【摘要】：抑郁癥是腦腫瘤的常見并發(fā)癥,且在臨床診斷中抑郁癥狀已成為膠質(zhì)瘤的首發(fā)臨床表現(xiàn)。腦腫瘤與抑郁癥是否有關(guān)聯(lián),腦腫瘤能否引發(fā)抑郁癥,或者抑郁可導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生,這些都是人們關(guān)注的主要問題。然而至今對此仍知之甚少。本文通過對抑郁癥與膠質(zhì)瘤發(fā)病分子機(jī)制關(guān)聯(lián)分析的研究,以尋找該問題的答案。本文采用整合數(shù)據(jù)的方式,系統(tǒng)分析了HG-U133A和HG-U133Plus2兩個(gè)平臺(tái)的47個(gè)不同數(shù)據(jù)集,包括367個(gè)抑郁癥樣本,1726個(gè)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤樣本。然后利用R語言limma包中的線性回歸和經(jīng)典貝葉斯方法得到463個(gè)MDD的差異表達(dá)基因,823個(gè)GBM的差異表達(dá)基因。并且發(fā)現(xiàn)MDD和GBM存在27個(gè)共同的差異表達(dá)基因,其中,LOX,NPY1R,SHANK3,VEGFA基因已被研究發(fā)現(xiàn)同時(shí)與MDD和GBM有關(guān)聯(lián)。在獲得差異表達(dá)基因后,用Targetscan工具對其進(jìn)行本地化miRNA預(yù)測;同時(shí),通過STRING在線平臺(tái)獲得其蛋白互作網(wǎng)絡(luò),并用MCODE算法聚類得到其顯著核心基因模塊。通過Cytoscape對MDD和GBM的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析得到4個(gè)重疊關(guān)鍵基因,分別是:CXCR4,VEGFA,MGP,GNB5;且CXCR4,GNB5基因也存在于顯著核心基因模塊。同時(shí)通過差異表達(dá)基因、顯著核心基因模塊、預(yù)測到的miRNA三個(gè)方面進(jìn)行功能注釋和富集分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)MDD與GBM存在23條KEGG生物調(diào)控共同通路,經(jīng)醫(yī)學(xué)本體信息檢索平臺(tái)COREMINE進(jìn)行文本挖掘,確定其中的13條生物通路作為兩種疾病的共同調(diào)控通路。最后,利用Apriori算法對抑郁癥和膠質(zhì)瘤的差異表達(dá)基因及GO生物途徑進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,并進(jìn)一步構(gòu)建抑郁癥和膠質(zhì)瘤的發(fā)病分子機(jī)制網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),PLA2G5、LOC644794、VEGFA、MYO10,DAB2IP,FGFR2這6個(gè)基因在MDD發(fā)病分子機(jī)制網(wǎng)絡(luò)顯著存在;PRKCZ,CDC42,EGFR,PAK1,CAMK2A,CAMK2B,VEGFA,GABRG2,GABRA5,MAL2,HCN1,CPEB3,TAC1,這13個(gè)基因在GBM發(fā)病分子機(jī)制網(wǎng)絡(luò)顯著存在;同時(shí)發(fā)現(xiàn)VEGFA基因與MDD和GBM的發(fā)病分子機(jī)制有顯著關(guān)聯(lián)。研究表明重度抑郁癥和膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的發(fā)病分子機(jī)制存在緊密關(guān)聯(lián),功能富集分析所發(fā)現(xiàn)的共同調(diào)控通路將有助于抑郁癥和膠質(zhì)瘤的發(fā)病機(jī)理研究。本研究可為抑郁癥和膠質(zhì)瘤的生物標(biāo)志物研究奠定基礎(chǔ),為疾病精準(zhǔn)診斷及治療提供新思路,也為正確闡釋抑郁癥和膠質(zhì)瘤之間的關(guān)聯(lián)研究提供新方法。
【圖文】：

數(shù)據(jù)質(zhì)量可視化圖

圖 2.2 合并數(shù)據(jù)的箱線圖。A 為合并原始數(shù)據(jù)的箱線圖；B 為合并原始數(shù)據(jù)經(jīng) RMA 預(yù)處理后的箱線圖。Fig 2.2 A box-plot graph for merging data.
【學(xué)位授予單位】：重慶郵電大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號(hào)】：R749.41;R739.41

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前2條

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相關(guān)博士學(xué)位論文 前2條

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本文編號(hào)：2646080