為了研究核受體輔激活蛋白1(NCOA1)對(duì)黔北麻羊繁殖性能的影響,試驗(yàn)采用DNA測序技術(shù),利用SeqMan軟件分析測序結(jié)果初步篩選SNP位點(diǎn),根據(jù)篩選出的SNP位點(diǎn)應(yīng)用RNA在線二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測軟件中的RNA secondary structure prediction、ProtScale、DNAStar軟件中的EditSeq分析NCOA1基因突變位點(diǎn)的二級(jí)結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)、親疏水性、結(jié)構(gòu)域,運(yùn)用SPSS 20.0軟件分析NCOA1基因型與產(chǎn)羔數(shù)的關(guān)聯(lián)性;再應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法檢測NCOA1基因在黔北麻羊子宮、輸卵管、垂體、下丘腦、卵巢5個(gè)器官中mRNA的表達(dá)水平。結(jié)果表明:在外顯子7處發(fā)現(xiàn)2個(gè)SNP位點(diǎn),命名為G144A和G155A,其中G144A屬于同義突變,編碼的氨基酸未發(fā)生改變,G155A屬于錯(cuò)義突變,編碼的精氨酸突變?yōu)橘嚢彼?導(dǎo)致外顯子7所編碼的氨基酸自由能升高,穩(wěn)定性降低,分子質(zhì)量變大,等電點(diǎn)升高,疏水性增強(qiáng),但未發(fā)現(xiàn)保守結(jié)構(gòu)域和特殊結(jié)構(gòu)域,即NCOA1基因外顯子7編碼的蛋白無特異結(jié)構(gòu)和獨(dú)立功能;對(duì)G155A位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,發(fā)現(xiàn)GG基因型個(gè)體產(chǎn)羔數(shù)分別比GA、AA基因型個(gè)...

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【文章目錄】：
1 材料
    1.1 樣品
    1.2 主要試劑
    1.3 主要儀器
2 方法
    2.1 引物的設(shè)計(jì)與合成
    2.2 DNA池PCR擴(kuò)增及SNP位點(diǎn)分析
    2.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增
3 結(jié)果與分析
    3.1 NCOA1基因的多態(tài)性分析
        3.1.1 PCR擴(kuò)增
        3.1.2 SNP位點(diǎn)的檢測
        3.1.3 突變位點(diǎn)二級(jí)結(jié)構(gòu)分析
        3.1.4 理化性質(zhì)分析
        3.1.5 氨基酸親疏水性分析
        3.1.6 基因分型與產(chǎn)羔數(shù)關(guān)聯(lián)性分析
    3.2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增
        3.2.1 擴(kuò)增曲線和熔解曲線
        3.2.2 NCOA1基因mRNA在黔北麻羊不同器官中的表達(dá)分析
4 討論
    4.1 NCOA1基因SNP位點(diǎn)分析
    4.2 NCOA1基因mRNA在黔北麻羊不同器官中的表達(dá)規(guī)律
5 結(jié)論



本文編號(hào)：4010375