為了研究核受體輔激活蛋白1(NCOA1)對黔北麻羊繁殖性能的影響,試驗采用DNA測序技術,利用SeqMan軟件分析測序結果初步篩選SNP位點,根據(jù)篩選出的SNP位點應用RNA在線二級結構預測軟件中的RNA secondary structure prediction、ProtScale、DNAStar軟件中的EditSeq分析NCOA1基因突變位點的二級結構、理化性質(zhì)、親疏水性、結構域,運用SPSS 20.0軟件分析NCOA1基因型與產(chǎn)羔數(shù)的關聯(lián)性;再應用實時熒光定量PCR方法檢測NCOA1基因在黔北麻羊子宮、輸卵管、垂體、下丘腦、卵巢5個器官中mRNA的表達水平。結果表明:在外顯子7處發(fā)現(xiàn)2個SNP位點,命名為G144A和G155A,其中G144A屬于同義突變,編碼的氨基酸未發(fā)生改變,G155A屬于錯義突變,編碼的精氨酸突變?yōu)橘嚢彼?導致外顯子7所編碼的氨基酸自由能升高,穩(wěn)定性降低,分子質(zhì)量變大,等電點升高,疏水性增強,但未發(fā)現(xiàn)保守結構域和特殊結構域,即NCOA1基因外顯子7編碼的蛋白無特異結構和獨立功能;對G155A位點進行基因分型,發(fā)現(xiàn)GG基因型個體產(chǎn)羔數(shù)分別比GA、AA基因型個...

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【文章目錄】：
1 材料
    1.1 樣品
    1.2 主要試劑
    1.3 主要儀器
2 方法
    2.1 引物的設計與合成
    2.2 DNA池PCR擴增及SNP位點分析
    2.3 實時熒光定量PCR擴增
3 結果與分析
    3.1 NCOA1基因的多態(tài)性分析
        3.1.1 PCR擴增
        3.1.2 SNP位點的檢測
        3.1.3 突變位點二級結構分析
        3.1.4 理化性質(zhì)分析
        3.1.5 氨基酸親疏水性分析
        3.1.6 基因分型與產(chǎn)羔數(shù)關聯(lián)性分析
    3.2 實時熒光定量PCR擴增
        3.2.1 擴增曲線和熔解曲線
        3.2.2 NCOA1基因mRNA在黔北麻羊不同器官中的表達分析
4 討論
    4.1 NCOA1基因SNP位點分析
    4.2 NCOA1基因mRNA在黔北麻羊不同器官中的表達規(guī)律
5 結論



本文編號：4010375