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人MTERF3在腦膠質(zhì)瘤的表達(dá)及其對腦膠質(zhì)瘤U251細(xì)胞增殖的影響

發(fā)布時間:2020-05-26 09:09
【摘要】:背景與目的腦膠質(zhì)瘤是目前人類腫瘤中最為常見的原發(fā)性中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤,約占原發(fā)性中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤的30%~40%,是生存時間最短及預(yù)后最差的疾病類型之一。隨著社會的發(fā)展,腫瘤已經(jīng)成為人類較為常見的疾病,腫瘤的死亡率僅次于心血管疾病位居第二,是目前威脅人類健康最重要的疾病之一。盡管近年來隨著醫(yī)療水平的發(fā)展,手術(shù)治療、放射治療及藥物化療等常規(guī)治療手段取得了較大的進(jìn)步,但由于腦膠質(zhì)瘤浸潤生長的特性,導(dǎo)致腫瘤部位難以徹底切除而復(fù)發(fā),影響腦膠質(zhì)瘤治療的預(yù)后,且目前診療腦膠質(zhì)瘤的分子標(biāo)記物仍然非常有限。近年來,隨著分子生物學(xué)認(rèn)識的不斷深入,分子靶向逐漸成為治療腫瘤新的治療措施,其成為現(xiàn)代醫(yī)學(xué)腫瘤學(xué)治療的重要組成部分。人線粒體轉(zhuǎn)錄終止因子3(human mitochondrial transcription termination factor 3,hMTERF3)是一個負(fù)調(diào)控線粒體基因表達(dá)和氧化磷酸化活性的蛋白質(zhì)。已有研究報道,hMTERF3基因拷貝數(shù)擴(kuò)增及其過表達(dá)對肝細(xì)胞癌、乳腺癌、非小細(xì)胞肺癌和胰腺癌的發(fā)生、進(jìn)展和預(yù)后有重要作用,但目前,關(guān)于hMTERF3在腦膠質(zhì)瘤中的表達(dá)及其預(yù)后意義尚未見相關(guān)報道。本課題首先基于TCGA和Oncomine數(shù)據(jù)庫進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘并分析hMTERF3的表達(dá)與腦膠質(zhì)瘤臨床病理特征的關(guān)系,探討hMTERF3表達(dá)水平與腦膠質(zhì)瘤患者預(yù)后的相關(guān)性。通過免疫組織化學(xué)技術(shù)觀察hMTERF3蛋白在腦膠質(zhì)瘤和非腫瘤性腦組織中的表達(dá)。構(gòu)建及鑒定重組真核表達(dá)載體p3×FLAG-CMV-hMTERF3,并利用生物信息學(xué)方法預(yù)測hMTERF3蛋白的結(jié)構(gòu)與功能。進(jìn)一步研究轉(zhuǎn)染重組真核表達(dá)載體p3×FLAG-CMV-hMTERF3對腦膠質(zhì)瘤U251細(xì)胞的線粒體DNA拷貝數(shù)、線粒體蛋白表達(dá)水平及其細(xì)胞增殖、細(xì)胞周期等生物學(xué)行為的影響。本研究將為闡明hMTERF3在腦膠質(zhì)瘤發(fā)生和發(fā)展中的作用奠定實驗基礎(chǔ),也為腦膠質(zhì)瘤的診斷和治療提供潛在的分子靶標(biāo)。方法利用Oncomine數(shù)據(jù)庫檢索關(guān)于hMTERF3基因的信息,并對hMTERF3基因在腦膠質(zhì)瘤中的表達(dá)進(jìn)行薈萃分析;利用Bioconductor/TCGA biolinks函數(shù)包從TCGA數(shù)據(jù)庫(https://tcga-data.nci.nih.gov/tcga/)下載臨床資料數(shù)據(jù),使用R3.3.0軟件對TCGA數(shù)據(jù)庫中526例腦膠質(zhì)瘤患者的臨床病理參數(shù)與hMTERF3表達(dá)水平進(jìn)行相關(guān)性分析。使用Graphpad 5.0軟件對TCGA數(shù)據(jù)集中高表達(dá)hMTERF3和低表達(dá)hMTERF3的腦膠質(zhì)瘤患者的預(yù)后生存進(jìn)行Kaplan-Meier分析。同時,在大理州人民醫(yī)院收集2008~2012年的20例腦膠質(zhì)瘤組織及16例非腫瘤性腦組織標(biāo)本進(jìn)行免疫組化。20例腦膠質(zhì)瘤患者中男性13例,女性7例,年齡14~62歲,均為首次確診,手術(shù)前未經(jīng)化療、放療。采用免疫組織化學(xué)方法檢測上述標(biāo)本中hMTERF3蛋白的表達(dá)情況,并比較其表達(dá)水平的差異;根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫中hMTERF3基因序列設(shè)計引物,采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)從pGEM-hMTERF3重組克隆載體中擴(kuò)增出hMTERF3基因開放閱讀框序列,經(jīng)HindⅢ和BamHⅠ雙酶切后,連接入真核表達(dá)載體p3×FLAG-CMV-14的多克隆位點(diǎn)中,構(gòu)建重組質(zhì)粒p3×FLAG-CMV-hMTERF3,分別用菌落PCR、限制性核酸內(nèi)切酶和DNA序列分析3種方法鑒定重組子;利用不同的生物信息學(xué)軟件對hMTERF3蛋白進(jìn)行系統(tǒng)研究,包括hMTERF3的理化性質(zhì)、二級結(jié)構(gòu)功能域、亞細(xì)胞定位、同源蛋白多重序列比對、系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建及三級結(jié)構(gòu)同源建模;采用半定量PCR和Western blot檢測過表達(dá)hMTERF3對腦膠質(zhì)瘤U251細(xì)胞線粒體DNA拷貝量變化、線粒體編碼蛋白的表達(dá)水平。采用流式細(xì)胞術(shù)和MTT法檢測過表達(dá)hMTERF3對細(xì)胞周期及細(xì)胞增殖的影響。結(jié)果1、利用Oncomine數(shù)據(jù)庫分析發(fā)現(xiàn),hMTERF3在腦膠質(zhì)瘤組織中呈現(xiàn)高表達(dá)。TCGA數(shù)據(jù)庫中下載得到526例腦膠質(zhì)瘤患者的臨床病理資料,通過使用R軟件分析結(jié)果顯示,hMTERF3的表達(dá)與年齡(P=0.010)、腫瘤原發(fā)部位(P=0.048)、幕上定位(P=0.041)、等級(P0.001)及病理類型(P0.001)明顯相關(guān)。而與性別、發(fā)病部位、頭痛史、樣本類型無關(guān)(均P0.05)。進(jìn)一步利用Kaplan-Meier Plotter數(shù)據(jù)庫分析hMTERF3表達(dá)對腦膠質(zhì)瘤患者生存時間的影響發(fā)現(xiàn),hMTERF3高表達(dá)組的OS(P=0.001,HR=2.03)及DFS(P=0.004,HR=1.54)均低于hMTERF3低表達(dá)組,兩組間比較差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。多因素分析結(jié)果顯示,年齡、腫瘤原發(fā)部位等均是影響腦膠質(zhì)瘤患者預(yù)后的獨(dú)立預(yù)后因素(P0.05)。免疫組化分析表明,hMTERF3蛋白在腦膠質(zhì)瘤組織中高表達(dá),而在非腫瘤性腦組織中低表達(dá),在腦膠質(zhì)瘤組織中hMTERF3蛋白的表達(dá)主要定位在細(xì)胞質(zhì)中,呈淺黃色或棕黃色染色。其中腦膠質(zhì)瘤組織中hMTERF3蛋白的陽性表達(dá)較強(qiáng),染色較深,而在非腫瘤性腦組織中也可觀察到hMTERF3蛋白的表達(dá),但染色較淺。2、利用不同的生物信息學(xué)軟件對hMTERF3蛋白進(jìn)行系統(tǒng)研究發(fā)現(xiàn),hMTERF3蛋白的二級結(jié)構(gòu)主要為α-螺旋和無規(guī)則卷曲,同時包含6個MTERF基序,三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果與二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果相一致;亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示,該蛋白定位于人線粒體內(nèi);同源蛋白多重序列比對和進(jìn)化分析顯示,該蛋白與大鼠、小鼠等哺乳動物的MTERF3蛋白具有高度的同源性,且親緣關(guān)系更近。重組質(zhì)粒p3×FLAG-CMV-hMTERF3經(jīng)雙酶切鑒定和菌落PCR鑒定均獲得大小為1254bp的目的條帶,DNA序列分析結(jié)果表明該序列與GenBank中hMTERF3基因序列的同源性達(dá)到100%,插入基因的大小和方向均正確。3、轉(zhuǎn)染腦膠質(zhì)瘤U251細(xì)胞后通過半定量PCR檢測線粒體DNA拷貝量發(fā)現(xiàn),過表達(dá)hMTERF3對線粒體DNA的復(fù)制起顯著抑制作用;Western blot檢測發(fā)現(xiàn)hMTERF3過強(qiáng)表達(dá)會降低線粒體編碼的ND1蛋白水平;MTT檢測結(jié)果顯示,過表達(dá)hMTERF3促進(jìn)U251細(xì)胞的增殖;流式細(xì)胞術(shù)分析細(xì)胞周期發(fā)現(xiàn),hMTERF3過強(qiáng)表達(dá)能促進(jìn)細(xì)胞增殖,并導(dǎo)致細(xì)胞順利通過G1/S控制點(diǎn),細(xì)胞周期未出現(xiàn)阻滯和凋亡。結(jié)論1、研究表明,基于TCGA和Oncomine數(shù)據(jù)庫獲取腦膠質(zhì)瘤組織中hMTERF3表達(dá)的相關(guān)信息,為深入研究hMTERF3在腦膠質(zhì)瘤發(fā)生發(fā)展中的作用奠定基礎(chǔ)。免疫組化檢測hMTERF3蛋白在人腦膠質(zhì)瘤中的表達(dá)增高,提示hMTERF3可能參與人腦膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展,并且可能與腫瘤的惡性程度密切相關(guān)。2、成功構(gòu)建hMTERF3基因的真核表達(dá)載體,為進(jìn)一步研究hMTERF3基因在惡性腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用奠定基礎(chǔ);利用不同的生物信息學(xué)軟件分析該蛋白的結(jié)構(gòu),這為進(jìn)一步研究該蛋白的功能奠定了基礎(chǔ)。3、在腦膠質(zhì)瘤U251細(xì)胞中過表達(dá)hMTERF3顯著抑制線粒體DNA的復(fù)制水平,并且影響線粒體編碼ND1蛋白質(zhì)的表達(dá)水平。同時過表達(dá)hMTERF3能顯著促進(jìn)U251細(xì)胞增殖,促進(jìn)細(xì)胞周期G0/G1期向S期的轉(zhuǎn)變進(jìn)程,并且不導(dǎo)致細(xì)胞凋亡。
【圖文】:

輕鏈,氧化磷酸化,呼吸鏈,線粒體


鏈和輕鏈復(fù)制起點(diǎn)(箭頭表示方向),黃色方框表A 和編碼蛋白的基因。圖 1-1. 人線粒體 DNA 結(jié)構(gòu)圖 為雙鏈閉合環(huán)狀,,外環(huán)稱重鏈(H),內(nèi)環(huán)稱于兩條鏈所含有的核苷酸不同所引起的,重A 分子量較大,而輕鏈胞嘧啶所占比重較多編碼氧化磷酸化呼吸鏈復(fù)合體亞基上的 12 種,而輕鏈只編碼氧化磷酸化呼吸鏈復(fù)合體亞NA。線粒體 DNA 上的基因排列非常緊湊,一小段 D 環(huán)區(qū)(displacement loop)無基因編碼含有線粒體 DNA 復(fù)制及轉(zhuǎn)錄所需要的調(diào)控序uence box, CSB)、復(fù)制相關(guān)的終止結(jié)合序列(和線粒體 DNA 轉(zhuǎn)錄的啟動子序列[12,13]。線,重鏈上 2 個(HSP1,HSP2)及輕鏈上 1 個(LS

示意圖,家族,蛋白,示意圖


高遷移蛋白家族(HMG)。在線粒體DNA的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和揮重要的作用[28,29]。線粒體轉(zhuǎn)錄因子B(TFB1M,TFB2M)重要調(diào)控因子,由核基因編碼通過特殊的方式轉(zhuǎn)運(yùn)到線TFB2M與線粒體RNA聚合酶(POLRMT)形成異源二啟動子開始轉(zhuǎn)錄[30]。轉(zhuǎn)錄終止因子(mitochondrial transcription termination fact因編碼通過特殊的方式轉(zhuǎn)運(yùn)到線粒體,并能與mtDNA在線粒體DNA的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄以及翻譯中發(fā)揮調(diào)控作用[發(fā)現(xiàn),線粒體轉(zhuǎn)錄終止因子蛋白家族有4個成員(MTETERF2僅存在于脊柱動物中,而MTERF3和MTERF4在都存在,并且它們之間都含有亮氨酸拉鏈樣結(jié)構(gòu)和與m蛋白家族主要的特征是:定位于線粒體和存在不定重復(fù)數(shù)氨基酸折疊而成的亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu))。
【學(xué)位授予單位】:大理大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R739.41

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本文編號:2681608

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