【摘要】：目的:探索動(dòng)脈瘤性蛛網(wǎng)膜下腔出血(aneurysmal Subarachnoid Hemorrhage,aSAH)患者外周血中相關(guān)的未知長(zhǎng)鏈非編碼RNA。方法:通過(guò)病例-對(duì)照研究,在湖南省人民醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科收集了2017年1月到2018年12月期間經(jīng)DSA確診的湖南地區(qū)的首發(fā)aSAH患者75例,并選取35名與之同時(shí)期性別、年齡、地域相匹配對(duì)照組人群。分別取aSAH組及對(duì)照組各5例外周血樣本進(jìn)行LncRNA高通量測(cè)序表達(dá)譜分析,使用GeneSpring GX v12.1軟件獲得LncRNA表達(dá)譜,通過(guò)計(jì)算兩組樣本間的倍數(shù)變化和P值,并篩選差異表達(dá)LncRNA。利用RT-qPCR法在原始高通量樣本中首次驗(yàn)證縮小范圍,再將差異表達(dá)的LncRNA在70例aSAH患者和30名對(duì)照組人群的外周血中擴(kuò)大樣本二次驗(yàn)證其在外周血中的基因表達(dá)水平。結(jié)果:測(cè)序結(jié)果分析發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)的有482個(gè)上調(diào)表達(dá)及543個(gè)下調(diào)表達(dá)的LncRNA。擴(kuò)大樣本RT-qPCR法驗(yàn)證最終篩選出兩個(gè)LncRNA:ENST00000505844、ENST00000608142。ROC曲線下面積分別為0.806、0.734,有一定的診斷意義。上述基因在aSAH患者中顯著上調(diào),這與測(cè)序結(jié)果一致。結(jié)論:1.初步從aSAH患者外周血樣本中篩選出差異表達(dá)的LncRNA。2.擴(kuò)大樣本行RT-qPCR驗(yàn)證得到兩個(gè)上調(diào)LncRNA:ENST00000505844,ENST00000608142,它們與aSAH發(fā)生密切相關(guān)。
【學(xué)位授予單位】：湖南師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類(lèi)號(hào)】：R743.35
【圖文】：

碩士學(xué)位論文18圖1. 使用箱式圖、散點(diǎn)圖和火山圖進(jìn)行數(shù)據(jù)效果評(píng)價(jià)注釋?zhuān)合涫綀DA 評(píng)估 LncRNA 表達(dá)數(shù)據(jù)的質(zhì)量。散點(diǎn)圖B 用于評(píng)估 aSAH 組和對(duì)照組之間LncRNA 表達(dá)的變化�；鹕綀D C 顯示兩組間LncRNA 表達(dá)的顯著性差異。異常點(diǎn)上四分位值中位值下四分位值藍(lán)色區(qū)域?yàn)閿?shù)據(jù)中心紅色區(qū)域?yàn)楫惓^(qū)域A下調(diào)≥2 倍上調(diào)≥2倍P≤0.05P＞0.05下調(diào)≥2 倍無(wú)差

待驗(yàn)證的差異表達(dá)LncRNAs聚類(lèi)圖

路、細(xì)胞色素 P450-藥物代謝，細(xì)胞因子間受體相互作用，P13K-Akt 信號(hào)通路，抗原處理和提呈和自然殺傷細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞毒性等(圖 4)。圖3A . 上調(diào)表達(dá) LncRNAs的 GO分析

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本文編號(hào)：2799986