【摘要】：背景:椎管內神經鞘瘤(interspinal Schwannoma,IS)是椎管內脊髓外的良性腫瘤,發(fā)生機制不明。研究表明microRNA(miRNA)能結合其下游靶基因的mRNA調控基因表達,亦能被其上游轉錄因子(transcriptionfactors,TFs)所調節(jié)。Hsa-miR-17-92基因簇是多順反子miRNA基因簇,編碼miR-17、miR-18a、miR-19a、miR-19b、miR-20a和miR-92a,參與多種生物過程,但是其在IS中的表達、作用和可能的調控通路尚不明確。目的:初步探究IS和下肢神經(lower extremity nerve,LN)中miR-17-92基因簇及其編碼的 7 個miRNAs(miR-17-5p、miR-17-3p、miR-18a-5p、miR-19a-3p、miR-19b-3p、miR-20a-5p 和 miR-92a-3p)的表達,構建 miR-17-5p、miR-18a-5p、miR-20a-5p 和 miR-92a-3p 的 TFs-miRNA-mRNAs 網絡,同時分析其預測的下游靶基因的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interactions,PPIs)、基因本體(Gene Ontology,GO)和京都基因與基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路。方法.:無菌收集20例IS和10例LN標本,RT-qPCR檢測miR-17-92基因簇及其編碼的 7 個 miRNAs(miR-17-5p、miR-17-3p、miR-18a-5p、miR-19a-3p、miR-19b-3p、miR-20a-5p 和 miR-92a-3p)的表達。miRBase、PROMO 和 Targetscan預測 miR-17-5p、miR-18a-5p、miR-20a-5p 和 miR-92a-3p 的上游 TFs 和下游靶基因,STRING v1O 分析 PPIs,Cytoscape 軟件構建 TFs-miRNA-mRNAs 網絡,ClusterProfiler R 和 KOBAS3.0 軟件分析 GO 和 KEGG 通路。結果:相較于LN,除miR-17-3p(P=8.664E-02)外,miR-17-92基因簇和其余的6個miRNAs在IS中均低表達(P0.05),尤其是miR-18a-5p及miR-20a-3p。多條TFs-miRNAs-mRNAs網絡得以構建,GO顯示靶基因多富集于神經元和突起內含氮復合物代謝的正向調節(jié)過程,涉及絲/蘇氨酸蛋白激酶和TFs活性等方面。KEGG通路顯示多個靶基因參與軸突導向(axonguidance,AG)調控。結論:根據本實驗結果可認為①miR-17-92基因簇參與IS的發(fā)生可能是由其編碼的 miR-17-5p、miR-18a-5p、miR-19a-3p、miR-19b-3p、miR-20a-5p 和 miR-92a-3p所介導;②miR-17-3p可能不參與IS發(fā)生,或者不是IS發(fā)生的主要因素;③miR-17-3p、miR-18a-5p、miR-20a-5p 和 miR-92a-3p 及其各自形成的 TFs-miRNA-mRNAs網絡能通過包括絲/蘇氨酸蛋白激酶信號通路參與突觸導向過程,可為IS的診治提供重要的研究方向和潛在的靶點。
【圖文】：

２．１．２實驗標本處理逡逑無菌條件下收集ＩＳ和ＬＮ，剔除ＩＳ包膜和ＬＮ表面結締組織，，標本標記后逡逑立即至于液氮灌中，待本院病理（圖２．１）證實后進行后續(xù)實驗。本研究經廈門逡逑大學附屬福州第二醫(yī)院倫理委員會的批準，患者或法定監(jiān)護人簽署知情同意書。逡逑圖２．１椎管內神經鞘瘤及術后病理逡逑Ｆｉｇ．２．１邋Ｉｎｔｅｒｓｐｉｎａｌ邋ｓｃｈｗａｎｎｏｍａ邋ａｎｄ邋ｐｏｓｔ－ｏｐｅｒａｔｉｏｎ邋ｐａｔｈｏｌｏｇｙ逡逑４逡逑

圖３．１－２邋１％瓊脂糖凝膠電泳檢測ＲＮＡ完整性逡逑Ｆｉｇ．邋３．１－２邋Ｉｎｔｅｇｒｉｔｙ邋ｏｆ邋ＲＮＡ邋ｄｅｔｅｃｔｅｄ邋ｂｙ邋１％邋ａｇａｒｏｓｅ邋ｇｅｌ邋ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ１２逡逑
【學位授予單位】：廈門大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2018
【分類號】：R739.4

【參考文獻】

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本文編號：2606645