自身免疫性腦炎患者腦脊液代謝組學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2020-04-28 20:50
【摘要】:目的:應(yīng)用核磁共振(NMR)技術(shù),觀察自身免疫性腦炎(AE)患者腦脊液代謝組學(xué)的變化。方法:收集我院2016年12月至2018年2月間收集的AE組(28例)、自身免疫性腦炎抗體陰性可疑AE組(NA組,31例)、正常對照組(CN組,30例)患者的腦脊液標(biāo)本,離心后低溫冷藏保存。實(shí)驗(yàn)前將標(biāo)本取出,解凍并加入緩沖液,進(jìn)行預(yù)處理,并采用NMR儀器進(jìn)行測試,最后將所得數(shù)據(jù)進(jìn)行處理分析,并對所得譜圖進(jìn)行主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘法-判別式分析(OPLS-DA),使用排列驗(yàn)證(Arrangement verification)對建立的OPLS-DA模型進(jìn)行驗(yàn)證,最后將OPLS-DA模型中VIP值1.0的差異代謝物進(jìn)行雙側(cè)T檢驗(yàn),考察差異性代謝物在兩組間變化的顯著性。同時(shí)滿足VIP1.0和p0.05的變量即為具有顯著差異的代謝物。結(jié)果:采用NMR技術(shù)在三組腦脊液中共獲得36種主要代謝物;在AE組腦脊液中篩選并鑒定出10種差異性代謝物,在NA組患者腦脊液中篩選鑒定出19種差異性代謝物。在AE組腦脊液中,丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代謝、牛磺酸和亞;撬岽x、酮體的合成與降解影響權(quán)重較大(0.1~0.7)。而在NA組腦脊液代謝中,甘氨酸、絲氨酸和蘇氨酸代謝、甘油酯代謝、牛磺酸和亞;撬岽x、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代謝影響權(quán)重較大(0.2~0.4),部分代謝路徑相同。結(jié)論:AE患者有其特殊的代謝網(wǎng)絡(luò),與NA組的主要差異在于酮體的合成與降解。AE組與NA組患者大部分代謝徑路相同,提示NA可能與AE的發(fā)病有關(guān)。乙酰胺和乙酰乙酸可作為自身免疫性腦炎診斷的候選診斷標(biāo)志物,但該結(jié)果仍需要多中心、大樣本驗(yàn)證。
【圖文】:
圖 4.1 3 組腦脊液的1H NMR 譜圖注:CN:正常對照組;NA:抗體陰性可疑 AE 組;AE:自身免疫腦炎組)表 4.11H NMR 譜圖分析所得全部代謝物及其化學(xué)位移值 代謝物 化學(xué)位移值(ppm) 在圖 1 中對應(yīng)的序號 HMDB num2-hdroxy isovalerate 2-羥基異戊酸酯2-hydroxy butyrate 2-羥基丁酸酯L-leucine L-亮氨酸L-valine L-纈氨酸L-isoleucine L-異亮氨酸Isobutyrate 異丁酸鹽Propylene glycol 丙二醇Ethanol 乙醇0.82d0.89t0.95t0.98d1.00s1.05d1.15d1.19t12345678HMDB0000HMDB0000HMDB0000HMDB0000HMDB0000HMDB0001HMDB0001HMDB0000
第 4 章 結(jié) 果將 3 組腦脊液的1H NMR 譜圖數(shù)據(jù)進(jìn)行 PCA 分析,去掉異常數(shù)據(jù),得到 P4.2)。本實(shí)驗(yàn) 3 組腦脊液數(shù)據(jù)構(gòu)建的 PCA 模型擁有 12 個成分(R2=0.479,,Q2圖 4.2 可見,與其它 2 組相比,CN 組樣本聚集性較好,也可以分別與 AE 組和區(qū)分開。AE 組和 NA 組樣本聚類趨勢不明顯,不易區(qū)分。
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R744.5
【圖文】:
圖 4.1 3 組腦脊液的1H NMR 譜圖注:CN:正常對照組;NA:抗體陰性可疑 AE 組;AE:自身免疫腦炎組)表 4.11H NMR 譜圖分析所得全部代謝物及其化學(xué)位移值 代謝物 化學(xué)位移值(ppm) 在圖 1 中對應(yīng)的序號 HMDB num2-hdroxy isovalerate 2-羥基異戊酸酯2-hydroxy butyrate 2-羥基丁酸酯L-leucine L-亮氨酸L-valine L-纈氨酸L-isoleucine L-異亮氨酸Isobutyrate 異丁酸鹽Propylene glycol 丙二醇Ethanol 乙醇0.82d0.89t0.95t0.98d1.00s1.05d1.15d1.19t12345678HMDB0000HMDB0000HMDB0000HMDB0000HMDB0000HMDB0001HMDB0001HMDB0000
第 4 章 結(jié) 果將 3 組腦脊液的1H NMR 譜圖數(shù)據(jù)進(jìn)行 PCA 分析,去掉異常數(shù)據(jù),得到 P4.2)。本實(shí)驗(yàn) 3 組腦脊液數(shù)據(jù)構(gòu)建的 PCA 模型擁有 12 個成分(R2=0.479,,Q2圖 4.2 可見,與其它 2 組相比,CN 組樣本聚集性較好,也可以分別與 AE 組和區(qū)分開。AE 組和 NA 組樣本聚類趨勢不明顯,不易區(qū)分。
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R744.5
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號:2643854
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