志賀菌中整合子及ISCR1攜帶情況及其與耐藥性的關(guān)系
發(fā)布時(shí)間:2017-05-27 15:03
本文關(guān)鍵詞:志賀菌中整合子及ISCR1攜帶情況及其與耐藥性的關(guān)系,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:細(xì)菌性痢疾(簡(jiǎn)稱菌痢)以志賀菌為病原體,從發(fā)現(xiàn)至今已有百余年的歷史,是常見急性腸道傳染病,也是我國(guó)最常見的感染性腹瀉之一,居于法定傳染病發(fā)病率的第3位。每年的發(fā)病患者數(shù)接近50萬,發(fā)病率居37種監(jiān)測(cè)感染性疾病的前幾位,對(duì)公眾健康造成嚴(yán)重威脅[1]。近年來我國(guó)經(jīng)濟(jì)迅猛發(fā)展,人民生活水平日益提高,菌痢的發(fā)病率呈現(xiàn)逐年下降趨勢(shì),但由于志賀菌型繁多易變遷,且菌型之間無交叉免疫,及耐藥菌株的不斷產(chǎn)生,使得細(xì)菌性痢疾的發(fā)生和流行仍較嚴(yán)重。抗生素的應(yīng)用為臨床中治療細(xì)菌性痢疾帶來類福音,但是隨著長(zhǎng)時(shí)間大量的使用,甚至濫用,志賀菌耐藥率逐年上升,并呈現(xiàn)多重耐藥趨勢(shì)。對(duì)其耐藥機(jī)制的研究發(fā)現(xiàn),整合子及插入序列共同區(qū)(ISCR)作為一種可移動(dòng)元件,與志賀菌屬耐藥率上升及多重耐藥趨勢(shì)的出現(xiàn)密切相關(guān)[2]。整合子基本結(jié)構(gòu)主要由5'保守區(qū)(5'conserved segment,5'CS)、3'保守區(qū)(3'conserved segment,3'CS)和兩者之間的可變區(qū)(variable region)組成。整合子5'CS包括int I、att I和Pant,分別編碼整合酶、整合子重組位點(diǎn)和整合子可變區(qū)啟動(dòng)子;可變區(qū)包括不同數(shù)量和類型的基因盒,其中大部分是耐藥基因盒,被稱之為多種耐藥基因的儲(chǔ)存庫(kù),目前已發(fā)現(xiàn)有70余種[3];3’CS區(qū)則因整合子類型不同而異。目前已被分為10類,相關(guān)研究表明,1類、2類整合子與志賀菌的多重耐藥現(xiàn)象密切相關(guān)[4]。ISCR作為一類新型的可移動(dòng)遺傳元件,不需要特異識(shí)別即可移動(dòng)任何鄰近的細(xì)菌DNA序列,它是通過和整合子序列的相互作用把基因加到系統(tǒng)中,從而使得整個(gè)耐藥基因組件能從一個(gè)細(xì)菌的細(xì)胞轉(zhuǎn)移到另一個(gè)細(xì)菌細(xì)胞當(dāng)中[5]。根據(jù)其氨基酸序列以及同源性的不同,目前,ISCR家族已發(fā)現(xiàn)有24個(gè)成員。研究發(fā)現(xiàn),腸桿菌科細(xì)菌中以ISCR1常見,并且ISCR1的下游與許多耐藥基因相連,如氨基糖苷類耐藥基因(arm A,rmt B)、喹諾酮類耐藥基因qnr、β-內(nèi)酰胺類耐藥基因和氯霉素類耐藥基因(cat AⅡ)等;其對(duì)目前已有的抗感染方案,尤其是對(duì)抗革蘭陰性菌感染的方案造成嚴(yán)重威脅。研究目的:為了解天津地區(qū)志賀菌臨床株1類、2類整合子及ISCR1攜帶情況并分析其與耐藥性的關(guān)系。材料與方法:收集2009-2013年分離自天津醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院、天津市兒童醫(yī)院和天津醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院3所三級(jí)甲等醫(yī)院腸道門診就診患者的糞便標(biāo)本中志賀菌,共計(jì)159株,采用生化及血清凝集法鑒定其血清學(xué)分群,采用K-B紙片擴(kuò)散法對(duì)14種臨床常用抗生素進(jìn)行藥敏試驗(yàn),分析并比較志賀菌不同血清型對(duì)不同抗菌藥物的耐藥率。通過PCR基因擴(kuò)增技術(shù)對(duì)1、2類整合子及ISCR1在志賀菌中的分布情況、攜帶的耐藥基因盒的種類及與耐藥的相關(guān)性進(jìn)行研究,分析并比較不同血清群整合酶的攜帶情況及其與耐藥性的關(guān)系。實(shí)驗(yàn)結(jié)果:159株志賀菌中,宋內(nèi)志賀菌106株,占66.67%,福氏志賀菌53株,占33.33%。159株志賀菌的多重耐藥率為90.57%,其中,福氏志賀菌對(duì)四環(huán)素的耐藥率最高88.68%,其次是鏈霉素81.13%、氯霉素及SMZco均為56.60%;多重耐藥率75.47%。宋內(nèi)志賀菌對(duì)氨芐西林的耐藥率最高97.17%,其次是SMZco95.28%、四環(huán)素83.96%和慶大霉素76.42%;多重耐藥率98.11%。未發(fā)現(xiàn)對(duì)亞胺培南耐藥的菌株。1類整合子陽(yáng)性118株,其中典型1類整合子23株,共有5種基因盒,分別為aad A2、aad A1、dfrⅠ、blaoxa-10及blaoxa-1;非典型1類整合子95株,基因包括int I1、aad A、blaoxa-1和IS1等;2類整合子陽(yáng)性89株,其基因盒有dfr A1、satl及aad A1;1類、2類整合子同時(shí)陽(yáng)性的菌株70株。未發(fā)現(xiàn)ISCR1陽(yáng)性菌株。整合子陽(yáng)性菌株中多重耐藥率高于整合子陰性菌株(91.97%vs 81.81%)。實(shí)驗(yàn)結(jié)論:近幾年來本市三所醫(yī)院收集的志賀菌以宋內(nèi)志賀菌和福氏志賀菌為主,且宋內(nèi)志賀菌為主要流行菌株;多重耐藥率達(dá)90.57%;其中,福氏志賀菌多重耐藥率75.47%,宋內(nèi)志賀菌多重耐藥率98.11%。1、2類整合子在志賀菌中廣泛存在且與其的多重耐藥現(xiàn)象相關(guān)。本研究中未發(fā)現(xiàn)ISCR1陽(yáng)性的志賀菌菌株。
【關(guān)鍵詞】:志賀菌屬 整合子 插入序列共同區(qū) 多重耐藥 移動(dòng)元件
【學(xué)位授予單位】:天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R446.5;R516.4
【目錄】:
- 中文摘要4-6
- Abstract6-9
- 縮略語(yǔ)/符號(hào)說明9-10
- 前言10-14
- 研究現(xiàn)狀、成果10-13
- 研究目的、方法13-14
- 一、志賀菌血清學(xué)鑒定及藥敏特征14-25
- 1.1 對(duì)象和方法14-17
- 1.1.1 材料14-15
- 1.1.2 試驗(yàn)與方法15-17
- 1.2 結(jié)果17-21
- 1.2.1 志賀菌血清學(xué)鑒定17
- 1.2.2 藥敏結(jié)果17-21
- 1.3 討論21-24
- 1.4 小結(jié)24-25
- 二、志賀菌整合子、ISCR1攜帶情況及其與耐藥性的關(guān)系25-41
- 2.1 材料與方法25-29
- 2.1.1 材料25-26
- 2.1.2 方法26-29
- 2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果29-37
- 2.2.1 整合子檢測(cè)結(jié)果29-32
- 2.2.2 整合子與志賀菌耐藥和多耐藥的相關(guān)性分析32-37
- 2.2.3 插入序列共同區(qū)分布情況37
- 2.3 討論37-40
- 2.4 小結(jié)40-41
- 結(jié)論41-42
- 參考文獻(xiàn)42-48
- 發(fā)表論文和參加科研情況說明48-49
- 綜述 志賀菌耐藥性與整合子及ISCR1關(guān)系的簡(jiǎn)述49-56
- 綜述參考文獻(xiàn)52-56
- 致謝56
【參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條
1 趙嘉詠;羅琦;李孟磊;黃麗莉;夏勝利;;河南省細(xì)菌性痢疾病原學(xué)特征研究[J];疾病監(jiān)測(cè);2010年12期
2 王俊;祁偉;吳瑾;王淑香;郭文學(xué);馬艷紅;;天津地區(qū)志賀菌耐藥性及整合子攜帶調(diào)查[J];天津醫(yī)藥;2011年05期
3 徐彩萍;張穎華;陳秀華;劉蕓;丁克穎;;129株志賀菌血清分型及耐藥性分析[J];職業(yè)與健康;2013年06期
本文關(guān)鍵詞:志賀菌中整合子及ISCR1攜帶情況及其與耐藥性的關(guān)系,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
,本文編號(hào):400301
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