本文關(guān)鍵詞：云南玉溪漢、彝和哈尼族HIV感染相關(guān)基因多態(tài)性及流行情況研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：研究背景及目的通過分析云南省玉溪市漢族、彝族、哈尼族人群HIV感染相關(guān)基因的突變頻率和多態(tài)性特點,并與已有的國內(nèi)外研究結(jié)果比較,探討玉溪市漢族、彝族、哈尼族CCR2b-64I、SDF1-3'A、CX3CR1-V249I和CX3CR1-T280M四個基因位點分布情況與其他種族人群是否具有差異性,為評估玉溪市漢族、彝族、哈尼族人群對HIV的遺傳易感性及艾滋病的防治提供理論依據(jù)。方法1、 對云南省玉溪市1995年以來所有在冊HIV感染者的構(gòu)成情況進(jìn)行分析。分析內(nèi)容包括性別構(gòu)成、職業(yè)構(gòu)成、婚姻狀況、感染途徑、民族構(gòu)成五個方面,并通過表與圖的形式分析以上五個要素的變化趨勢,了解玉溪市HIV感染流行情況。2、對漢族、彝族、哈尼族CCR2b-64I、SDF1-3、CX3CR1-V249I和CX3CR1-T280M四個基因位點SNP進(jìn)行檢測分析。根據(jù)玉溪市人口民族構(gòu)成情況及HIV感染者中的民族構(gòu)成情況,選取排名均靠前的漢族、彝族、哈尼族各100-200例,民族對象應(yīng)保證三代的純正民族血統(tǒng),之間無親緣關(guān)系。提取基因組DNA,利用飛行時間質(zhì)譜生物芯片系統(tǒng)(MassArray)對 CCR2b-64I、SDF1-3'A、CX3CR1-V249I和CX3CR1-T280M四個基因位點SNP進(jìn)行檢測分析,以Hardy-Weinberg平衡檢測所選樣本的群體代表性。3、對云南省玉溪市漢族、彝族、哈尼族人群HIV感染相關(guān)基因的突變頻率和多態(tài)性特點與已有的國內(nèi)外研究結(jié)果比較分析。通過以上研究了解玉溪市漢族、彝族、哈尼族人群HIV感染相關(guān)基因的突變頻率和多態(tài)性特點,并與已有的國內(nèi)外研究結(jié)果比較,分析玉溪市漢族、彝族、哈尼族以上四個基因位點分布情況與其他種族人群是否具有差異性。結(jié)果1玉溪市1995-2011年HIV感染情況分析1.1感染人員性別構(gòu)成及變化趨勢：以男性居多,但女性人群也不容忽視,頭幾年出現(xiàn)女性比例逐漸增加的趨勢,2007年后趨于平穩(wěn),其所占比例基本穩(wěn)定在40%左右。1.2感染人員職業(yè)構(gòu)成及變化趨勢：職業(yè)構(gòu)成從初期的以工人、農(nóng)民、長途車駕駛員、商業(yè)服務(wù)人員為主,慢慢擴(kuò)展到普通人群,從2005年后人群職業(yè)范圍已非常廣泛,甚至包括了兒童、學(xué)生、教師、退休人員等低危人群,呈現(xiàn)出低齡化的特征,同時也提示出現(xiàn)家庭內(nèi)部感染跡象。1.3感染人員婚姻狀況構(gòu)成及變化趨勢：感染人群中已婚人員所占比例總體上存在逐年上升的趨勢,2007年后逐漸趨于穩(wěn)定,2005年后已婚感染者均超過半數(shù)。1.4感染人員感染途徑構(gòu)成及變化趨勢：從圖表中可見,感染途徑從早年的毒品注射逐漸向性接觸方式轉(zhuǎn)變,2006年以后性接觸成為最主要的感染途徑,以異性間性接觸為主,而同性間性接觸從2006年開始呈現(xiàn)明顯的增加趨勢。1.5感染人員民族構(gòu)成及變化趨勢：2004年后漢族人群所占比例直線下降,而少數(shù)民族所占比例逐年增加,到2011年少數(shù)民族所占比例已接近一半,感染者的民族數(shù)已從最初的單一漢族擴(kuò)展到16個民族,其中以彝族、哈尼族、傣族、回族為主,2008年開始少數(shù)民族感染比例(33.9%)已超過其人口構(gòu)成比(31.69%),在四個主要少數(shù)民族中除彝族外,哈尼族、傣族、回族的感染比例均明顯高于其人口構(gòu)成比。2四個基因位點SNP結(jié)果2.1群體代表性檢驗所有研究對象四個位點基因型分布經(jīng)X2檢驗,符合Hardy-Weinbery平衡(p0.05),表明研究對象來自同一群體,具有較好的代表性。2.2不同人群中四個基因位點基因型頻率及等位基因頻率漢族人群共收集樣本205例,SDF1-3'A、CCR2-64I、CX3CR1-V249I、 CX3CR1-T280M四個位點成功分型樣本數(shù)分別為168例、169例、169例及169例；彝族人群共收集樣本100例,以上四個位點成功分型樣本數(shù)分別為96例、97例、96例及96例；哈尼族人群共收集樣本105例,四個位點成功分型樣本數(shù)分別為75例、78例、77例及77例。在SDF1-3'A基因位點,漢族和彝族基因型頻率存在顯著性差異(p=0.0240.05),等位基因頻率間也存在顯著性差異(p=0.0080.01)：在CCR2-64I基因位點上,漢族和哈尼族基因頻率間存在顯著性差異(p=0.008 0.01); CX3CR1-V249I和CX3CR1-T280M兩個基因位點上三個民族人群基因型頻率和等位基因頻率均無顯著性差異。2.3 CX3CR1基因249I和280M之間的連鎖關(guān)系對三個民族共342例測定了CX3CR1基因SNP, CX3CR1基因249I和280M等位基因之間的連鎖不平衡系數(shù)為0.962,兩者間存在明顯的連鎖關(guān)系。2.4各基因位點與國內(nèi)已有研究結(jié)果間的比較2.4.1 SDF1-3'A基因位點分型結(jié)果與國內(nèi)外已有研究間比較以A等位基因頻率來表示突變頻率,與國內(nèi)外各研究結(jié)果進(jìn)行比較。本次研究的漢族人群突變率與國內(nèi)其他研究的漢族人群結(jié)果間不存在顯著性差異；與其他少數(shù)民族相比,明顯高于鄂倫春族(p=0.024)、鄂溫克族(p=0.024)、獨龍族(p=0.018),差異存在顯著性：明顯低于廣西的仫佬族(p=0.025),差異存在顯著性；與國外研究結(jié)果相比,明顯高于美國黑人(p=0.000),差異存在顯著性,而與亞洲黃種人、高加索人、西班牙人比較接近。國內(nèi)目前沒有該基因位點彝族的相關(guān)研究,本次研究的彝族人群突變頻率與漢族人群比較,除了高于華北漢族(p=0.028)外,其余均無顯著性差異；與少數(shù)民族比較,明顯高于鄂倫春族(p=0.001)、鄂溫克族(p=0.001)、獨龍族(p=0.001)、佤族(滄源縣)(p=0.004)、傈僳族(福貢縣)(p=0.004)、怒族(福貢縣)(p=0.008)、怒族(貢山縣)(p=0.002)、景頗族(德宏)(p=0.007)、畬族(pF=0.008),差異存在顯著性；與國外研究結(jié)果相比,明顯高于美國黑人(p=0.000)、高加索人(p=0.003)和西班牙人(p=0.002),差異存在顯著性,與亞洲黃種人比較接近。本次研究的哈尼族人群突變頻率與漢族人群比較均不存在顯著性差異；與少數(shù)民族比較,明顯高于鄂倫春族(p=0.018)、鄂溫克族(p=0.018)、獨龍族(p=0.013)、怒族(貢山縣)(p=0.037),差異存在顯著性；與國內(nèi)其他相同民族研究結(jié)果存在一定差異,但差異無顯著性：與國外研究結(jié)果相比,明顯高于美國黑人(p=0.000),差異存在顯著性,而與亞洲黃種人、高加索人、西班牙人比較接近。本次研究的三個民族間,以彝族的突變頻率最高,明顯高于其他兩個民族,尤其與漢族間的差異最大,但差異未達(dá)到顯著性(p=0.057)。2.4.2 CCR2-64I基因位點分型結(jié)果與國內(nèi)外已有研究間比較以A等位基因頻率來表示突變頻率,與國內(nèi)外各研究結(jié)果進(jìn)行比較。本次研究的漢族人群突變率與國內(nèi)其他研究的漢族人群結(jié)果間不存在顯著性差異；與其他少數(shù)民族相比,明顯高于塔吉克族(p=0.042)、怒族(貢山縣)(p=0.020)、普米族(p=0.015)、彝族(四川涼山)(p=0.014)、布依族(p=0.044)、黎族(p=0.000)、仫佬族(廣西)(p=0.001),差異存在顯著性；與國外研究結(jié)果相比,明顯高于美國黑人(p=0.003)和高加索人(p=0.000),差異存在顯著性。本次研究的彝族人群突變頻率明顯高于國內(nèi)四川涼山的彝族人群(p=0.001),差異存在顯著性；與其他民族相比,明顯高于土族(p=0.014)、塔吉克族(p=0.008)、漢族1(甘肅)(p=0.046)、漢族2(北京)(p=0.006)、維吾爾族(喀什)(p=0.019)、獨龍族(p=0.042)、佤族(滄源縣)(p=0.044)、怒族(貢山縣)(p=0.003)、白族(p=0.010)、傣族1(p=0.011)、普米族(p=0.002)、景頗族(德宏)(p=0.014)、布依族(p=0.006)、黎族(p=0.000)、仫佬族(廣西)(p=0.000)、壯族1(廣西)(p=0.000)差異存在顯著性；與國外研究結(jié)果相比,明顯高于美國黑人(p=0.000)和高加索人(p=0.000),差異存在顯著性。本次研究的哈尼族人群突變頻率與國內(nèi)其他研究的愛伲支系哈尼族人群結(jié)果無顯著性差異；與其他民族相比,明顯高于土族(p=0.007)、塔吉克族(p=0.004)、漢族1(甘肅)(p=0.023)、漢族2(北京)(p=0.001)、維吾爾族(喀什)(p=0.005)、獨龍族(p=0.019)、佤族(滄源縣)(p=0.020)、佤族(西盟縣)(p=0.028)、怒族(福貢縣)(p=0.046)、怒族(貢山縣)(p=0.001)、白族(p=0.004)、傣族1(p=0.004)、普米族(p=0.001)、景頗族(德宏)(p=0.005)、彝族(四川涼山)(p=0.000)、布依族(p=0.002)、黎族(p=0.000)、仫佬族(廣西)(p=0.000)、壯族1(廣西)(p=0.000)差異存在顯著性；與國外研究結(jié)果相比,明顯高于美國黑人(p=0.000)和高加索人(p=0.000),差異存在顯著性,也明顯高于西班牙人,但因缺乏樣本例數(shù),未進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)處理,故無具體數(shù)據(jù)。本次研究的三個民族間,以哈尼族的突變頻率最高,明顯高于其他兩個民族,尤其與漢族間的差異最大,但差異未達(dá)到顯著性(p=0.103)。2.4.3 CX3CR1等位基因位點分型結(jié)果與國內(nèi)外已有研究間比較以A和T等位基因頻率來表示CX3CR1 V249I和T280M的突變頻率,與國內(nèi)外各研究結(jié)果進(jìn)行比較。CX3CR1等位基因頻率在中國人群中普遍較低,黎族和壯族甚至為零,其余多在0.1以下。本次研究的漢族人群與國內(nèi)其他研究的漢族人群結(jié)果間均無顯著性差異;而與國內(nèi)外其他種族人群相比,除在V249I位點上明顯低于傈僳族(六庫縣)(p=0.001)、塔吉克族(p=0.009)、維吾爾族(新疆)(p=0.009)、法國人(p=0.000)、意大利人(p=0.000)、高加索人(p=0.000),差異存在顯著性外,與其他種族人群間不存在顯著性差異：在T280M位點上同樣明顯低于傈僳族(六庫縣)(p=0.001)、塔吉克族(p=0.005)、維吾爾族(新疆)(p=0.005)、法國人(p=0.000)、意大利人(p=0.000)、高加索人(p=0.000),差異存在顯著性,而與其他種族人群間也不存在顯著性差異。本次研究的彝族人群與國內(nèi)其他研究的彝族人群結(jié)果間均無顯著性差異；而與國內(nèi)外其他種族人群相比,在V249I位點上除明顯低于傈僳族(六庫縣)(p=0.005)、塔吉克族(p=0.021)、維吾爾族(新疆)(p=0.026)、法國人(p=0.000)、意大利人(p=0.000)、高加索人(p=0.000),差異存在顯著性外,與其他種族人群間不存在顯著性差異；在T280M位點上明顯低于傈僳族(六庫縣)(p=0.024)、法國人(p=0.049)、意大利人(p=0.034)、高加索人(p=0.038),差異存在顯著性,而與其他種族人群間不存在顯著性差異。本次研究的哈尼族人群與國內(nèi)其他研究的哈尼族人群結(jié)果間均無顯著性差異；而與國內(nèi)外其他種族人群相比,在V2491位點上除明顯低于傈僳族(六庫縣)(p=0.004)、塔吉克族(p=0.013)、維吾爾族(新疆)(p=0.016)、法國人(p=0.000)、意大利人(p=0.000)、高加索人(p=0.000),差異存在顯著性外,與其他種族人群間不存在顯著性差異；在T280M位點上同樣明顯低于傈僳族(六庫縣)(p=0.001)、塔吉克族(p=0.004)、維吾爾族(新疆)(p=0.011)、法國人(p=0.003)、意大利人(p=0.002)、高加索人(p=0.003),差異存在顯著性,而與其他種族人群間也不存在顯著性差異。本次研究的三個民族間,突變頻率差異不大,均處于較低水平。結(jié)論本次研究對云南省玉溪市漢族、彝族、哈尼族人群CCR2b-64I、SDF1-3/A、 CX3CR1-V249I和CX3CR1-T280M四個基因位點SNP進(jìn)行了較為詳細(xì)的研究,結(jié)合云南省玉溪市HIV感染流行情況分析及已有國內(nèi)外不同種族人群關(guān)于CCR2b-64I、SDF1-3'A、CX3CR1-V249I和CX3CR1-T280M四個基因位點SNP的匯總分析,可得出以下結(jié)論：1.玉溪市HIV感染流行呈現(xiàn)出如下特點：(1)總體上感染者以男性為主,但主要的感染途徑是異性間性接觸,故對女性感染者的管理是關(guān)鍵,特別是針對從事性服務(wù)的女性人群,應(yīng)加大HIV的宣傳及干預(yù)；(2)感染者中已婚人群所占比例日趨增加,家庭內(nèi)部感染問題日益突出;(3)HIV已開始向?qū)W生、教師、退休人員等低危人群擴(kuò)散；(4)目前的感染人群主要還是以受教育程度低的農(nóng)村人口為主,少數(shù)民族已成為一個重要的感染人群,增長勢頭迅猛。2.本次研究的三個民族在結(jié)果上與國內(nèi)其他民族存在共性的方面,但也有各自顯著的特點,即CX3CR1等位基因頻率均很低,2491和280M之間存在明顯的連鎖關(guān)系,是主要的致病因子；CCR2b-64I和SDF1-3'A等位基因頻率均較高,特別是彝族,兩個位點的等位基因頻率均較高,是主要的保護(hù)因子；三個民族間各具特點,存在明顯差異；本次研究的彝族人群CCR2-64I突變頻率明顯高于國內(nèi)四川涼山的彝族人群,體現(xiàn)出環(huán)境因素的巨大影響。3. CCR2b-64I、SDF1-3'A和CX3CR1是目前研究的熱門和成熟的等位基因位點,目前國內(nèi)缺乏該三個民族針對以上三個基因位點的完整研究結(jié)果,本次研究結(jié)果填補(bǔ)了國內(nèi)空白,豐富和完善我國少數(shù)民族艾滋病易感性及抗性的遺傳背景資料。
【關(guān)鍵詞】：漢族 彝族 哈尼族 HIV感染 基因多態(tài)性 流行情況
【學(xué)位授予單位】：南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R512.91
【目錄】：

• 摘要3-10
• ABSTRACT10-21
• 前言21-23
• 研究內(nèi)容、方法23-30
• 1 研究對象23-24
• 2 材料與方法24-30
• 統(tǒng)計學(xué)處理30-31
• 結(jié)果31-52
• 1 玉溪市1995-2011年HIV感染情況分析31-39
• 2 四個基因位點SNP結(jié)果39-52
• 討論52-60
• 結(jié)論60-61
• 參考文獻(xiàn)61-65
• 英文縮寫詞65-66
• 碩士期間科研成果66-67
• 致謝67-68

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本文編號：420381