第一部分上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)生物學(xué)進(jìn)程在腦膠質(zhì)瘤惡性表型及臨床預(yù)后評估中的潛在意義研究［目的］上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(Epithelial-Mesenchymal Transition,EMT)過程指上皮細(xì)胞在特定驅(qū)動(dòng)因素作用下轉(zhuǎn)化具有間充質(zhì)干細(xì)胞表型的生物學(xué)進(jìn)程。本研究的目的是基于腦膠質(zhì)瘤基因組學(xué)分析EMT相關(guān)基因與腦膠質(zhì)瘤中病理因素的相關(guān)性,進(jìn)一步明確EMT進(jìn)程在腦膠質(zhì)瘤中的研究價(jià)值和臨床意義。［方法］本研究共分析中國人腦膠質(zhì)瘤基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫325例腦膠質(zhì)瘤樣本(所有樣本完成臨床信息的長期跟蹤隨訪)。進(jìn)一步分析EMT生物學(xué)進(jìn)程與腦膠質(zhì)瘤惡性級別及臨床預(yù)后的相關(guān)性,并分析其與膠質(zhì)瘤中特異性分子標(biāo)志物如IDH1/2突變及分子亞型的相關(guān)性。最終通過GSE16011、Rembrandt及TCGA等公共數(shù)據(jù)庫驗(yàn)證EMT生物學(xué)進(jìn)程的臨床意義。［結(jié)果］在中國人腦膠質(zhì)瘤中,EMT生物學(xué)進(jìn)程與惡性級別呈正相關(guān),在間充質(zhì)型膠質(zhì)瘤中EMT進(jìn)程高度激活,與IDH1突變顯著相關(guān)。生存分析發(fā)現(xiàn),EMT生物學(xué)進(jìn)程與膠質(zhì)瘤患者預(yù)后顯著相關(guān),EMT進(jìn)程與膠質(zhì)瘤預(yù)后不良關(guān)系密切。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)在GSE16011、Rembrandt及TCGA數(shù)據(jù)庫中,EMT生物學(xué)進(jìn)程與患者預(yù)后顯著負(fù)相關(guān)。［結(jié)論］我們首次系統(tǒng)地基于腦膠質(zhì)瘤基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫闡釋EMT生物學(xué)進(jìn)程在腦膠質(zhì)瘤惡性進(jìn)展中的重要意義,及其與臨床預(yù)后的相關(guān)性,為基于對EMT生物學(xué)進(jìn)程的分子靶向研究指明方向。第二部分調(diào)控腦膠質(zhì)瘤上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化進(jìn)程(EMT)的相關(guān)micro RNA研究［目的］Micro RNA(mi RNAs)是一種單鏈小分子RNA,長度約21-23個(gè)堿基,通過靶向多個(gè)基因的表達(dá)而發(fā)揮功能,進(jìn)而影響包括上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化在內(nèi)的多種生物學(xué)進(jìn)程。本研究目的是研究調(diào)控EMT生物學(xué)進(jìn)程的micro RNA表達(dá)譜。［方法］利用TCGA數(shù)據(jù)庫中491例m RNA與micro RNA表達(dá)譜重疊的樣本,基于GSVA軟件計(jì)算出EMT進(jìn)程富集分?jǐn)?shù),利用Pearson相關(guān)分析計(jì)算與EMT進(jìn)程密切相關(guān)的micro RNA。［結(jié)果］Pearson相關(guān)分析共發(fā)現(xiàn)18個(gè)負(fù)相關(guān)和19個(gè)正相關(guān)的micro RNA(P0.01,r-0.3或r0.3)。其中兩個(gè)mi RNA(mi R-223和mi R-95分別與EMT進(jìn)程富集分?jǐn)?shù)有著高度的正相關(guān)和負(fù)相關(guān))被選作下一步的功能實(shí)驗(yàn)。體外功能實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)mi R-223可以顯著促進(jìn)膠質(zhì)瘤細(xì)胞侵襲能力,而與EMT進(jìn)程負(fù)相關(guān)的mi R-95則可顯著抑制膠質(zhì)瘤細(xì)胞侵襲能力。RT-PCR分析也提示mi R-223可以顯著促進(jìn)EMT進(jìn)程關(guān)鍵基因N-catenin的表達(dá),而mi R-95可以顯著抑制N-catenin的表達(dá)水平。最后體內(nèi)實(shí)驗(yàn)證實(shí)mi R-223可以明顯促進(jìn)裸鼠顱內(nèi)腫瘤的生長,而mi R-95作用則相反。［結(jié)論］我們首次闡釋與EMT生物學(xué)進(jìn)程相關(guān)的micro RNA表達(dá)譜,并進(jìn)一步闡釋了癌基因mi R-223和抑癌基因mi R-95的初步功能,為針對EMT生物學(xué)進(jìn)程的內(nèi)在機(jī)制研究及分子靶向治療奠定了基礎(chǔ)。
【學(xué)位單位】：南京醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位年份】：2018
【中圖分類】：R739.41
【文章目錄】：
摘要
Abstract
前言
    參考文獻(xiàn)
第一部分：上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化（EMT）生物學(xué)進(jìn)程在腦膠質(zhì)瘤惡性表型及臨床預(yù)后評估中的潛在意義研究
    材料與方法
    結(jié)果
    討論
    參考文獻(xiàn)
第二部分：調(diào)控腦膠質(zhì)瘤上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化進(jìn)程（EMT）的相關(guān)microRNA研究
    材料與方法
    結(jié)果
    討論
    參考文獻(xiàn)
文獻(xiàn)綜述
    參考文獻(xiàn)
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本文編號：2873155