陸川豬脂酰輔酶A氧化酶1基因克隆及序列分析
本文選題:陸川豬 切入點:ACOX基因 出處:《中國畜牧獸醫(yī)》2017年03期
【摘要】:本研究旨在對陸川豬脂酰輔酶A氧化酶1(acyl-coenzyme A oxidase 1,ACOX1)基因進(jìn)行克隆及生物信息學(xué)分析。根據(jù)GenBank中豬ACOX1基因序列設(shè)計特異性引物,利用RT-PCR技術(shù)對陸川豬ACOX1基因進(jìn)行克隆、測序和生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,陸川豬ACOX1基因CDS全長1 986bp,編碼661個氨基酸,陸川豬ACOX1基因與豬、牛、人、斑馬魚、雞、獼猴、大鼠、小鼠、爪蟾序列同源性分別為99.5%、85.5%、87.1%、66.3%、75.6%、84.0%、82.3%、81.1%和69.1%。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果表明,ACOX1基因在不同物種及進(jìn)化的過程中具有高度保守性,蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果表明,陸川豬ACOX1蛋白沒有信號肽,沒有形成跨膜結(jié)構(gòu)。本研究成功克隆了陸川豬ACOX1基因,為闡明其在陸川豬脂肪沉積及代謝方面的調(diào)控研究奠定了理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:The aim of this study was to clone and bioinformatics analysis of 1(acyl-coenzyme A oxidase 1 oxidase 1 ACOX1 gene of Luchuan porcine lipoacylcoenzyme oxidase.According to the sequence of porcine ACOX1 gene in GenBank, specific primers were designed, and the ACOX1 gene of Luchuan pig was cloned, sequenced and bioinformatics analyzed by RT-PCR technique.Phylogenetic tree analysis showed that the COX1 gene was highly conserved in different species and evolution. The prediction of protein secondary structure showed that the ACOX1 protein of Luchuan pig had no signal peptide and no transmembrane structure.In this study, the ACOX1 gene of Luchuan pig was cloned successfully, which laid a theoretical foundation for the regulation of fat deposition and metabolism in Luchuan pig.
【作者單位】: 廣西壯族自治區(qū)畜牧研究所廣西家畜遺傳改良重點實驗室;廣西大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(31360544) 廣西壯族自治區(qū)畜牧研究所基本科研業(yè)務(wù)費項目(桂牧研科2015-03) 廣西家畜遺傳改良重點實驗室自主研究課題(2015GXKLLGI-06)
【分類號】:S828
【參考文獻(xiàn)】
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【共引文獻(xiàn)】
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2 許鐘\,
本文編號:1721010
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