【摘要】：神經(jīng)母細(xì)胞瘤是一種最常見的兒童顱外腫瘤,起源于交感神經(jīng)系統(tǒng)的任意神經(jīng)脊部位,一般在5歲以下的兒童中較常見,平均年齡差不多18個(gè)月,有著高達(dá)15%以上的兒童腫瘤死亡率,有時(shí),在一些10歲左右的兒童中,也會(huì)有很少數(shù)患病。而目前神經(jīng)母細(xì)胞瘤真正的致病分子機(jī)理尚不清楚,但是一些易感基因,或者一些染色體異常對(duì)神經(jīng)母細(xì)胞瘤疾病的產(chǎn)生有著重要的作用。隨著對(duì)基因組序列的不斷研究,RNA-Seq測(cè)序技術(shù)、全基因組測(cè)序技術(shù)和Exome-Seq測(cè)序技術(shù)等技術(shù)的不斷進(jìn)步,我們?cè)诎l(fā)現(xiàn)越來越多的SNPs對(duì)疾病的有影響的同時(shí),也發(fā)現(xiàn)基于拷貝數(shù)變異對(duì)基因組序列的研究和疾病的研究占據(jù)著越來越顯著的地位。通過閱讀文獻(xiàn),我們知道拷貝數(shù)變異對(duì)神經(jīng)神經(jīng)母細(xì)胞瘤起了很重要的作用,而且大量的實(shí)驗(yàn)結(jié)果也證實(shí)了很多拷貝數(shù)變異位置對(duì)神經(jīng)母細(xì)胞瘤的作用。在此,為了更好更全面的了解神經(jīng)母細(xì)胞瘤中的拷貝數(shù)變異,我們對(duì)神經(jīng)母細(xì)胞瘤中的變異,特別是拷貝數(shù)變異進(jìn)行有效的分析和獲取有效的結(jié)果。 由于近些年來,第二代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展和成熟,我們對(duì)498個(gè)神經(jīng)母細(xì)胞瘤病人進(jìn)行高通量數(shù)據(jù)測(cè)序,對(duì)所有的神經(jīng)母細(xì)胞瘤病人都進(jìn)行RNA-Seq高通量測(cè)序,同時(shí)對(duì)其中的30個(gè)病人正常和對(duì)照組進(jìn)行Exome-Seq測(cè)序技術(shù)測(cè)序。通過對(duì)這些樣本數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合分析,檢測(cè)數(shù)據(jù)中的拷貝數(shù)變異,通過對(duì)該數(shù)據(jù)的變異分析,結(jié)合相應(yīng)的差異表達(dá)基因數(shù)據(jù),我們不僅可以得到多個(gè)基因與神經(jīng)母細(xì)胞瘤有可能相關(guān),如：MYCN, NBAS, NAIP, DDX1等基因與神經(jīng)母細(xì)胞瘤疾病有關(guān),也發(fā)現(xiàn)了GTF2H2等新基因很可能與神經(jīng)母細(xì)胞瘤相關(guān)；同時(shí)也發(fā)現(xiàn)了28個(gè)基因亞帶可能與該疾病相關(guān),其中包括基因亞帶1q21.1、1q21.2等。特別是,發(fā)現(xiàn)了4q13.2、5q13.2、17p11.2和15q25.2這4個(gè)基因亞帶非常有可能與致死神經(jīng)母細(xì)胞瘤相關(guān),在這些基因亞帶中,包含了很多與神經(jīng)母細(xì)胞瘤疾病相關(guān)的基因,以及一些對(duì)骨髓和神經(jīng)元發(fā)育的有著重要作用的基因。不管這些基因,還是基因亞帶的發(fā)現(xiàn),對(duì)治療神經(jīng)母細(xì)胞瘤和個(gè)體治療都有著很大的幫組。
[Abstract]:Neuroblastoma is one of the most common extracranial tumors in children. It originates from any part of the sympathetic nerve system and is more common in children under 5 years of age, with an average age of about 18 months. There are more than 15% of childhood cancer deaths, and sometimes a small number of children around the age of 10 suffer from the disease. At present, the mechanism of neuroblastoma is not clear, but some susceptible genes or some chromosomal abnormalities play an important role in the development of neuroblastoma. With the continuous research of genome sequence, RNA-Seq sequencing technology, whole genome sequencing technology and Exome-Seq sequencing technology, we find that more and more SNPs have influence on disease at the same time. It is also found that the study of genome sequence and disease based on copy number variation is becoming more and more important. By reading the literature, we know that copy number variation plays an important role in neuroblastoma, and a large number of experimental results also confirm the role of many copy number variation sites on neuroblastoma. In order to better understand the copy number variation in neuroblastoma, we analyze the variation in neuroblastoma, especially copy number variation, and obtain effective results. Due to the development and maturity of the second generation sequencing technology in recent years, 498 patients with neuroblastoma were sequenced with high-throughput data, and all patients with neuroblastoma were subjected to high-throughput RNA-Seq sequencing. At the same time, 30 of the patients were sequenced by Exome-Seq sequencing technique. Through the comprehensive analysis of these sample data, the copy number variation in the data is detected, and through the variation analysis of the data, combining with the corresponding differential expression gene data, We can not only find that many genes may be associated with neuroblastoma, such as: MYCN, NBAS, NAIP, DDX1 and other genes, but also find that new genes such as GTF2H2 may be associated with neuroblastoma. At the same time, 28 gene subbands were found to be related to the disease, including 1q21.1 / 1q21.2 and so on. In particular, four gene subbands, 4q13.2n5q13.2n17p11.2 and 15q25.2, are highly likely to be associated with lethal neuroblastoma, which contain many genes associated with neuroblastoma disease. And genes that play an important role in the development of bone marrow and neurons. Whether these genes or the discovery of gene subbands, there is a great deal of help in the treatment of neuroblastoma and individual therapy.
【學(xué)位授予單位】：華東師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類號(hào)】：R739.41

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本文編號(hào)：2301964