發(fā)布時間：2020-03-29 23:09

【摘要】：背景:椎管內(nèi)神經(jīng)鞘瘤(interspinal Schwannoma,IS)是椎管內(nèi)脊髓外的良性腫瘤,發(fā)生機(jī)制不明。研究表明microRNA(miRNA)能結(jié)合其下游靶基因的mRNA調(diào)控基因表達(dá),亦能被其上游轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionfactors,TFs)所調(diào)節(jié)。Hsa-miR-17-92基因簇是多順反子miRNA基因簇,編碼miR-17、miR-18a、miR-19a、miR-19b、miR-20a和miR-92a,參與多種生物過程,但是其在IS中的表達(dá)、作用和可能的調(diào)控通路尚不明確。目的:初步探究IS和下肢神經(jīng)(lower extremity nerve,LN)中miR-17-92基因簇及其編碼的 7 個miRNAs(miR-17-5p、miR-17-3p、miR-18a-5p、miR-19a-3p、miR-19b-3p、miR-20a-5p 和 miR-92a-3p)的表達(dá),構(gòu)建 miR-17-5p、miR-18a-5p、miR-20a-5p 和 miR-92a-3p 的 TFs-miRNA-mRNAs 網(wǎng)絡(luò),同時分析其預(yù)測的下游靶基因的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interactions,PPIs)、基因本體(Gene Ontology,GO)和京都基因與基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路。方法.:無菌收集20例IS和10例LN標(biāo)本,RT-qPCR檢測miR-17-92基因簇及其編碼的 7 個 miRNAs(miR-17-5p、miR-17-3p、miR-18a-5p、miR-19a-3p、miR-19b-3p、miR-20a-5p 和 miR-92a-3p)的表達(dá)。miRBase、PROMO 和 Targetscan預(yù)測 miR-17-5p、miR-18a-5p、miR-20a-5p 和 miR-92a-3p 的上游 TFs 和下游靶基因,STRING v1O 分析 PPIs,Cytoscape 軟件構(gòu)建 TFs-miRNA-mRNAs 網(wǎng)絡(luò),ClusterProfiler R 和 KOBAS3.0 軟件分析 GO 和 KEGG 通路。結(jié)果:相較于LN,除miR-17-3p(P=8.664E-02)外,miR-17-92基因簇和其余的6個miRNAs在IS中均低表達(dá)(P0.05),尤其是miR-18a-5p及miR-20a-3p。多條TFs-miRNAs-mRNAs網(wǎng)絡(luò)得以構(gòu)建,GO顯示靶基因多富集于神經(jīng)元和突起內(nèi)含氮復(fù)合物代謝的正向調(diào)節(jié)過程,涉及絲/蘇氨酸蛋白激酶和TFs活性等方面。KEGG通路顯示多個靶基因參與軸突導(dǎo)向(axonguidance,AG)調(diào)控。結(jié)論:根據(jù)本實驗結(jié)果可認(rèn)為①miR-17-92基因簇參與IS的發(fā)生可能是由其編碼的 miR-17-5p、miR-18a-5p、miR-19a-3p、miR-19b-3p、miR-20a-5p 和 miR-92a-3p所介導(dǎo);②miR-17-3p可能不參與IS發(fā)生,或者不是IS發(fā)生的主要因素;③miR-17-3p、miR-18a-5p、miR-20a-5p 和 miR-92a-3p 及其各自形成的 TFs-miRNA-mRNAs網(wǎng)絡(luò)能通過包括絲/蘇氨酸蛋白激酶信號通路參與突觸導(dǎo)向過程,可為IS的診治提供重要的研究方向和潛在的靶點。
【圖文】：

２．１．２實驗標(biāo)本處理逡逑無菌條件下收集ＩＳ和ＬＮ，剔除ＩＳ包膜和ＬＮ表面結(jié)締組織，，標(biāo)本標(biāo)記后逡逑立即至于液氮灌中，待本院病理（圖２．１）證實后進(jìn)行后續(xù)實驗。本研究經(jīng)廈門逡逑大學(xué)附屬福州第二醫(yī)院倫理委員會的批準(zhǔn)，患者或法定監(jiān)護(hù)人簽署知情同意書。逡逑圖２．１椎管內(nèi)神經(jīng)鞘瘤及術(shù)后病理逡逑Ｆｉｇ．２．１邋Ｉｎｔｅｒｓｐｉｎａｌ邋ｓｃｈｗａｎｎｏｍａ邋ａｎｄ邋ｐｏｓｔ－ｏｐｅｒａｔｉｏｎ邋ｐａｔｈｏｌｏｇｙ逡逑４逡逑

圖３．１－２邋１％瓊脂糖凝膠電泳檢測ＲＮＡ完整性逡逑Ｆｉｇ．邋３．１－２邋Ｉｎｔｅｇｒｉｔｙ邋ｏｆ邋ＲＮＡ邋ｄｅｔｅｃｔｅｄ邋ｂｙ邋１％邋ａｇａｒｏｓｅ邋ｇｅｌ邋ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ１２逡逑
【學(xué)位授予單位】：廈門大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號】：R739.4

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：2606645