多重體系多引物單模板靈敏度分析
2.3.7.3 多重體系多引物多模板靈敏度分析
2.3.8 GeXP多重體系驗(yàn)證
2.4 試驗(yàn)結(jié)果
2.4.1 引物設(shè)計(jì)
2.4.2 單引物特異性驗(yàn)證
2.4.3 質(zhì)粒的提取及線(xiàn)性化
2.4.4 多重體系特異性驗(yàn)證
2.4.5 多重體系多引物單模板靈敏度結(jié)果
2.4.6 多重體系多引物單模板靈敏度結(jié)果
2.4.7 多重體系驗(yàn)證結(jié)果
3 實(shí)驗(yàn)討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄A
后記或致謝
作者簡(jiǎn)介及讀研期間主要科研成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]GeXP多重PCR技術(shù)用于人乳頭瘤病毒HPV檢測(cè)和分型的研究[J]. 蘆春斌,楊夢(mèng)婕,羅樂(lè),王淼,馬學(xué)軍. 中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志. 2011 (01)
[2]多重基因表達(dá)分析系統(tǒng)在氨基糖苷類(lèi)多重耐藥基因檢測(cè)中的應(yīng)用[J]. 胡秀梅,徐邦牢,楊銀梅,周小棉,楊夢(mèng)婕,王淼,馬學(xué)軍. 中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2011 (02)
[3]我國(guó)從節(jié)肢動(dòng)物中新分離的蟲(chóng)媒病毒[J]. 馮云,張海林,梁國(guó)棟. 中國(guó)媒介生物學(xué)及控制雜志. 2009(02)
[4]GeXP多重基因表達(dá)系統(tǒng)檢測(cè)外周炎性相關(guān)基因方法學(xué)探索[J]. 董矜,田亞平,張陽(yáng)東,李立青. 標(biāo)記免疫分析與臨床. 2009(01)
[5]病毒性腦炎研究進(jìn)展[J]. 謝藝紅,董柏青. 應(yīng)用預(yù)防醫(yī)學(xué). 2008(06)
[6]Isolation and Complete Genomic Sequence Analysis of a New Sindbis-like Virus[J]. Jing-jing WANG1#, Hai-lin ZHANG2#, Yan-chun CHE1, Li-chun WANG1, Shang-hui MA1, Long-ding LIU1, Yun LIAO1 and Qi-han LI1** (1. Institute of Medical Biology, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Kunming 650118, China; 2. Yunnan Institute for Endemic Diseases Control and Prevention, Dali 671000, China). Virologica Sinica. 2008(01)
[7]什么是GeXP技術(shù)?[J]. 溫新宇. 中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志. 2007(08)
[8]加強(qiáng)我國(guó)病毒性腦炎的監(jiān)測(cè)與研究[J]. 梁國(guó)棟. 中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志. 2006(03)
[9]引起人類(lèi)腦炎的新雙鏈RNA病毒[J]. 徐麗宏,梁國(guó)棟. 中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志. 2006(03)
[10]云南首次分離到辛德畢斯(Sindbis)、巴泰(Batai)和Colti病毒[J]. 張海林,陶三菊,楊冬榮,張?jiān)浦?楊衛(wèi)紅,章域震,黃文麗,周?chē)?guó)林,王環(huán)宇,付士紅,梁國(guó)棟. 中國(guó)人獸共患病雜志. 2005(07)
本文編號(hào):3043696
【文章來(lái)源】:安徽理工大學(xué)安徽省
【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
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注釋說(shuō)明清單
引言
1 研究背景
1.1 GeXP系統(tǒng)的原理及應(yīng)用
1.2 病毒性腦炎研究進(jìn)展
2 病毒性腦炎GeXP多重檢測(cè)體系的建立
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 病毒來(lái)源
2.1.2 主要試劑
2.1.3 主要儀器耗材
2.2 緩沖液及細(xì)菌培養(yǎng)基配置
2.2.1 核酸電泳緩沖液
2.2.2 細(xì)菌培養(yǎng)基(LB培養(yǎng)基)
2.3 試驗(yàn)方法
2.3.1 引物設(shè)計(jì)
2.3.2 病毒樣品處理
2.3.2.1 病毒核酸提取前準(zhǔn)備
2.3.2.2 核酸提取
2.3.3 單引物特異性驗(yàn)證
2.3.4 構(gòu)建單克隆質(zhì)粒
2.3.4.1 PCR產(chǎn)物純化
2.3.4.2 連接
2.3.4.3 轉(zhuǎn)化
2.3.5 質(zhì)粒的提取及線(xiàn)性化
2.3.5.1 質(zhì)粒提取
2.3.5.2 提取質(zhì)粒線(xiàn)性化
2.3.6 參考品的制備
2.3.6.1 體外轉(zhuǎn)錄RNA的制備
2.3.6.2 體外轉(zhuǎn)錄后去DNA模板
2.3.6.3 體外轉(zhuǎn)錄后去鹽類(lèi)及核苷酸
2.3.7 多重檢測(cè)體系的建立
2.3.7.1 多重體系特異性驗(yàn)證
2.3.7.2 多重體系多引物單模板靈敏度分析
2.3.7.3 多重體系多引物多模板靈敏度分析
2.3.8 GeXP多重體系驗(yàn)證
2.4 試驗(yàn)結(jié)果
2.4.1 引物設(shè)計(jì)
2.4.2 單引物特異性驗(yàn)證
2.4.3 質(zhì)粒的提取及線(xiàn)性化
2.4.4 多重體系特異性驗(yàn)證
2.4.5 多重體系多引物單模板靈敏度結(jié)果
2.4.6 多重體系多引物單模板靈敏度結(jié)果
2.4.7 多重體系驗(yàn)證結(jié)果
3 實(shí)驗(yàn)討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄A
后記或致謝
作者簡(jiǎn)介及讀研期間主要科研成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]GeXP多重PCR技術(shù)用于人乳頭瘤病毒HPV檢測(cè)和分型的研究[J]. 蘆春斌,楊夢(mèng)婕,羅樂(lè),王淼,馬學(xué)軍. 中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志. 2011 (01)
[2]多重基因表達(dá)分析系統(tǒng)在氨基糖苷類(lèi)多重耐藥基因檢測(cè)中的應(yīng)用[J]. 胡秀梅,徐邦牢,楊銀梅,周小棉,楊夢(mèng)婕,王淼,馬學(xué)軍. 中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2011 (02)
[3]我國(guó)從節(jié)肢動(dòng)物中新分離的蟲(chóng)媒病毒[J]. 馮云,張海林,梁國(guó)棟. 中國(guó)媒介生物學(xué)及控制雜志. 2009(02)
[4]GeXP多重基因表達(dá)系統(tǒng)檢測(cè)外周炎性相關(guān)基因方法學(xué)探索[J]. 董矜,田亞平,張陽(yáng)東,李立青. 標(biāo)記免疫分析與臨床. 2009(01)
[5]病毒性腦炎研究進(jìn)展[J]. 謝藝紅,董柏青. 應(yīng)用預(yù)防醫(yī)學(xué). 2008(06)
[6]Isolation and Complete Genomic Sequence Analysis of a New Sindbis-like Virus[J]. Jing-jing WANG1#, Hai-lin ZHANG2#, Yan-chun CHE1, Li-chun WANG1, Shang-hui MA1, Long-ding LIU1, Yun LIAO1 and Qi-han LI1** (1. Institute of Medical Biology, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Kunming 650118, China; 2. Yunnan Institute for Endemic Diseases Control and Prevention, Dali 671000, China). Virologica Sinica. 2008(01)
[7]什么是GeXP技術(shù)?[J]. 溫新宇. 中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志. 2007(08)
[8]加強(qiáng)我國(guó)病毒性腦炎的監(jiān)測(cè)與研究[J]. 梁國(guó)棟. 中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志. 2006(03)
[9]引起人類(lèi)腦炎的新雙鏈RNA病毒[J]. 徐麗宏,梁國(guó)棟. 中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志. 2006(03)
[10]云南首次分離到辛德畢斯(Sindbis)、巴泰(Batai)和Colti病毒[J]. 張海林,陶三菊,楊冬榮,張?jiān)浦?楊衛(wèi)紅,章域震,黃文麗,周?chē)?guó)林,王環(huán)宇,付士紅,梁國(guó)棟. 中國(guó)人獸共患病雜志. 2005(07)
本文編號(hào):3043696
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