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大湄公河次流域間日瘧原蟲裂殖子表面蛋白MSP1 42 和MSP7基因的遺傳多樣性

發(fā)布時間:2021-06-10 15:06
  目的:明確大湄公河次流域間日瘧原蟲紅內(nèi)期候選抗原Pvmsp142和Pvmsp7基因的遺傳多樣性,充分了解潛在疫苗基因特點,為研發(fā)有效瘧疾疫苗提供信息。方法:在征求病人同意后采取間日瘧原蟲鏡檢陽性患者指尖血制成濾紙血片晾干保存。樣本按照干血斑試劑說明書提取gDNA,以提取的gDNA為模板經(jīng)巢式PCR鑒定間日瘧原蟲陽性樣本,擴(kuò)增Msp3α片段并進(jìn)行酶切鑒定,確保寄生蟲蟲株是單克隆。共得到143例樣本,其中包括中國安徽45例,中緬邊境50例以及泰國樣本48例。采用巢式PCR擴(kuò)增Pvmsp142和八個Pvmsp7基因并測序。采用MEGA7.0,DnaSP6.10.1對本研究中測序基因序列以及從GenBank中下載的其他流行區(qū)的相應(yīng)基因序列進(jìn)行多態(tài)性分析,中性檢驗以及FST檢驗;Network5.0和PHYLOVIZ 2.0軟件用于單倍體型分析。MEGA7.0和在線軟件iTOL用于進(jìn)化樹分析,STRUCTURE v2.3.4軟件用于群體遺傳結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果:1、Pvmsp142:中緬邊境、泰國和柬埔寨三個瘧疾流... 

【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省

【文章頁數(shù)】:62 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

大湄公河次流域間日瘧原蟲裂殖子表面蛋白MSP1 42 和MSP7基因的遺傳多樣性


Pvmsp7基因在三個地區(qū)樣本的采集和擴(kuò)增并測序成功的數(shù)量

大湄公河次流域間日瘧原蟲裂殖子表面蛋白MSP1 42 和MSP7基因的遺傳多樣性


不同瘧疾流行區(qū)Pvmsp142基因多態(tài)性滑動窗口圖

大湄公河次流域間日瘧原蟲裂殖子表面蛋白MSP1 42 和MSP7基因的遺傳多樣性


中緬邊境、泰國和柬埔寨分離株P(guān)vmsp142基因序列中性檢驗A:Pvmsp1基因序列Tajima’sD檢驗的滑動窗口分析圖;B:Pvmsp1基因序列Fu&Li’sD*


本文編號:3222602

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