臨沂市2017-2019年未抗病毒治療男男性行為者HIV/AIDS病人的HIV-1亞型及耐藥分析
發(fā)布時間:2024-11-30 23:52
目的了解臨沂市未經(jīng)抗病毒治療(ART)男男性行為者(MSM)艾滋病病毒(HIV)感染者中HIV-1基因亞型及耐藥突變現(xiàn)狀,為該人群的艾滋病防控和ART提供參考依據(jù)。方法收集臨沂市2017年1月至2019年6月未經(jīng)ART的MSM HIV感染者血清260份,提取HIV核糖核酸(RNA),利用反轉(zhuǎn)錄及巢式熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增pol區(qū)片段,測序成功后進(jìn)行基因亞型和耐藥突變分析。結(jié)果 260份樣本中有210例樣本成功獲得序列;蚍中秃蟀l(fā)現(xiàn)9種基因型,CRF01AE為主要亞型,其次是CRF07BC和CRF5501B。重組型CRF08BC、CRF6801B和CRF6701B首次出現(xiàn)。此外還發(fā)現(xiàn)3種獨特重組型URF(CRF01AE/)、URF(CRF01AE/B/C)和URF(C/D)。共有8例樣本攜帶耐藥突變位點,耐藥突變率為3.8%(8/210),為低流行水平。其中1例為蛋白酶抑制劑(PI)和非核苷類反轉(zhuǎn)錄酶...
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本文編號:4013211
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圖1 210例MSM樣本序列系統(tǒng)進(jìn)化樹
210份樣本經(jīng)分析發(fā)現(xiàn)共有9種基因亞型,包括5例B亞型,1例C亞型,6種CRFs和4例URFs。6種CRFs分別為CRF01_AE123例(58.6%),CRF07_BC51例(24.3%),CRF55_01B17例(8.1%),CRF08_BC4例(1.9%),CRF6....
圖2 4例URFs重組亞型結(jié)構(gòu)示意圖
圖1210例MSM樣本序列系統(tǒng)進(jìn)化樹2.3耐藥分析
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