目的:本研究旨在從HMGB1基因范圍內(nèi)篩選出與HBV感染所致急性肝衰竭密切關(guān)聯(lián)的標(biāo)簽SNP位點和單倍型,進(jìn)行關(guān)聯(lián)研究分析,由此可能提供一種新的立足于基因的預(yù)測方法,可以對HBV感染所致急性肝衰竭易患性進(jìn)行早期預(yù)測,為臨床醫(yī)生提供預(yù)警信息。方法:通對HMGB1基因進(jìn)行系統(tǒng)掃描并查詢大量國內(nèi)外相關(guān)文獻(xiàn),確定7個SNP位點,由1000Genomes數(shù)據(jù)庫下載中國北京漢族人群的SNP基因分型數(shù)據(jù),利用Haploview軟件進(jìn)行連鎖不平衡分析,構(gòu)建該基因的單倍型并進(jìn)行標(biāo)簽SNPs的篩選。選擇2012年9月至2018年12月我院住院或門診診治的急性肝衰竭患者64例,男33例,女31例,平均年齡(39.14±8.28),樣本符合本課題納入標(biāo)準(zhǔn),收集樣本需獲得受試者的知情同意。以數(shù)據(jù)庫源信息作為對照組,采用一代測序法對疾病組的SNPs進(jìn)行基因分型,SPSS19.0軟件分析標(biāo)簽SNPs的基因型、等位基因及單倍型在兩組中的分布差異。結(jié)果:通過查找發(fā)現(xiàn)HMGB1基因在人類第13號染色體上,所獲取的HMGB1基因序列范圍內(nèi)共構(gòu)建5種常見單倍型(C-C、T-G、G-T-A-A、G-C-G-C、C-C-G-C)和3個標(biāo)簽SNPs(rs1045411、rs2249825、rs1412125),其中rs2249825和rs1412125的基因型、等位基因頻率在疾病組與對照組分布存在統(tǒng)計學(xué)差異(P0.05),由rs2249825、rs1412125、rs9508752、rs2892547位點構(gòu)建的單倍型G-C-G-C、C-C-G-C頻率在中兩組分布有統(tǒng)計學(xué)差異(P0.05)。結(jié)論:HMGB1基因多態(tài)性與HBV感染致急性肝衰竭顯著相關(guān),其中所構(gòu)建的單倍型包括G-C-G-C、C-C-G-C(rs2249825-rs1412125-rs9508752-rs2892547),挑選的標(biāo)簽SNPs包括rs2249825、rs1412125。以上單倍型均可能增加患HBV感染致急性肝衰竭的風(fēng)險,且挑選的標(biāo)簽SNPs攜帶C等位基因的人群也可能增加HBV感染致急性肝衰竭的易感性。
【學(xué)位單位】：山西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位年份】：2019
【中圖分類】：R575.3
【部分圖文】：

山西醫(yī)科大學(xué)（博）碩士學(xué)位論文2 結(jié) 果從 1000Genomes 數(shù)據(jù)庫查得 HMGB1 基因在人類第 13 號染色體上，獲取中北京漢族人群（CHB）的 7 個 SNP 位點基因分型數(shù)據(jù)，其中 MAF 有 6 個＞0.05rs1360485 未在該人群中找到。所獲取的 HMGB1 基因序列范圍內(nèi)共 2 個單倍域Block1 全長 3kb，有 2 個 SNP 位點（rs1045411 和 rs3742305），構(gòu)成 2 種常見倍型（C-C 和 T-G），第 1 位點是標(biāo)簽 SNPs（即 rs1045411）；Block2 全長 5k有 4 個 SNP 位點（rs2249825、rs1412125、rs9508752 和 rs2892547），構(gòu)成 3常見單倍型（G-T-A-A、C-C-G-C 和 G-C-G-C），第 3、4 位點是標(biāo)簽 SNPs（即 rs2249和 rs1412125）。疾病組的 rs1360485 因 MAF＜0.05 也被排除（見圖 2-1、2-2）

山西醫(yī)科大學(xué)（博）碩士學(xué)位論文2 結(jié) 果從 1000Genomes 數(shù)據(jù)庫查得 HMGB1 基因在人類第 13 號染色體上，獲取中北京漢族人群（CHB）的 7 個 SNP 位點基因分型數(shù)據(jù)，其中 MAF 有 6 個＞0.05rs1360485 未在該人群中找到。所獲取的 HMGB1 基因序列范圍內(nèi)共 2 個單倍域Block1 全長 3kb，有 2 個 SNP 位點（rs1045411 和 rs3742305），構(gòu)成 2 種常見倍型（C-C 和 T-G），第 1 位點是標(biāo)簽 SNPs（即 rs1045411）；Block2 全長 5k有 4 個 SNP 位點（rs2249825、rs1412125、rs9508752 和 rs2892547），構(gòu)成 3常見單倍型（G-T-A-A、C-C-G-C 和 G-C-G-C），第 3、4 位點是標(biāo)簽 SNPs（即 rs2249和 rs1412125）。疾病組的 rs1360485 因 MAF＜0.05 也被排除（見圖 2-1、2-2）
【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 楊曉丹;;中蒙藥對急性肝衰竭的作用及機(jī)制[J];中國民族醫(yī)藥雜志;2019年04期

2 王偉靜;謝青;;急性肝衰竭治療新方案:細(xì)胞外囊泡[J];肝臟;2018年06期

3 王國淼;張宇雪;趙云潔;李勇;;中西醫(yī)結(jié)合治療亞急性肝衰竭1例報告[J];湖南中醫(yī)雜志;2018年08期

4 李侗曾;王穎;梁連春;;急性肝衰竭的管理[J];北京醫(yī)學(xué);2016年12期

5 夏鵬;邱澤武;胡文煒;王瑞玲;鞠鵬;趙瑋;;藥物性急性肝衰竭治療措施及有效性分析[J];中國煤炭工業(yè)醫(yī)學(xué)雜志;2014年12期

6 梅松政;;理性看中草藥致急性肝衰竭[J];家庭中醫(yī)藥;2014年06期

7 楊鵬飛;顏炳柱;楊寶山;;骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞治療急性肝衰竭的研究進(jìn)展[J];肝臟;2014年01期

8 周新民;;急性肝衰竭病情評估與處理[J];透析與人工器官;2011年02期

9 馬寧;張吉平;;甲狀腺危象合并亞急性肝衰竭死亡病例分析[J];航空航天醫(yī)藥;2010年02期

10 袁慧琳;張穎冬;葉民;張宙;孫恒斌;;高滲性非酮癥糖尿病昏迷合并急性肝衰竭1例[J];中國實用醫(yī)藥;2009年36期

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 韓悅;TLR2通路缺陷在HBV急性肝衰竭的作用機(jī)制研究[D];上海交通大學(xué);2017年

2 李舒;淫羊藿素增強(qiáng)間充質(zhì)干細(xì)胞治療急性肝衰竭的實驗研究[D];廣州中醫(yī)藥大學(xué);2018年

3 李艷偉;骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞向M2極化改善大鼠急性肝衰竭的機(jī)制研究[D];中國醫(yī)科大學(xué);2018年

4 周一鳴;干細(xì)胞分化及其對急性肝衰竭大鼠治療的實驗研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2005年

5 徐旭雯;粒細(xì)胞集落刺激因子治療急性肝衰竭的實驗研究[D];中南大學(xué);2006年

6 余立敏;茵陳澤蘭方對急性肝衰竭大鼠肝損傷及肝再生的影響[D];湖北中醫(yī)學(xué)院;2007年

7 蔡磊;基于微囊化豬肝細(xì)胞的生物人工肝治療食蟹猴急性肝衰竭的實驗研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2017年

8 姜雪強(qiáng);脂氧素對急性肝衰竭的保護(hù)作用及其作用機(jī)制探討[D];華中科技大學(xué);2011年

9 廉麗花;傳統(tǒng)中藥肝保護(hù)作用及其分子機(jī)制研究[D];延邊大學(xué);2011年

10 吳艷玲;刺五加酸、紅景天苷對小鼠急性肝衰竭的保護(hù)作用及干預(yù)機(jī)制研究[D];延邊大學(xué);2009年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 馬浩軒;茵陳四苓顆粒聯(lián)合骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞對急性肝衰竭大鼠線粒體凋亡途徑的影響[D];西南醫(yī)科大學(xué);2019年

2 彭琴;茵陳四苓顆粒聯(lián)合骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞移植通過HMGB1/TLR4信號通路對急性肝衰竭大鼠的影響[D];西南醫(yī)科大學(xué);2019年

3 何玉;UⅡ/UT系統(tǒng)對LPS/D-GalN誘導(dǎo)急性肝衰竭小鼠肝內(nèi)p120-catenin表達(dá)影響的研究[D];南京醫(yī)科大學(xué);2019年

4 王慧;HMGB1基因多態(tài)性與HBV相關(guān)急性肝衰竭的關(guān)聯(lián)分析[D];山西醫(yī)科大學(xué);2019年

5 張靜嬌;急性肝衰竭HMGB1基因單倍型構(gòu)建和標(biāo)簽SNPs篩選[D];山西醫(yī)科大學(xué);2019年

6 陸慧;腫瘤壞死因子α上調(diào)腦血管內(nèi)皮細(xì)胞RH蛋白C表達(dá)的機(jī)制[D];中國醫(yī)科大學(xué);2018年

7 張浪;(Ⅰ)Y藥的抗炎藥效與作用機(jī)制研究 (Ⅱ)蓮心總堿對LPS/GalN誘導(dǎo)急性肝衰竭小鼠的保護(hù)作用研究[D];中南民族大學(xué);2018年

8 焦方舟;組蛋白去乙酰化酶抑制劑ACY1215對小鼠急性肝衰竭腦水腫的保護(hù)作用[D];武漢大學(xué);2018年

9 張永婷;CM-Dil標(biāo)記人臍帶間充質(zhì)干細(xì)胞治療大鼠急性肝衰竭的實驗研究[D];南京醫(yī)科大學(xué);2018年

10 Dewi Andayani;不同病因的急性肝衰竭患者經(jīng)人工肝治療的預(yù)后[D];浙江大學(xué);2017年

本文編號：2863563