大湄公河次流域間日瘧原蟲(chóng)裂殖子表面蛋白MSP1 42 和MSP7基因的遺傳多樣性
發(fā)布時(shí)間:2021-06-10 15:06
目的:明確大湄公河次流域間日瘧原蟲(chóng)紅內(nèi)期候選抗原Pvmsp142和Pvmsp7基因的遺傳多樣性,充分了解潛在疫苗基因特點(diǎn),為研發(fā)有效瘧疾疫苗提供信息。方法:在征求病人同意后采取間日瘧原蟲(chóng)鏡檢陽(yáng)性患者指尖血制成濾紙血片晾干保存。樣本按照干血斑試劑說(shuō)明書(shū)提取gDNA,以提取的gDNA為模板經(jīng)巢式PCR鑒定間日瘧原蟲(chóng)陽(yáng)性樣本,擴(kuò)增Msp3α片段并進(jìn)行酶切鑒定,確保寄生蟲(chóng)蟲(chóng)株是單克隆。共得到143例樣本,其中包括中國(guó)安徽45例,中緬邊境50例以及泰國(guó)樣本48例。采用巢式PCR擴(kuò)增Pvmsp142和八個(gè)Pvmsp7基因并測(cè)序。采用MEGA7.0,DnaSP6.10.1對(duì)本研究中測(cè)序基因序列以及從GenBank中下載的其他流行區(qū)的相應(yīng)基因序列進(jìn)行多態(tài)性分析,中性檢驗(yàn)以及FST檢驗(yàn);Network5.0和PHYLOVIZ 2.0軟件用于單倍體型分析。MEGA7.0和在線(xiàn)軟件iTOL用于進(jìn)化樹(shù)分析,STRUCTURE v2.3.4軟件用于群體遺傳結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果:1、Pvmsp142:中緬邊境、泰國(guó)和柬埔寨三個(gè)瘧疾流...
【文章來(lái)源】:中國(guó)醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Pvmsp7基因在三個(gè)地區(qū)樣本的采集和擴(kuò)增并測(cè)序成功的數(shù)量
不同瘧疾流行區(qū)Pvmsp142基因多態(tài)性滑動(dòng)窗口圖
中緬邊境、泰國(guó)和柬埔寨分離株P(guān)vmsp142基因序列中性檢驗(yàn)A:Pvmsp1基因序列Tajima’sD檢驗(yàn)的滑動(dòng)窗口分析圖;B:Pvmsp1基因序列Fu&Li’sD*
本文編號(hào):3222602
【文章來(lái)源】:中國(guó)醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Pvmsp7基因在三個(gè)地區(qū)樣本的采集和擴(kuò)增并測(cè)序成功的數(shù)量
不同瘧疾流行區(qū)Pvmsp142基因多態(tài)性滑動(dòng)窗口圖
中緬邊境、泰國(guó)和柬埔寨分離株P(guān)vmsp142基因序列中性檢驗(yàn)A:Pvmsp1基因序列Tajima’sD檢驗(yàn)的滑動(dòng)窗口分析圖;B:Pvmsp1基因序列Fu&Li’sD*
本文編號(hào):3222602
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