粘菌素耐藥基因mcr-1陽性豬源大腸桿菌耐藥特性分析
發(fā)布時間:2025-02-07 19:59
近年來,抗菌藥物常被作為食品動物的添加劑或臨床藥物治療使用,導(dǎo)致豬源大腸桿菌的耐藥性問題愈加嚴重,特別是多重耐藥菌株的出現(xiàn),使得多年來被棄用的具有腎毒性作用的粘菌素重新回歸臨床使用。但這一現(xiàn)狀并未維持很久,粘菌素這道防線于2015年被細菌成功攻破。本研究對2015-2016年從七。ò不、河南、湖南、湖北、江西、山西、陜西)采集的病料樣本進行大腸桿菌分離鑒定,采用微量肉湯稀釋法對分離菌株進行八大類13種抗菌藥物的敏感性試驗,并對其攜帶耐藥基因進行PCR檢測及測序分析;采用ERIC分型、多位點序列分型(MLST)和質(zhì)粒接合試驗方法,對mcr-1陽性菌株的克隆和水平傳播進行分析;對mcr-1陽性重點接合菌株進行質(zhì)粒全序列測序,分析mcr-1質(zhì)粒分子特性,對mcr-1的傳播控制提供依據(jù)。豬大腸桿菌中mcr-1的陽性檢出率為25.5%(78/306),其中從病豬體內(nèi)分離的102株大腸桿菌中檢測出46株陽性,占比45.1%,從健康豬體內(nèi)分離的204株大腸桿菌中檢測出32株陽性,占比15.7%(P=0.000)。同時,前者對粘菌素、頭孢噻呋、頭孢喹肟、慶大霉素、阿米卡星、多西環(huán)素、氟苯尼考、恩諾沙星...
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
摘要
1 文獻綜述
1.1 豬源大腸桿菌耐藥現(xiàn)狀與耐藥基因的流行傳播
1.1.1 豬源大腸桿菌耐藥現(xiàn)狀
1.1.2 豬源大腸桿菌耐藥基因的流行傳播
1.2 豬源大腸桿菌對粘菌素耐藥現(xiàn)狀
1.3 mcr-1的流行概況
1.3.1 動物或動物源食品中mcr-1的流行現(xiàn)狀
1.3.2 人源及環(huán)境中mcr-1的流行現(xiàn)狀
1.4 細菌對粘菌素耐藥機制
1.5 mcr-1的傳播機制
1.5.1 質(zhì)粒介導(dǎo)mcr-1傳播
1.5.2 插入序列ISApl1
1.6 本研究的目的與意義
試驗一河南等七省豬源大腸桿菌分離及mcr-1的檢測與流行分析
1 引言
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 菌株
2.1.2 試驗藥品及配制
2.1.3 培養(yǎng)基
2.1.4 試驗試劑
2.1.5 試驗儀器
2.2 方法
2.2.1 細菌分離與鑒定
2.2.2 藥敏試驗
2.2.3 DNA的提取
2.2.4 PCR擴增及測序
2.2.5 統(tǒng)計分析
3 結(jié)果與分析
3.1 大腸桿菌分離鑒定結(jié)果分析
3.2 藥敏試驗結(jié)果與分析
3.3 患病豬和健康豬源大腸桿菌耐藥表型對比分析
3.4 mcr-1的流行
3.5 攜帶和不攜帶mcr-1的大腸桿菌耐藥譜對比分析
4 討論
4.1 豬源大腸桿菌的分離特性
4.2 大腸桿菌多重耐藥分析
4.3 mcr-1基因流行情況及耐藥差異分析
5 結(jié)論
試驗二 豬源大腸桿菌耐藥基因的檢測與分析
1 引言
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 模板DNA的提取
2.1.2 試驗試劑
2.2 方法
2.2.1 DNA模板的提取
2.2.2 PCR擴增及測序
2.2.3 β-內(nèi)酰胺類耐藥基因引物及參考文獻
2.2.6 氨基糖苷類耐藥基因引物
2.2.4 四環(huán)素類、酰胺醇類和磺胺類耐藥基因引物及參考文獻
2.2.5 喹諾酮類、多藥外排泵類耐藥基因引物及參考文獻
3 結(jié)果與分析
3.1 ESBLs耐藥基因檢測結(jié)果與分析
3.2 氨基糖苷類耐藥基因檢測結(jié)果與分析
3.3 四環(huán)素類、酰胺醇類和磺胺類耐藥基因檢測結(jié)果與分析
3.4 喹諾酮類、多藥外排泵類耐藥基因檢測結(jié)果與分析
4 討論
5 結(jié)論
試驗三 mcr-1的快速散播機制
1 引言
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 菌株
2.1.2 試驗藥品及配制
2.1.3 培養(yǎng)基
2.1.4 試驗試劑
2.1.5 試驗儀器
2.2 方法
2.2.1 藥敏試驗
2.2.2 DNA的提取
2.2.3 mcr-1基因的檢測
2.2.4 ERIC-PCR分型
2.2.5 mcr-1陽性菌株MLST分型
2.2.6 mcr-1陽性菌接合試驗
2.2.7 攜帶mcr-1基因的質(zhì)粒測序
3 結(jié)果與分析
3.1 藥敏結(jié)果
3.2 mcr-1陽性株ERIC分型結(jié)果
3.3 mcr-1陽性菌株MLST分型結(jié)果
3.4 質(zhì)粒接合結(jié)果
3.5 質(zhì)粒測序結(jié)果
4 討論
5 結(jié)論
全文結(jié)論
參考文獻
英文摘要
附錄一 :縮略詞表
本文編號:4031223
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
摘要
1 文獻綜述
1.1 豬源大腸桿菌耐藥現(xiàn)狀與耐藥基因的流行傳播
1.1.1 豬源大腸桿菌耐藥現(xiàn)狀
1.1.2 豬源大腸桿菌耐藥基因的流行傳播
1.2 豬源大腸桿菌對粘菌素耐藥現(xiàn)狀
1.3 mcr-1的流行概況
1.3.1 動物或動物源食品中mcr-1的流行現(xiàn)狀
1.3.2 人源及環(huán)境中mcr-1的流行現(xiàn)狀
1.4 細菌對粘菌素耐藥機制
1.5 mcr-1的傳播機制
1.5.1 質(zhì)粒介導(dǎo)mcr-1傳播
1.5.2 插入序列ISApl1
1.6 本研究的目的與意義
試驗一河南等七省豬源大腸桿菌分離及mcr-1的檢測與流行分析
1 引言
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 菌株
2.1.2 試驗藥品及配制
2.1.3 培養(yǎng)基
2.1.4 試驗試劑
2.1.5 試驗儀器
2.2 方法
2.2.1 細菌分離與鑒定
2.2.2 藥敏試驗
2.2.3 DNA的提取
2.2.4 PCR擴增及測序
2.2.5 統(tǒng)計分析
3 結(jié)果與分析
3.1 大腸桿菌分離鑒定結(jié)果分析
3.2 藥敏試驗結(jié)果與分析
3.3 患病豬和健康豬源大腸桿菌耐藥表型對比分析
3.4 mcr-1的流行
3.5 攜帶和不攜帶mcr-1的大腸桿菌耐藥譜對比分析
4 討論
4.1 豬源大腸桿菌的分離特性
4.2 大腸桿菌多重耐藥分析
4.3 mcr-1基因流行情況及耐藥差異分析
5 結(jié)論
試驗二 豬源大腸桿菌耐藥基因的檢測與分析
1 引言
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 模板DNA的提取
2.1.2 試驗試劑
2.2 方法
2.2.1 DNA模板的提取
2.2.2 PCR擴增及測序
2.2.3 β-內(nèi)酰胺類耐藥基因引物及參考文獻
2.2.6 氨基糖苷類耐藥基因引物
2.2.4 四環(huán)素類、酰胺醇類和磺胺類耐藥基因引物及參考文獻
2.2.5 喹諾酮類、多藥外排泵類耐藥基因引物及參考文獻
3 結(jié)果與分析
3.1 ESBLs耐藥基因檢測結(jié)果與分析
3.2 氨基糖苷類耐藥基因檢測結(jié)果與分析
3.3 四環(huán)素類、酰胺醇類和磺胺類耐藥基因檢測結(jié)果與分析
3.4 喹諾酮類、多藥外排泵類耐藥基因檢測結(jié)果與分析
4 討論
5 結(jié)論
試驗三 mcr-1的快速散播機制
1 引言
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 菌株
2.1.2 試驗藥品及配制
2.1.3 培養(yǎng)基
2.1.4 試驗試劑
2.1.5 試驗儀器
2.2 方法
2.2.1 藥敏試驗
2.2.2 DNA的提取
2.2.3 mcr-1基因的檢測
2.2.4 ERIC-PCR分型
2.2.5 mcr-1陽性菌株MLST分型
2.2.6 mcr-1陽性菌接合試驗
2.2.7 攜帶mcr-1基因的質(zhì)粒測序
3 結(jié)果與分析
3.1 藥敏結(jié)果
3.2 mcr-1陽性株ERIC分型結(jié)果
3.3 mcr-1陽性菌株MLST分型結(jié)果
3.4 質(zhì)粒接合結(jié)果
3.5 質(zhì)粒測序結(jié)果
4 討論
5 結(jié)論
全文結(jié)論
參考文獻
英文摘要
附錄一 :縮略詞表
本文編號:4031223
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